Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VM93

Protein Details
Accession A0A1D2VM93    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-60LINNLKKKLKTFPQKKINKKIPSDDSHydrophilic
73-94LNSFQRRRSSRHDNKPFFKKNLHydrophilic
221-240QSSIKQKPKLNNKNLSSNKPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12, cyto 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031456  Caf20  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005845  C:mRNA cap binding complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0017148  P:negative regulation of translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17052  CAF20  
Amino Acid Sequences MIRYTIDQLYEIRLASIDFKLDSNNQEILSNFNELINNLKKKLKTFPQKKINKKIPSDDSNDFIDHPIPPSNLNSFQRRRSSRHDNKPFFKKNLLQNNTFIINNHPHPHPHPHPHPHPNNNPHPHNNSNDSNKIDTPNSTDLSESDSIHNQNHPSHPNHNNYHIQNQTQNHNHNHNYNHNHNHNHQKVDSQGWVTLKNRKKSFGNNLTNNDERDKFRKDFQSSIKQKPKLNNKNLSSNKPADLADAIAEKPSLKFNAFSALGDDEDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.16
4 0.13
5 0.12
6 0.13
7 0.16
8 0.19
9 0.21
10 0.23
11 0.24
12 0.23
13 0.23
14 0.23
15 0.24
16 0.22
17 0.22
18 0.18
19 0.17
20 0.17
21 0.15
22 0.22
23 0.27
24 0.29
25 0.3
26 0.35
27 0.36
28 0.39
29 0.48
30 0.51
31 0.54
32 0.61
33 0.68
34 0.73
35 0.81
36 0.88
37 0.9
38 0.9
39 0.87
40 0.83
41 0.82
42 0.8
43 0.76
44 0.73
45 0.64
46 0.57
47 0.5
48 0.45
49 0.36
50 0.29
51 0.24
52 0.17
53 0.17
54 0.17
55 0.15
56 0.15
57 0.17
58 0.2
59 0.26
60 0.3
61 0.37
62 0.38
63 0.45
64 0.53
65 0.56
66 0.57
67 0.59
68 0.66
69 0.68
70 0.74
71 0.78
72 0.78
73 0.81
74 0.86
75 0.85
76 0.77
77 0.73
78 0.68
79 0.66
80 0.68
81 0.65
82 0.56
83 0.51
84 0.5
85 0.45
86 0.39
87 0.3
88 0.23
89 0.22
90 0.23
91 0.24
92 0.22
93 0.22
94 0.25
95 0.33
96 0.35
97 0.4
98 0.45
99 0.5
100 0.58
101 0.66
102 0.71
103 0.71
104 0.74
105 0.73
106 0.75
107 0.74
108 0.71
109 0.66
110 0.64
111 0.59
112 0.54
113 0.51
114 0.46
115 0.43
116 0.42
117 0.39
118 0.35
119 0.32
120 0.3
121 0.25
122 0.21
123 0.2
124 0.19
125 0.19
126 0.17
127 0.16
128 0.14
129 0.18
130 0.19
131 0.15
132 0.13
133 0.14
134 0.15
135 0.16
136 0.18
137 0.15
138 0.16
139 0.2
140 0.23
141 0.24
142 0.31
143 0.36
144 0.42
145 0.43
146 0.46
147 0.49
148 0.47
149 0.5
150 0.45
151 0.4
152 0.39
153 0.38
154 0.4
155 0.39
156 0.43
157 0.41
158 0.44
159 0.45
160 0.44
161 0.47
162 0.47
163 0.48
164 0.5
165 0.54
166 0.53
167 0.55
168 0.56
169 0.62
170 0.58
171 0.55
172 0.49
173 0.43
174 0.4
175 0.39
176 0.35
177 0.26
178 0.25
179 0.22
180 0.26
181 0.26
182 0.33
183 0.37
184 0.43
185 0.44
186 0.46
187 0.5
188 0.54
189 0.63
190 0.65
191 0.67
192 0.66
193 0.69
194 0.71
195 0.69
196 0.62
197 0.55
198 0.48
199 0.42
200 0.4
201 0.41
202 0.37
203 0.41
204 0.49
205 0.49
206 0.53
207 0.57
208 0.63
209 0.64
210 0.73
211 0.75
212 0.72
213 0.72
214 0.74
215 0.77
216 0.77
217 0.79
218 0.78
219 0.74
220 0.79
221 0.81
222 0.79
223 0.75
224 0.68
225 0.6
226 0.53
227 0.47
228 0.39
229 0.32
230 0.26
231 0.2
232 0.18
233 0.16
234 0.14
235 0.14
236 0.13
237 0.13
238 0.16
239 0.17
240 0.17
241 0.18
242 0.18
243 0.26
244 0.26
245 0.25
246 0.24
247 0.23