Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VJI3

Protein Details
Accession A0A1D2VJI3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
431-456EEMERKSKSKSKSRSKMKRKSGSISKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
428-452KEKEEMERKSKSKSKSRSKMKRKSG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.833, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022712  Beta_Casp  
IPR027075  CPSF2  
IPR025069  Cpsf2_C  
IPR001279  Metallo-B-lactamas  
IPR036866  RibonucZ/Hydroxyglut_hydro  
Gene Ontology GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF10996  Beta-Casp  
PF13299  CPSF100_C  
PF16661  Lactamase_B_6  
Amino Acid Sequences DASLNILCDPGWDCKTDLTYLEDILPSINVILLSHPTFQCIGAYAILYKNNSLLSRIPVYSTFPISTIGRVETIERYRSAGLVGPIFGAPLEINDIETSFDSILLLKHHQSINLNINNFTIVLTPLNAGHTLGGINWLLNYSGEKYIYAPEWNHSRDSYLEGANLISQENLFKPSVFITSTNVGSSLSYKKRVNKFLELIDATLHNGGSAILPVSLGSRLLELVHIVDVHLRSLPFIPVLLISKTGTRALTYAGKMLEWMSPSVIKEWTTNNGNNSGGNNGGNGNNNNSNSNSGNNKNSVPFDASRVELADAVELPKYIGPKVVFCVGQDIEVGSESHSAFIQLCNDHRTTIILTERPQRNTLGYDLYSKWELLCKQKNDGKVIDGIPVPYESSFKTLQVVEEKLNGNELKNYFEILNSRRKAEVEMKEKEEMERKSKSKSKSRSKMKRKSGSISKEDGDNTNGDNDIDEDEDEDDDDDDNDKDGIGEDKKRGKIKIRLNEENDESSKKMLEKERNKMLIDRNVLRIVSSRKKVFPFEIEKMKYDDYGEIFNLDEIVKKDANNGNSGLNGNAIFKGVVNDKSGKNGRNHDDGGNKMNEKNSNNHNHNHNYNYNHNNDNEGDEMIEFDSEFEPKKQILNRVGIIARCGLTFIDLSGHVDLRSLRVILQNIKPKKIILMKDLTYERNDELVKNTLISINKSSQVKTFEVIESFDNTDISIDKIFNNFEVKLDDELIKKLKWQKITGGVSIAHLYGQVSDKPEDESASRQLSKNRDKSVKRIELKNVNSSSLLELSNIKNNPLAIGDIKLSELKKILIEKYESLNYKIEFKGEGVLVINENVSIKKFSEGDVVIDGRPNKLYYEVREIVCGLLAYV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.27
3 0.27
4 0.26
5 0.25
6 0.25
7 0.24
8 0.25
9 0.22
10 0.19
11 0.18
12 0.16
13 0.11
14 0.09
15 0.09
16 0.07
17 0.07
18 0.08
19 0.12
20 0.14
21 0.19
22 0.19
23 0.2
24 0.21
25 0.21
26 0.2
27 0.17
28 0.17
29 0.13
30 0.14
31 0.14
32 0.16
33 0.2
34 0.2
35 0.19
36 0.19
37 0.22
38 0.21
39 0.22
40 0.22
41 0.24
42 0.28
43 0.28
44 0.28
45 0.26
46 0.31
47 0.31
48 0.33
49 0.28
50 0.23
51 0.26
52 0.25
53 0.25
54 0.22
55 0.2
56 0.17
57 0.17
58 0.19
59 0.23
60 0.27
61 0.28
62 0.27
63 0.28
64 0.28
65 0.27
66 0.26
67 0.23
68 0.21
69 0.19
70 0.18
71 0.16
72 0.16
73 0.15
74 0.14
75 0.11
76 0.08
77 0.07
78 0.1
79 0.09
80 0.1
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.13
86 0.1
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.12
92 0.14
93 0.14
94 0.2
95 0.21
96 0.24
97 0.26
98 0.31
99 0.38
100 0.4
101 0.4
102 0.36
103 0.35
104 0.33
105 0.3
106 0.23
107 0.15
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.12
114 0.11
115 0.11
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.1
128 0.1
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.14
133 0.17
134 0.18
135 0.21
136 0.19
137 0.21
138 0.28
139 0.3
140 0.31
141 0.29
142 0.29
143 0.26
144 0.29
145 0.27
146 0.21
147 0.2
148 0.17
149 0.17
150 0.16
151 0.15
152 0.11
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.1
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.13
162 0.16
163 0.15
