Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VPC6

Protein Details
Accession A0A1D2VPC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
792-817LNLDTIKQRNKPKEPPKKSEKAPFFLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
801-809NKPKEPPKK
Subcellular Location(s) nucl 17, pero 4, mito 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011047  Quinoprotein_ADH-like_supfam  
IPR007319  SSU_processome_Utp21  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
Gene Ontology GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04192  Utp21  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MNDSAVASNVSVKKRKTDSSVSPSSTSASKIFSPYRSIGNITNNVPFAIGTLGKTYYIVTSVGNFFQVYDALTLNLLFVSKTFLPSKITNIYCHYHYIFVTYQNKINIYKRGSLIISLDSKLDSNYPINNLLTFGDYLIVSNSNNQISLFKKPVSIDQNDEIIKNNTNFQDLLKLPIKFYNTINLSNANSDDLIVKIIHPSTYLNKLIIATTSHILIYNIKTINLIFKSNLNSIFSRTEQDTSQRNKNYLGAISTVENSTVLDIILIATNLGNLIFYDFRKDKVLKIIKTYSRKSGPSNLTPITSLAFRSDSFPHLLIAFKNGNLSVFDLNSFQQIYLLQSVHKQSFGGISNVKFLNGQPIFITNGADNQLKEYIFDPSFSSNNEKAINDSSLVPLPRLLRSRAGHSAPPTSILFTAHQSHFILSASTDNSFWSFSLRKDSQNQKLSFKQSKKNKKIMNINNSNNSNDHNNEIISMDYQILKEDDWDNILTAHKNQNFANTWSFKNKKIGNFKLQSSDNSNINTVKISSCGNFAFLGTANGNIDVYNLQSGILRKKFKLHKNSVTGIIIDSMNNKMCSTSLDGYIGFYNFRNSKYLSKINLESPITKIVYNPISELLGLALDDLSIIIIDFETKRIIRQLFGHTNRITSLDFSPDGRWIVSSSLDSTLRVWDLPTGNCIDGFKISNIITNLKFSPNGDFLATSHVNGNGISLWNNKSQFKMISVRHVSEKDFKLIDVPNNTSAGGLGIIDSAFDNDNQDNDDSLNSYSTVDQISKDLLTLSIGPRSKFNTLLNLDTIKQRNKPKEPPKKSEKAPFFLYETEDKSQNITSNGKSEKIEKLVSTENQNSDNNNNNSEKIPSLTNPERPLKFFNNENTLAFESKFTKTLRECSVLDDYTIFLDLISTSSPSSLDLEIKSLNTKDSSLSEIKLFVKAMIHGLNSNKNFELYQALINLLLKNHGDLISSSLNDEQELESLLDELNRINNEKTNRIDELIRVSASIVNFFQT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.55
3 0.55
4 0.59
5 0.62
6 0.65
7 0.72
8 0.68
9 0.63
10 0.58
11 0.53
12 0.45
13 0.38
14 0.3
15 0.25
16 0.23
17 0.27
18 0.31
19 0.32
20 0.36
21 0.36
22 0.39
23 0.38
24 0.39
25 0.38
26 0.42
27 0.44
28 0.41
29 0.43
30 0.38
31 0.35
32 0.32
33 0.26
34 0.19
35 0.17
36 0.15
37 0.12
38 0.14
39 0.14
40 0.14
41 0.15
42 0.15
43 0.12
44 0.13
45 0.12
46 0.1
47 0.13
48 0.16
49 0.16
50 0.17
51 0.16
52 0.14
53 0.14
54 0.14
55 0.12
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.06
65 0.06
66 0.11
67 0.12
68 0.16
69 0.18
70 0.2
71 0.25
72 0.27
73 0.33
74 0.36
75 0.37
76 0.37
77 0.39
78 0.42
79 0.38
80 0.42
81 0.37
82 0.31
83 0.29
84 0.3
85 0.27
86 0.32
87 0.36
88 0.33
89 0.36
90 0.37
91 0.4
92 0.4
93 0.44
94 0.43
95 0.42
96 0.45
97 0.42
98 0.43
99 0.41
100 0.37
101 0.34
102 0.31
103 0.3
104 0.24
105 0.23
106 0.2
107 0.19
108 0.18
109 0.18
110 0.15
111 0.15
112 0.18
113 0.2
114 0.23
115 0.23
