Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VRM6

Protein Details
Accession A0A1D2VRM6    Localization Confidence High Confidence Score 26.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
220-251RFLPNFRKKNVARKKPKKTKKRKAEGGNESSIBasic
268-291GEYFLKPREKKMRKINEIKEKQAEHydrophilic
308-373EEEKYEPASKKKRSEREKNEEKSEKKEKKEKKEKKEKKEKKEKSEKKEKKEKKEKKEKKEKKEKKMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
226-243RKKNVARKKPKKTKKRKA
273-301KPREKKMRKINEIKEKQAEVKEANKRKRE
313-373EPASKKKRSEREKNEEKSEKKEKKEKKEKKEKKEKKEKSEKKEKKEKKEKKEKKEKKEKKM
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041174  KH_8  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR024166  rRNA_assembly_KRR1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17903  KH_8  
CDD cd22393  KH-I_KRR1_rpt1  
cd22394  KH-I_KRR1_rpt2  
Amino Acid Sequences MPSTHNKDKPWDTPDIDKWAIEEFKPEDGSGSFLEQSSFTVFFPNYRSNYLRQVWGELTKVLKTKFLDCELNLVEGSMTVQTTLKTYDPAIILKARDLIKLLARSVPLPQAIKILQDDISCDIIKINSFVNSKERFVKRRQRLVGPQGNTLKALELLTNCYILVQGNTVSCMGPYTGLKTLRRVVEDCMNNVHPIYSIKELMIRKELSKKPELANESWDRFLPNFRKKNVARKKPKKTKKRKAEGGNESSIFPPAQTPRKIDLEIESGEYFLKPREKKMRKINEIKEKQAEVKEANKRKRELDFVAPEEEKYEPASKKKRSEREKNEEKSEKKEKKEKKEKKEKKEKKEKSEKKEKKEKKEKKEKKEKKEKKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.61
3 0.55
4 0.47
5 0.43
6 0.41
7 0.39
8 0.31
9 0.3
10 0.24
11 0.27
12 0.29
13 0.27
14 0.23
15 0.21
16 0.24
17 0.19
18 0.2
19 0.16
20 0.15
21 0.16
22 0.14
23 0.15
24 0.16
25 0.15
26 0.12
27 0.16
28 0.15
29 0.17
30 0.22
31 0.27
32 0.27
33 0.32
34 0.35
35 0.35
36 0.43
37 0.44
38 0.45
39 0.39
40 0.41
41 0.38
42 0.38
43 0.36
44 0.3
45 0.29
46 0.26
47 0.3
48 0.26
49 0.28
50 0.27
51 0.31
52 0.33
53 0.36
54 0.37
55 0.33
56 0.39
57 0.35
58 0.34
59 0.29
60 0.23
61 0.18
62 0.13
63 0.14
64 0.08
65 0.07
66 0.06
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.14
75 0.15
76 0.16
77 0.17
78 0.18
79 0.18
80 0.18
81 0.23
82 0.2
83 0.19
84 0.2
85 0.19
86 0.21
87 0.23
88 0.24
89 0.21
90 0.21
91 0.21
92 0.21
93 0.22
94 0.2
95 0.19
96 0.18
97 0.19
98 0.19
99 0.2
100 0.19
101 0.17
102 0.16
103 0.15
104 0.15
105 0.14
106 0.16
107 0.14
108 0.13
109 0.12
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.12
115 0.13
116 0.15
117 0.22
118 0.23
119 0.25
120 0.33
121 0.38
122 0.38
123 0.47
124 0.56
125 0.58
126 0.66
127 0.69
128 0.68
129 0.7
130 0.75
131 0.74
132 0.65
133 0.63
134 0.56
135 0.52
136 0.44
137 0.36
138 0.26
139 0.19
140 0.17
141 0.11
142 0.08
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.05
152 0.06
153 0.05
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.08
163 0.12
164 0.16
165 0.17
166 0.19
167 0.23
168 0.24
169 0.26
170 0.24
171 0.23
172 0.26
173 0.27
174 0.25
175 0.24
176 0.23
177 0.21
178 0.2
179 0.17
180 0.11
181 0.11
182 0.12
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.16
187 0.16
188 0.17
189 0.21
190 0.19
191 0.2
192 0.29
193 0.32
194 0.31
195 0.35
196 0.37
197 0.34
198 0.39
199 0.41
200 0.33
201 0.37
202 0.37
203 0.35
204 0.32
205 0.3
206 0.26
207 0.22
208 0.28
209 0.3
210 0.35
211 0.39
212 0.4
213 0.49
214 0.51
215 0.62
216 0.66
217 0.68
218 0.7
219 0.74
220 0.84
221 0.86
222 0.93
223 0.93
224 0.94
225 0.94
226 0.94
227 0.94
228 0.92
229 0.91
230 0.92
231 0.9
232 0.85
233 0.79
234 0.68
235 0.58
236 0.49
237 0.4
238 0.29
239 0.19
240 0.17
241 0.17
242 0.24
243 0.25
244 0.29
245 0.33
246 0.37
247 0.37
248 0.35
249 0.32
250 0.29
251 0.27
252 0.26
253 0.21
254 0.17
255 0.17
256 0.16
257 0.14
258 0.13
259 0.2
260 0.18
261 0.27
262 0.38
263 0.45
264 0.54
265 0.65
266 0.72
267 0.75
268 0.84
269 0.85
270 0.85
271 0.85
272 0.82
273 0.77
274 0.69
275 0.64
276 0.57
277 0.51
278 0.43
279 0.46
280 0.49
281 0.53
282 0.59
283 0.61
284 0.61
285 0.62
286 0.63
287 0.61
288 0.57
289 0.57
290 0.55
291 0.51
292 0.54
293 0.5
294 0.44
295 0.39
296 0.34
297 0.25
298 0.21
299 0.25
300 0.23
301 0.32
302 0.42
303 0.48
304 0.58
305 0.67
306 0.74
307 0.78
308 0.85
309 0.86
310 0.88
311 0.91
312 0.89
313 0.89
314 0.88
315 0.82
316 0.8
317 0.8
318 0.78
319 0.76
320 0.79
321 0.78
322 0.8
323 0.87
324 0.89
325 0.89
326 0.92
327 0.93
328 0.94
329 0.96
330 0.95
331 0.95
332 0.96
333 0.95
334 0.95
335 0.96
336 0.94
337 0.94
338 0.95
339 0.93
340 0.93
341 0.94
342 0.92
343 0.92
344 0.93
345 0.93
346 0.93
347 0.94
348 0.94
349 0.94
350 0.96
351 0.95
352 0.95
353 0.96