164 0.15
165 0.15
166 0.18
167 0.19
168 0.18
169 0.17
170 0.15
171 0.14
172 0.17
173 0.21
174 0.22
175 0.28
176 0.33
177 0.41
178 0.49
179 0.58
180 0.61
181 0.61
182 0.61
183 0.57
184 0.6
185 0.52
186 0.44
187 0.37
188 0.31
189 0.23
190 0.2
191 0.16
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.11
221 0.12
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.12
231 0.13
232 0.15
233 0.14
234 0.12
235 0.12
236 0.14
237 0.18
238 0.17
239 0.19
240 0.17
241 0.16
242 0.16
243 0.17
244 0.16
245 0.12
246 0.12
247 0.1
248 0.12
249 0.12
250 0.14
251 0.14
252 0.13
253 0.14
254 0.16
255 0.2
256 0.24
257 0.26
258 0.26
259 0.27
260 0.27
261 0.26
262 0.24
263 0.2
264 0.16
265 0.14
266 0.12
267 0.11
268 0.12
269 0.14
270 0.14
271 0.16
272 0.19
273 0.2
274 0.21
275 0.21
276 0.22
277 0.2
278 0.23
279 0.24
280 0.24
281 0.26
282 0.27
283 0.28
284 0.27
285 0.27
286 0.26
287 0.24
288 0.21
289 0.22
290 0.21
291 0.2
292 0.18
293 0.18
294 0.16
295 0.13
296 0.12
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.08
305 0.07
306 0.11
307 0.11
308 0.12
309 0.14
310 0.17
311 0.16
312 0.15
313 0.19
314 0.15
315 0.15
316 0.14
317 0.12
318 0.09
319 0.1
320 0.1
321 0.06
322 0.08
323 0.07
324 0.08
325 0.07
326 0.08
327 0.07
328 0.08
329 0.1
330 0.1
331 0.11
332 0.14
333 0.15
334 0.14
335 0.14
336 0.15
337 0.13
338 0.15
339 0.17
340 0.15
341 0.18
342 0.26
343 0.31
344 0.32
345 0.33
346 0.3
347 0.29
348 0.28
349 0.27
350 0.22
351 0.18
352 0.19
353 0.18
354 0.19
355 0.18
356 0.17
357 0.15
358 0.15
359 0.17
360 0.23
361 0.29
362 0.29
363 0.36
364 0.39
365 0.43
366 0.43
367 0.41
368 0.34
369 0.3
370 0.29
371 0.24
372 0.21
373 0.17
374 0.14
375 0.13
376 0.12
377 0.09
378 0.09
379 0.07
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.12
384 0.12
385 0.13
386 0.15
387 0.17
388 0.14
389 0.17
390 0.18
391 0.16
392 0.19
393 0.17
394 0.14
395 0.16
396 0.16
397 0.15
398 0.14
399 0.15
400 0.12
401 0.12
402 0.16
403 0.16
404 0.24
405 0.23
406 0.24
407 0.24
408 0.24
409 0.27
410 0.31
411 0.36
412 0.35
413 0.38
414 0.39
415 0.4
416 0.4
417 0.38
418 0.36
419 0.31
420 0.28
421 0.31
422 0.3
423 0.35
424 0.41
425 0.46
426 0.49
427 0.57
428 0.63
429 0.66
430 0.76
431 0.8
432 0.86
433 0.89
434 0.9
435 0.89
436 0.82
437 0.8
438 0.78
439 0.75
440 0.69
441 0.62
442 0.52
443 0.45
444 0.41
445 0.34
446 0.26
447 0.19
448 0.15
449 0.12
450 0.12
451 0.09
452 0.08
453 0.07
454 0.07
455 0.06
456 0.06
457 0.05
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.05
467 0.06
468 0.06
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.08
473 0.09
474 0.12
475 0.16
476 0.22
477 0.27
478 0.3
479 0.33
480 0.38
481 0.44
482 0.51
483 0.56
484 0.58
485 0.62
486 0.63
487 0.64
488 0.58
489 0.53
490 0.46
491 0.38
492 0.3
493 0.23
494 0.2
495 0.17
496 0.19
497 0.23
498 0.32
499 0.38
500 0.45
501 0.52
502 0.55
503 0.55
504 0.54
505 0.53
506 0.5
507 0.48
508 0.43
509 0.38
510 0.35
511 0.34
512 0.3
513 0.28
514 0.28
515 0.3
516 0.33
517 0.33
518 0.35
519 0.38
520 0.41