116 0.22
117 0.22
118 0.2
119 0.19
120 0.16
121 0.13
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.09
128 0.12
129 0.15
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.18
134 0.19
135 0.25
136 0.26
137 0.24
138 0.27
139 0.27
140 0.35
141 0.39
142 0.4
143 0.39
144 0.38
145 0.43
146 0.4
147 0.4
148 0.35
149 0.3
150 0.31
151 0.26
152 0.29
153 0.24
154 0.25
155 0.25
156 0.22
157 0.27
158 0.23
159 0.29
160 0.3
161 0.29
162 0.28
163 0.32
164 0.35
165 0.3
166 0.3
167 0.32
168 0.3
169 0.32
170 0.32
171 0.32
172 0.3
173 0.29
174 0.29
175 0.21
176 0.17
177 0.15
178 0.14
179 0.11
180 0.11
181 0.1
182 0.09
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.13
188 0.16
189 0.22
190 0.23
191 0.21
192 0.22
193 0.22
194 0.22
195 0.2
196 0.18
197 0.14
198 0.13
199 0.13
200 0.12
201 0.12
202 0.13
203 0.14
204 0.14
205 0.18
206 0.18
207 0.17
208 0.18
209 0.17
210 0.23
211 0.22
212 0.22
213 0.17
214 0.2
215 0.24
216 0.27
217 0.28
218 0.25
219 0.24
220 0.26
221 0.28
222 0.26
223 0.25
224 0.24
225 0.24
226 0.22
227 0.27
228 0.32
229 0.35
230 0.43
231 0.43
232 0.43
233 0.43
234 0.44
235 0.41
236 0.35
237 0.3
238 0.22
239 0.2
240 0.19
241 0.19
242 0.16
243 0.13
244 0.11
245 0.1
246 0.08
247 0.07
248 0.06
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.03
261 0.05
262 0.07
263 0.07
264 0.14
265 0.15
266 0.17
267 0.23
268 0.24
269 0.24
270 0.33
271 0.42
272 0.37
273 0.43
274 0.5
275 0.53
276 0.6
277 0.61
278 0.59
279 0.56
280 0.57
281 0.54
282 0.55
283 0.54
284 0.5
285 0.53
286 0.46
287 0.41
288 0.39
289 0.35
290 0.27
291 0.21
292 0.16
293 0.12
294 0.12
295 0.11
296 0.14
297 0.15
298 0.16
299 0.18
300 0.18
301 0.16
302 0.16
303 0.17
304 0.14
305 0.17
306 0.16
307 0.13
308 0.14
309 0.13
310 0.13
311 0.13
312 0.15
313 0.11
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.1
324 0.11
325 0.11
326 0.1
327 0.13
328 0.17
329 0.17
330 0.17
331 0.15
332 0.13
333 0.17
334 0.18
335 0.18
336 0.17
337 0.17
338 0.21
339 0.21
340 0.21
341 0.17
342 0.15
343 0.22
344 0.19
345 0.19
346 0.15
347 0.17
348 0.18
349 0.18
350 0.19
351 0.09
352 0.1
353 0.13
354 0.14
355 0.12
356 0.12
357 0.14
358 0.13
359 0.14
360 0.13
361 0.15
362 0.14
363 0.15
364 0.15
365 0.15
366 0.16
367 0.17
368 0.22
369 0.18
370 0.21
371 0.22
372 0.21
373 0.2
374 0.22
375 0.21
376 0.16
377 0.16
378 0.14
379 0.15
380 0.15
381 0.13
382 0.13
383 0.14
384 0.17
385 0.19
386 0.19
387 0.24
388 0.25
389 0.3
390 0.33
391 0.34
392 0.33
393 0.32
394 0.34
395 0.27
396 0.28
397 0.24
398 0.19
399 0.17
400 0.16
401 0.14
402 0.14
403 0.18
404 0.15
405 0.17
406 0.16
407 0.16
408 0.15
409 0.14
