Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VIA9

Protein Details
Accession A0A1D2VIA9    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
552-581KQSFQFPSPVKKTKKKKFINPIIKRKQKLAHydrophilic
653-678NKNNSLNPSIKKNKNRHDFKLKNEYDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
560-579PVKKTKKKKFINPIIKRKQK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 4.5, cyto_mito 3.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
Amino Acid Sequences MRFPTDWGVLNMDYGTPYLFGFSTEDYVDYSIFLTDLRSVWAETLTNEQLTQKAKQIGFPISSNNDIYVIVNLLKNSLLNKNQNSYYHSEFLIINDSNLNKIPNEISLILKPKSEPDFRWNFDCKILSNIDSIEFLRVFQFNNFSIINILKMQIFSLVNQLKQKDNTIQFLNDIVLELNGQSKLQNWSLNLNKFDYNLWCSTILYNDFKNYTNQYSTNTNSTTNTTNDSNSTSNLNNTPYIWDIIKETASTYDLWNFSGLYNEDCKLSKYKDSNFMDLNLSMNLQLGNHTNFDINPNNNINNIKNINQNNNNNNNNNNNNKNKNKNSNNNNNNSNNNNNNSNNVTENNNPISQNNIKSDTNKNNSKSDTNINSFPNIPSDPLNDNYSTDSDEDTLDDPFNDNLSSQFKNIKNINLPNLQKLPNLPKLPSYSELPRNCNILTNPDYSLQKYKQILSPKKRRKIDPLSSDPNHNPNHNPNPNQNQNHHHNDDNTHNTNDSTLSTNNTNNTINTDSIKPKRLPTPITSTKNIKLSPIDNLSLSFSEYDIDSPRKKQSFQFPSPVKKTKKKKFINPIIKRKQKLANQKFTNQIDEFLKIQNPNSSSIENVIANIKSNANSSPSTSTDTDTDPDTIENHSSLNFNIAKNNNANTNKINKNNSLNPSIKKNKNRHDFKLKNEYDNYTTTEKLPIPNGVKNQHFSDDDKKTNEDKNNTQLLPQPIKRAQTILARKRRANIPYSGEIKSARYG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.12
3 0.09
4 0.08
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.11
9 0.12
10 0.14
11 0.14
12 0.15
13 0.14
14 0.15
15 0.14
16 0.12
17 0.11
18 0.09
19 0.08
20 0.08
21 0.08
22 0.09
23 0.1
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.13
28 0.15
29 0.15
30 0.14
31 0.2
32 0.2
33 0.2
34 0.2
35 0.2
36 0.23
37 0.26
38 0.27
39 0.27
40 0.33
41 0.33
42 0.36
43 0.4
44 0.41
45 0.41
46 0.4
47 0.39
48 0.35
49 0.38
50 0.35
51 0.3
52 0.25
53 0.23
54 0.22
55 0.17
56 0.15
57 0.13
58 0.14
59 0.13
60 0.13
61 0.13
62 0.14
63 0.16
64 0.21
65 0.27
66 0.33
67 0.38
68 0.43
69 0.47
70 0.49
71 0.51
72 0.49
73 0.48
74 0.42
75 0.38
76 0.35
77 0.3
78 0.28
79 0.3
80 0.24
81 0.19
82 0.2
83 0.2
84 0.2
85 0.21
86 0.21
87 0.14
88 0.16
89 0.17
90 0.15
91 0.18
92 0.18
93 0.19
94 0.23
95 0.29
96 0.28
97 0.28
98 0.27
99 0.29
100 0.34
101 0.37
102 0.36
103 0.39
104 0.47
105 0.49
106 0.56
107 0.54
108 0.5
109 0.49
110 0.47
111 0.39
112 0.35
113 0.35
114 0.29
115 0.26
116 0.24
117 0.2
118 0.2
119 0.19
120 0.17
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.14
125 0.15
126 0.15
127 0.18
128 0.16
129 0.19
130 0.19
131 0.17
132 0.18
133 0.17
134 0.17
135 0.14
136 0.14
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.13
141 0.13
142 0.12
143 0.2
144 0.22
145 0.24
146 0.29
147 0.31
148 0.31
149 0.33
150 0.36
151 0.35
152 0.37
153 0.38
