Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VDI4

Protein Details
Accession A0A1D2VDI4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
289-313NVWKDLIPKKTTKNKPKGDLPSWIKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 6, cyto 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR006224  PsdUridine_synth_RluA-like_CS  
IPR006145  PsdUridine_synth_RsuA/RluA  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF00849  PseudoU_synth_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01129  PSI_RLU  
CDD cd02869  PseudoU_synth_RluA_like  
Amino Acid Sequences MSLPTKFSTFIPILYDCKNYLIVNKPPFLYSQPPDTSNAYFKRHKRFFDPGIQTRDQFKDFVLNEKCLIPLLYHQHFLGNFEDSDSFQNINDKDLMLKELQPINRLDYNVSGALIISKNNITTSKFNRNLVKGGNSGHLIKRKYIAAVEIIDKNFDSSSLRHLKFLNPQNTLGLIDLPIDNKPSSTKFKILNSNCMILELLTGRKHQIRKHLNYINYNILGDKKYSLPLSYKNNYSIYNQKFNSANLLSAHHISPPFPQQIALHSAFSLTQVGLTQVKTYAPLIWNFDNVWKDLIPKKTTKNKPKGDLPSWIKQELNEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.32
3 0.26
4 0.27
5 0.28
6 0.24
7 0.27
8 0.32
9 0.37
10 0.41
11 0.43
12 0.42
13 0.4
14 0.42
15 0.4
16 0.4
17 0.35
18 0.37
19 0.38
20 0.39
21 0.41
22 0.43
23 0.41
24 0.41
25 0.44
26 0.42
27 0.46
28 0.52
29 0.59
30 0.62
31 0.64
32 0.63
33 0.66
34 0.66
35 0.69
36 0.71
37 0.68
38 0.7
39 0.67
40 0.62
41 0.59
42 0.56
43 0.47
44 0.38
45 0.3
46 0.3
47 0.29
48 0.36
49 0.34
50 0.32
51 0.32
52 0.32
53 0.31
54 0.23
55 0.23
56 0.14
57 0.16
58 0.22
59 0.23
60 0.24
61 0.24
62 0.26
63 0.26
64 0.27
65 0.23
66 0.18
67 0.15
68 0.15
69 0.16
70 0.14
71 0.16
72 0.16
73 0.14
74 0.12
75 0.18
76 0.17
77 0.18
78 0.17
79 0.15
80 0.14
81 0.14
82 0.16
83 0.12
84 0.13
85 0.16
86 0.2
87 0.21
88 0.23
89 0.23
90 0.26
91 0.27
92 0.26
93 0.22
94 0.19
95 0.2
96 0.17
97 0.16
98 0.12
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.11
108 0.12
109 0.17
110 0.24
111 0.33
112 0.36
113 0.4
114 0.44
115 0.45
116 0.44
117 0.41
118 0.38
119 0.3
120 0.27
121 0.25
122 0.22
123 0.22
124 0.22
125 0.25
126 0.23
127 0.22
128 0.23
129 0.21
130 0.21
131 0.19
132 0.16
133 0.13
134 0.14
135 0.15
136 0.16
137 0.15
138 0.14
139 0.14
140 0.13
141 0.11
142 0.1
143 0.09
144 0.07
145 0.14
146 0.22
147 0.22
148 0.24
149 0.25
150 0.27
151 0.34
152 0.42
153 0.42
154 0.35
155 0.35
156 0.34
157 0.34
158 0.32
159 0.23
160 0.15
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.1
170 0.13
171 0.19
172 0.21
173 0.25
174 0.28
175 0.33
176 0.43
177 0.43
178 0.48
179 0.44
180 0.44
181 0.39
182 0.35
183 0.3
184 0.2
185 0.19
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.11
190 0.13
191 0.18
192 0.22
193 0.24
194 0.33
195 0.41
196 0.46
197 0.55
198 0.6
199 0.61
200 0.62
201 0.63
202 0.57
203 0.48
204 0.41
205 0.32
206 0.28
207 0.23
208 0.19
209 0.17
210 0.13
211 0.15
212 0.15
213 0.16
214 0.17
215 0.23
216 0.31
217 0.34
218 0.35
219 0.36
220 0.38
221 0.38
222 0.39
223 0.42
224 0.4
225 0.44
226 0.42
227 0.42
228 0.41
229 0.4
230 0.42
231 0.33
232 0.3
233 0.22
234 0.24
235 0.22
236 0.23
237 0.22
238 0.18
239 0.18
240 0.16
241 0.19
242 0.22
243 0.23
244 0.21
245 0.22
246 0.2
247 0.24
248 0.3
249 0.28
250 0.23
251 0.2
252 0.2
253 0.18
254 0.19
255 0.16
256 0.09
257 0.08
258 0.07
259 0.1
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.12
265 0.13
266 0.14
267 0.16
268 0.17
269 0.2
270 0.25
271 0.25
272 0.27
273 0.26
274 0.31
275 0.28
276 0.26
277 0.26
278 0.21
279 0.24
280 0.29
281 0.36
282 0.37
283 0.41
284 0.5
285 0.58
286 0.69
287 0.75
288 0.79
289 0.81
290 0.84
291 0.87
292 0.87
293 0.82
294 0.82
295 0.78
296 0.77
297 0.72
298 0.67
299 0.58