521 0.39
522 0.4
523 0.4
524 0.4
525 0.46
526 0.43
527 0.42
528 0.42
529 0.4
530 0.33
531 0.27
532 0.24
533 0.16
534 0.16
535 0.14
536 0.12
537 0.11
538 0.1
539 0.1
540 0.08
541 0.09
542 0.09
543 0.12
544 0.12
545 0.12
546 0.18
547 0.21
548 0.23
549 0.23
550 0.23
551 0.2
552 0.2
553 0.21
554 0.15
555 0.12
556 0.11
557 0.1
558 0.08
559 0.08
560 0.07
561 0.07
562 0.09
563 0.11
564 0.12
565 0.14
566 0.18
567 0.18
568 0.25
569 0.3
570 0.32
571 0.35
572 0.41
573 0.43
574 0.44
575 0.46
576 0.43
577 0.43
578 0.41
579 0.41
580 0.37
581 0.34
582 0.3
583 0.32
584 0.33
585 0.31
586 0.34
587 0.37
588 0.43
589 0.46
590 0.49
591 0.52
592 0.53
593 0.54
594 0.55
595 0.51
596 0.46
597 0.5
598 0.51
599 0.48
600 0.45
601 0.42
602 0.39
603 0.34
604 0.31
605 0.25
606 0.19
607 0.15
608 0.12
609 0.12
610 0.09
611 0.08
612 0.06
613 0.06
614 0.06
615 0.07
616 0.09
617 0.09
618 0.11
619 0.12
620 0.17
621 0.2
622 0.27
623 0.32
624 0.36
625 0.36
626 0.38
627 0.4
628 0.36
629 0.33
630 0.27
631 0.21
632 0.16
633 0.15
634 0.11
635 0.09
636 0.09
637 0.08
638 0.08
639 0.08
640 0.1
641 0.1
642 0.11
643 0.1
644 0.11
645 0.11
646 0.11
647 0.12
648 0.11
649 0.11
650 0.14
651 0.18
652 0.22
653 0.29
654 0.37
655 0.4
656 0.43
657 0.42
658 0.39
659 0.42
660 0.44
661 0.41
662 0.38
663 0.41
664 0.39
665 0.45
666 0.48
667 0.43
668 0.38
669 0.36
670 0.3
671 0.27
672 0.27
673 0.22
674 0.22
675 0.24
676 0.23
677 0.21
678 0.2
679 0.2
680 0.21
681 0.23
682 0.24
683 0.22
684 0.27
685 0.28
686 0.29
687 0.29
688 0.32
689 0.31
690 0.28
691 0.28
692 0.25
693 0.24
694 0.25
695 0.22
696 0.2
697 0.2
698 0.19
699 0.15
700 0.13
701 0.13
702 0.12
703 0.12
704 0.1
705 0.1
706 0.1
707 0.12
708 0.13
709 0.14
710 0.17
711 0.16
712 0.16
713 0.17
714 0.18
715 0.18
716 0.2
717 0.21
718 0.19
719 0.23
720 0.25
721 0.23
722 0.27
723 0.34
724 0.37
725 0.4
726 0.42
727 0.45
728 0.51
729 0.56
730 0.51
731 0.46
732 0.41
733 0.37
734 0.35
735 0.28
736 0.17
737 0.13
738 0.12
739 0.1
740 0.12
741 0.13
742 0.15
743 0.16
744 0.17
745 0.2
746 0.2
747 0.2
748 0.2
749 0.22
750 0.24
751 0.29
752 0.32
753 0.32
754 0.38
755 0.46
756 0.54
757 0.58
758 0.62
759 0.66
760 0.67
761 0.74
762 0.79
763 0.79
764 0.76
765 0.75
766 0.76
767 0.76
768 0.77
769 0.76
770 0.67
771 0.59
772 0.52
773 0.46
774 0.39
775 0.31
776 0.26
777 0.18
778 0.2
779 0.21
780 0.28
781 0.27
782 0.25
783 0.25
784 0.24
785 0.24
786 0.21
787 0.21
788 0.14
789 0.16
790 0.16
791 0.15
792 0.16
793 0.19
794 0.18
795 0.18
796 0.18
797 0.17
798 0.2
799 0.25
800 0.27
801 0.29
802 0.32
803 0.33
804 0.37
805 0.44
806 0.42
807 0.4
808 0.42
809 0.37
810 0.39
811 0.37
812 0.33
813 0.27
814 0.25
815 0.27
816 0.22
817 0.22
818 0.18
819 0.18
820 0.18
821 0.17
822 0.16
823 0.12
824 0.13
825 0.12
826 0.12
827 0.13
828 0.13
829 0.17
830 0.17
831 0.18
832 0.24
833 0.24
834 0.25
835 0.27
836 0.28
837 0.25
838 0.29
839 0.29
840 0.24
841 0.25
842 0.24
843 0.2
844 0.25
845 0.3
846 0.31
847 0.4
848 0.43
849 0.41
850 0.42
851 0.42
852 0.35
853 0.31