154 0.37
155 0.36
156 0.32
157 0.31
158 0.27
159 0.19
160 0.15
161 0.11
162 0.08
163 0.07
164 0.06
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.1
170 0.14
171 0.17
172 0.19
173 0.18
174 0.26
175 0.33
176 0.38
177 0.38
178 0.36
179 0.34
180 0.32
181 0.33
182 0.29
183 0.26
184 0.22
185 0.22
186 0.2
187 0.2
188 0.19
189 0.21
190 0.21
191 0.2
192 0.2
193 0.2
194 0.21
195 0.22
196 0.25
197 0.25
198 0.25
199 0.25
200 0.25
201 0.26
202 0.29
203 0.31
204 0.32
205 0.29
206 0.27
207 0.25
208 0.27
209 0.26
210 0.23
211 0.24
212 0.21
213 0.2
214 0.2
215 0.22
216 0.21
217 0.19
218 0.2
219 0.17
220 0.19
221 0.2
222 0.2
223 0.18
224 0.17
225 0.18
226 0.16
227 0.17
228 0.15
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.14
233 0.12
234 0.11
235 0.1
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.13
240 0.13
241 0.14
242 0.13
243 0.13
244 0.12
245 0.14
246 0.13
247 0.11
248 0.13
249 0.13
250 0.14
251 0.14
252 0.16
253 0.17
254 0.19
255 0.23
256 0.27
257 0.32
258 0.4
259 0.43
260 0.45
261 0.42
262 0.42
263 0.37
264 0.31
265 0.28
266 0.18
267 0.15
268 0.11
269 0.1
270 0.08
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.09
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.14
280 0.18
281 0.16
282 0.19
283 0.21
284 0.21
285 0.23
286 0.25
287 0.22
288 0.22
289 0.24
290 0.22
291 0.26
292 0.29
293 0.34
294 0.4
295 0.46
296 0.48
297 0.55
298 0.57
299 0.52
300 0.53
301 0.51
302 0.49
303 0.48
304 0.48
305 0.47
306 0.5
307 0.56
308 0.61
309 0.63
310 0.67
311 0.7
312 0.73
313 0.75
314 0.78
315 0.79
316 0.76
317 0.76
318 0.69
319 0.64
320 0.58
321 0.53
322 0.47
323 0.41
324 0.4
325 0.33
326 0.32
327 0.3
328 0.27
329 0.23
330 0.2
331 0.21
332 0.17
333 0.2
334 0.2
335 0.2
336 0.19
337 0.17
338 0.21
339 0.21
340 0.23
341 0.22
342 0.23
343 0.23
344 0.26
345 0.33
346 0.36
347 0.4
348 0.44
349 0.44
350 0.44
351 0.45
352 0.43
353 0.39
354 0.38
355 0.36
356 0.32
357 0.33
358 0.3
359 0.29
360 0.29
361 0.26
362 0.22
363 0.17
364 0.14
365 0.12
366 0.14
367 0.15
368 0.16
369 0.17
370 0.15
371 0.16
372 0.16
373 0.15
374 0.13
375 0.12
376 0.1
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.08
381 0.09
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.07
390 0.11
391 0.11
392 0.12
393 0.19
394 0.2
395 0.26
396 0.28
397 0.3
398 0.32
399 0.34
400 0.38
401 0.38
402 0.38
403 0.36
404 0.38
405 0.35
406 0.3
407 0.3
408 0.32
409 0.32
410 0.33
411 0.3
412 0.29
413 0.31
414 0.33
415 0.32
416 0.29
417 0.28
418 0.35
419 0.38
420 0.39
421 0.37
422 0.37
423 0.35
424 0.34
425 0.29
426 0.27
427 0.26
428 0.24
429 0.24
430 0.24
431 0.25
432 0.24
433 0.29
434 0.24