410 0.12
411 0.08
412 0.09
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.09
419 0.08
420 0.1
421 0.11
422 0.11
423 0.19
424 0.21
425 0.23
426 0.31
427 0.39
428 0.45
429 0.52
430 0.54
431 0.51
432 0.54
433 0.59
434 0.6
435 0.58
436 0.57
437 0.59
438 0.68
439 0.71
440 0.75
441 0.71
442 0.71
443 0.75
444 0.76
445 0.76
446 0.75
447 0.7
448 0.68
449 0.65
450 0.58
451 0.48
452 0.41
453 0.33
454 0.24
455 0.21
456 0.15
457 0.13
458 0.12
459 0.12
460 0.11
461 0.08
462 0.08
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.06
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.09
477 0.08
478 0.1
479 0.16
480 0.17
481 0.19
482 0.19
483 0.23
484 0.24
485 0.26
486 0.29
487 0.25
488 0.25
489 0.31
490 0.34
491 0.31
492 0.36
493 0.37
494 0.39
495 0.47
496 0.51
497 0.52
498 0.53
499 0.52
500 0.5
501 0.48
502 0.42
503 0.38
504 0.35
505 0.28
506 0.25
507 0.25
508 0.2
509 0.19
510 0.18
511 0.13
512 0.1
513 0.09
514 0.09
515 0.08
516 0.1
517 0.1
518 0.1
519 0.1
520 0.09
521 0.09
522 0.08
523 0.09
524 0.07
525 0.08
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.06
530 0.06
531 0.05
532 0.05
533 0.05
534 0.04
535 0.05
536 0.06
537 0.08
538 0.14
539 0.19
540 0.22
541 0.22
542 0.3
543 0.38
544 0.45
545 0.54
546 0.57
547 0.6
548 0.63
549 0.65
550 0.61
551 0.53
552 0.45
553 0.34
554 0.27
555 0.18
556 0.13
557 0.11
558 0.1
559 0.11
560 0.11
561 0.1
562 0.09
563 0.09
564 0.1
565 0.14
566 0.14
567 0.13
568 0.14
569 0.14
570 0.15
571 0.15
572 0.14
573 0.1
574 0.08
575 0.12
576 0.13
577 0.14
578 0.15
579 0.16
580 0.2
581 0.26
582 0.31
583 0.3
584 0.32
585 0.34
586 0.34
587 0.37
588 0.35
589 0.3
590 0.26
591 0.27
592 0.23
593 0.21
594 0.19
595 0.18
596 0.19
597 0.18
598 0.17
599 0.14
600 0.13
601 0.13
602 0.12
603 0.08
604 0.06
605 0.05
606 0.04
607 0.03
608 0.03
609 0.03
610 0.02
611 0.02
612 0.02
613 0.02
614 0.02
615 0.02
616 0.03
617 0.04
618 0.05
619 0.07
620 0.07
621 0.08
622 0.13
623 0.14
624 0.15
625 0.19
626 0.26
627 0.34
628 0.38
629 0.44
630 0.39
631 0.39
632 0.38
633 0.36
634 0.28
635 0.21
636 0.18
637 0.15
638 0.15
639 0.16
640 0.16
641 0.16
642 0.16
643 0.14
644 0.13
645 0.11
646 0.11
647 0.11
648 0.1
649 0.1
650 0.12
651 0.13
652 0.13
653 0.13
654 0.13
655 0.12
656 0.12
657 0.11
658 0.11
659 0.14
660 0.14
661 0.15
662 0.15
663 0.15
664 0.16
665 0.16
666 0.13
667 0.12
668 0.13
669 0.11
670 0.12
671 0.12
672 0.15
673 0.16
674 0.19
675 0.18
676 0.19
677 0.2
678 0.18
679 0.19
680 0.17
681 0.2
682 0.18
683 0.18
684 0.16
685 0.15
686 0.14
687 0.2
688 0.2
689 0.16
690 0.16
691 0.15
692 0.15
693 0.14
694 0.14
695 0.08
696 0.08
