Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GFQ5

Protein Details
Accession C1GFQ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
212-260VEQPMSKIAKRKQKAKEKMRARKQERKAHKQAIKRHKKAASKQNTHSNGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
218-253KIAKRKQKAKEKMRARKQERKAHKQAIKRHKKAASK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 10.833, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011082  Exosome-assoc_fac/DNA_repair  
IPR007146  Sas10/Utp3/C1D  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pbn:PADG_06091  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04000  Sas10_Utp3  
Amino Acid Sequences METADLIPLLEQLEDDIDDLEEALEPFLGQSLSSTTQKMPVLDKAKLHVLVTYAIESILFGYLRLQGVNAKEHPVFKELTRVRQYFEKLKAAETVPEKRTTSIDKEAAGRFIKHGLTGNDKYDLERAERVAKEKAMALLKAAKLARQQASQSPAQPLPQCQPQAQPQAQPQAQPVARNPASIEREKPSGMSSKSETTEDQGNEQPVKSPSPVEQPMSKIAKRKQKAKEKMRARKQERKAHKQAIKRHKKAASKQNTHSNG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.08
4 0.07
5 0.07
6 0.07
7 0.07
8 0.07
9 0.07
10 0.06
11 0.06
12 0.05
13 0.05
14 0.06
15 0.06
16 0.05
17 0.05
18 0.09
19 0.13
20 0.15
21 0.17
22 0.17
23 0.22
24 0.24
25 0.25
26 0.25
27 0.29
28 0.33
29 0.35
30 0.36
31 0.34
32 0.37
33 0.36
34 0.33
35 0.26
36 0.22
37 0.21
38 0.2
39 0.18
40 0.13
41 0.11
42 0.11
43 0.09
44 0.08
45 0.08
46 0.06
47 0.05
48 0.06
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.11
54 0.13
55 0.18
56 0.18
57 0.2
58 0.21
59 0.23
60 0.24
61 0.24
62 0.23
63 0.18
64 0.28
65 0.26
66 0.34
67 0.39
68 0.38
69 0.38
70 0.42
71 0.46
72 0.44
73 0.46
74 0.44
75 0.37
76 0.37
77 0.38
78 0.33
79 0.33
80 0.31
81 0.33
82 0.28
83 0.32
84 0.31
85 0.29
86 0.31
87 0.3
88 0.31
89 0.3
90 0.29
91 0.26
92 0.29
93 0.29
94 0.31
95 0.28
96 0.23
97 0.18
98 0.18
99 0.17
100 0.14
101 0.17
102 0.14
103 0.2
104 0.22
105 0.23
106 0.23
107 0.23
108 0.22
109 0.21
110 0.2
111 0.15
112 0.14
113 0.14
114 0.17
115 0.17
116 0.19
117 0.19
118 0.18
119 0.17
120 0.17
121 0.19
122 0.15
123 0.15
124 0.13
125 0.15
126 0.15
127 0.19
128 0.18
129 0.16
130 0.17
131 0.22
132 0.23
133 0.21
134 0.22
135 0.22
136 0.26
137 0.26
138 0.26
139 0.25
140 0.23
141 0.25
142 0.25
143 0.23
144 0.23
145 0.27
146 0.27
147 0.24
148 0.27
149 0.3
150 0.37
151 0.37
152 0.37
153 0.35
154 0.42
155 0.42
156 0.39
157 0.34
158 0.33
159 0.32
160 0.3
161 0.28
162 0.29
163 0.29
164 0.28
165 0.28
166 0.28
167 0.32
168 0.32
169 0.34
170 0.28
171 0.3
172 0.3
173 0.29
174 0.24
175 0.26
176 0.25
177 0.25
178 0.25
179 0.27
180 0.29
181 0.3
182 0.28
183 0.24
184 0.29
185 0.26
186 0.26
187 0.25
188 0.27
189 0.27
190 0.26
191 0.28
192 0.23
193 0.25
194 0.22
195 0.21
196 0.2
197 0.27
198 0.31
199 0.31
200 0.32
201 0.33
202 0.4
203 0.45
204 0.45
205 0.45
206 0.49
207 0.56
208 0.6
209 0.66
210 0.68
211 0.73
212 0.81
213 0.83
214 0.86
215 0.87
216 0.91
217 0.92
218 0.93
219 0.91
220 0.91
221 0.91
222 0.91
223 0.91
224 0.9
225 0.9
226 0.89
227 0.87
228 0.85
229 0.86
230 0.87
231 0.87
232 0.83
233 0.82
234 0.8
235 0.82
236 0.84
237 0.84
238 0.84
239 0.82
240 0.84