435 0.27
436 0.27
437 0.28
438 0.29
439 0.38
440 0.46
441 0.5
442 0.61
443 0.65
444 0.72
445 0.77
446 0.77
447 0.77
448 0.78
449 0.77
450 0.76
451 0.74
452 0.73
453 0.68
454 0.69
455 0.61
456 0.57
457 0.5
458 0.42
459 0.37
460 0.37
461 0.46
462 0.47
463 0.49
464 0.49
465 0.56
466 0.63
467 0.64
468 0.61
469 0.58
470 0.59
471 0.63
472 0.58
473 0.52
474 0.45
475 0.43
476 0.45
477 0.45
478 0.41
479 0.34
480 0.32
481 0.29
482 0.27
483 0.25
484 0.19
485 0.15
486 0.12
487 0.14
488 0.16
489 0.18
490 0.18
491 0.2
492 0.2
493 0.17
494 0.2
495 0.2
496 0.18
497 0.19
498 0.21
499 0.26
500 0.3
501 0.36
502 0.34
503 0.36
504 0.42
505 0.45
506 0.46
507 0.43
508 0.49
509 0.52
510 0.56
511 0.57
512 0.56
513 0.54
514 0.56
515 0.51
516 0.44
517 0.37
518 0.33
519 0.35
520 0.33
521 0.3
522 0.24
523 0.24
524 0.24
525 0.2
526 0.19
527 0.13
528 0.1
529 0.09
530 0.09
531 0.1
532 0.12
533 0.16
534 0.18
535 0.22
536 0.3
537 0.32
538 0.34
539 0.39
540 0.46
541 0.51
542 0.54
543 0.61
544 0.6
545 0.67
546 0.73
547 0.77
548 0.75
549 0.74
550 0.8
551 0.8
552 0.83
553 0.83
554 0.85
555 0.87
556 0.89
557 0.91
558 0.91
559 0.92
560 0.92
561 0.92
562 0.83
563 0.79
564 0.77
565 0.74
566 0.74
567 0.74
568 0.74
569 0.71
570 0.74
571 0.76
572 0.69
573 0.68
574 0.56
575 0.5
576 0.41
577 0.38
578 0.33
579 0.27
580 0.29
581 0.24
582 0.25
583 0.26
584 0.25
585 0.27
586 0.29
587 0.27
588 0.24
589 0.24
590 0.25
591 0.2
592 0.19
593 0.18
594 0.16
595 0.17
596 0.18
597 0.17
598 0.15
599 0.16
600 0.17
601 0.17
602 0.18
603 0.19
604 0.22
605 0.22
606 0.26
607 0.26
608 0.27
609 0.25
610 0.26
611 0.24
612 0.22
613 0.21
614 0.17
615 0.16
616 0.15
617 0.15
618 0.15
619 0.14
620 0.13
621 0.13
622 0.13
623 0.12
624 0.18
625 0.19
626 0.18
627 0.25
628 0.26
629 0.3
630 0.33
631 0.35
632 0.38
633 0.38
634 0.41
635 0.39
636 0.46
637 0.49
638 0.53
639 0.57
640 0.54
641 0.59
642 0.64
643 0.64
644 0.63
645 0.61
646 0.57
647 0.62
648 0.66
649 0.67
650 0.69
651 0.74
652 0.76
653 0.81
654 0.86
655 0.85
656 0.87
657 0.84
658 0.84
659 0.85
660 0.79
661 0.76
662 0.71
663 0.67
664 0.59
665 0.55
666 0.5
667 0.42
668 0.39
669 0.33
670 0.34
671 0.31
672 0.3
673 0.3
674 0.34
675 0.35
676 0.4
677 0.45
678 0.47
679 0.5
680 0.51
681 0.51
682 0.48
683 0.46
684 0.45
685 0.48
686 0.49
687 0.5
688 0.5
689 0.51
690 0.51
691 0.57
692 0.61
693 0.59
694 0.58
695 0.6
696 0.65
697 0.6
698 0.58
699 0.56
700 0.57
701 0.58
702 0.55
703 0.55
704 0.51
705 0.55
706 0.54
707 0.5
708 0.46
709 0.47
710 0.54
711 0.56
712 0.61
713 0.65
714 0.67
715 0.72
716 0.75
717 0.71
718 0.66
719 0.63
720 0.61
721 0.61
722 0.62
723 0.57
724 0.52
725 0.47