697 0.09
698 0.11
699 0.13
700 0.18
701 0.21
702 0.21
703 0.22
704 0.24
705 0.24
706 0.25
707 0.31
708 0.28
709 0.35
710 0.38
711 0.39
712 0.41
713 0.41
714 0.4
715 0.4
716 0.4
717 0.35
718 0.31
719 0.29
720 0.29
721 0.3
722 0.32
723 0.29
724 0.3
725 0.28
726 0.28
727 0.28
728 0.23
729 0.2
730 0.15
731 0.1
732 0.07
733 0.05
734 0.04
735 0.04
736 0.05
737 0.05
738 0.05
739 0.06
740 0.06
741 0.08
742 0.08
743 0.09
744 0.11
745 0.11
746 0.11
747 0.11
748 0.11
749 0.1
750 0.1
751 0.11
752 0.09
753 0.1
754 0.09
755 0.1
756 0.11
757 0.1
758 0.1
759 0.1
760 0.12
761 0.11
762 0.11
763 0.1
764 0.09
765 0.09
766 0.11
767 0.11
768 0.16
769 0.19
770 0.19
771 0.21
772 0.25
773 0.26
774 0.28
775 0.28
776 0.31
777 0.31
778 0.33
779 0.34
780 0.32
781 0.31
782 0.34
783 0.38
784 0.35
785 0.39
786 0.46
787 0.53
788 0.59
789 0.69
790 0.73
791 0.78
792 0.83
793 0.85
794 0.86
795 0.86
796 0.85
797 0.84
798 0.81
799 0.75
800 0.71
801 0.64
802 0.57
803 0.5
804 0.46
805 0.4
806 0.37
807 0.34
808 0.31
809 0.28
810 0.27
811 0.27
812 0.26
813 0.26
814 0.25
815 0.24
816 0.29
817 0.31
818 0.32
819 0.31
820 0.32
821 0.34
822 0.34
823 0.35
824 0.28
825 0.31
826 0.34
827 0.36
828 0.39
829 0.39
830 0.37
831 0.39
832 0.4
833 0.38
834 0.37
835 0.43
836 0.39
837 0.39
838 0.38
839 0.35
840 0.35
841 0.34
842 0.31
843 0.23
844 0.24
845 0.2
846 0.27
847 0.31
848 0.37
849 0.41
850 0.48
851 0.49
852 0.49
853 0.54
854 0.52
855 0.51
856 0.5
857 0.51
858 0.5
859 0.5
860 0.48
861 0.45
862 0.41
863 0.38
864 0.33
865 0.28
866 0.24
867 0.24
868 0.28
869 0.24
870 0.28
871 0.3
872 0.37
873 0.4
874 0.41
875 0.4
876 0.41
877 0.47
878 0.4
879 0.37
880 0.3
881 0.25
882 0.2
883 0.21
884 0.15
885 0.08
886 0.08
887 0.07
888 0.08
889 0.08
890 0.08
891 0.07
892 0.08
893 0.08
894 0.09
895 0.11
896 0.12
897 0.15
898 0.14
899 0.17
900 0.18
901 0.19
902 0.22
903 0.2
904 0.21
905 0.2
906 0.2
907 0.2
908 0.2
909 0.25
910 0.24
911 0.25
912 0.23
913 0.26
914 0.27
915 0.27
916 0.26
917 0.21
918 0.2
919 0.19
920 0.22
921 0.21
922 0.21
923 0.22
924 0.26
925 0.33
926 0.33
927 0.36
928 0.32
929 0.31
930 0.3
931 0.27
932 0.28
933 0.21
934 0.22
935 0.19
936 0.19
937 0.19
938 0.21
939 0.21
940 0.16
941 0.17
942 0.14
943 0.14
944 0.16
945 0.15
946 0.15
947 0.14
948 0.19
949 0.2
950 0.2
951 0.21
952 0.21
953 0.2
954 0.19
955 0.2
956 0.16
957 0.12
958 0.14
959 0.13
960 0.1
961 0.11
962 0.11
963 0.1
964 0.1
965 0.1
966 0.13
967 0.15
968 0.18
969 0.2
970 0.26
971 0.31
972 0.37
973 0.41
974 0.42
975 0.42
976 0.43
977 0.43
978 0.39
979 0.41
980 0.39
981 0.33
982 0.28
983 0.26
984 0.26
985 0.24
986 0.24