Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VGW1

Protein Details
Accession A0A1D2VGW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
478-502NDITAMVKKRKIKPKTKNLKKKAKHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
485-502KKRKIKPKTKNLKKKAKH
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MLSVPPDLLASDNISHEINELIIEGNKFYSLKDYEQSVSKYSEACSLFGDQTSSKQYKETLYLYGKSLFSLAISKSQILGGSNNNDLTKQTSRKEDLNQNSDSDRNITNSKHLTISKEQMPQKLDHQKASKIQDSNKNNGNQNFHFDETVAEEEIDNSDNSDNSDNDLESEAGSFDEVSSREDPSVSFKEDEENYLTKTNENLKRITLTANDQKQSFSTGDISDDDSNNIENDFELAWDVLDLSRVLFETEFEELKKVDRHNNLEKVEILKKISEIYNLLGEVSLENENFKQSTADFLKSLDYLIIMNDIIKEYKISQIDYKLLSEIHYKLSLSYEFNFEDSENKSKSIENMQKAVNYVNLTYKRLLSLKNLLNDKLNETPINDNLKGEIYSIDMDIKDQVSLIEELKERLNDLLHDPTQAFKEQQMALIKGLLGQSTKKESPADINNAHHNIVDQIPKEENVSKPEINEVFVPTMINDITAMVKKRKIKPKTKNLKKKAKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.15
4 0.14
5 0.11
6 0.09
7 0.09
8 0.08
9 0.11
10 0.11
11 0.11
12 0.11
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.18
17 0.19
18 0.22
19 0.24
20 0.27
21 0.29
22 0.35
23 0.37
24 0.33
25 0.33
26 0.31
27 0.29
28 0.27
29 0.31
30 0.26
31 0.24
32 0.24
33 0.24
34 0.24
35 0.23
36 0.25
37 0.18
38 0.21
39 0.28
40 0.28
41 0.25
42 0.26
43 0.28
44 0.29
45 0.34
46 0.32
47 0.32
48 0.35
49 0.37
50 0.37
51 0.39
52 0.35
53 0.3
54 0.28
55 0.2
56 0.16
57 0.17
58 0.16
59 0.17
60 0.19
61 0.19
62 0.19
63 0.2
64 0.2
65 0.18
66 0.19
67 0.18
68 0.2
69 0.22
70 0.24
71 0.23
72 0.22
73 0.22
74 0.25
75 0.27
76 0.3
77 0.32
78 0.37
79 0.41
80 0.46
81 0.53
82 0.57
83 0.59
84 0.59
85 0.57
86 0.51
87 0.5
88 0.46
89 0.39
90 0.32
91 0.24
92 0.22
93 0.24
94 0.22
95 0.27
96 0.29
97 0.29
98 0.31
99 0.31
100 0.33
101 0.35
102 0.4
103 0.4
104 0.45
105 0.47
106 0.47
107 0.48
108 0.45
109 0.48
110 0.52
111 0.49
112 0.48
113 0.49
114 0.49
115 0.53
116 0.57
117 0.55
118 0.5
119 0.53
120 0.56
121 0.57
122 0.58
123 0.58
124 0.57
125 0.57
126 0.57
127 0.56
128 0.48
129 0.48
130 0.45
131 0.4
132 0.34
133 0.28
134 0.24
135 0.2
136 0.2
137 0.15
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.11
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.11
149 0.1
150 0.11
151 0.12
152 0.11
153 0.12
154 0.13
155 0.11
156 0.09
157 0.09
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.04
163 0.06
164 0.07
165 0.1
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.16
172 0.19
173 0.18
174 0.18
175 0.17
176 0.22
177 0.22
178 0.24
179 0.21
180 0.19
181 0.19
182 0.21
183 0.21
184 0.17
185 0.19
186 0.26
187 0.28
188 0.3
189 0.29
190 0.27
191 0.28
192 0.29
193 0.28
194 0.21
195 0.21
196 0.27
197 0.3
198 0.31
199 0.3
200 0.29
201 0.28
202 0.28
203 0.23
204 0.16
205 0.13
206 0.11
207 0.12
208 0.13
209 0.15
210 0.13
211 0.13
212 0.12
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.09
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.03
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.1
243 0.13
244 0.14
245 0.19
246 0.24
247 0.31
248 0.38
249 0.44
250 0.43
251 0.41
252 0.4
253 0.37
254 0.35
255 0.3
256 0.23
257 0.17
258 0.16
259 0.17
260 0.16
261 0.14
262 0.12
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.08
268 0.08
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.13
281 0.15
282 0.16
283 0.16
284 0.16
285 0.17
286 0.17
287 0.17
288 0.1
289 0.08
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.12
302 0.13
303 0.14
304 0.16
305 0.18
306 0.21
307 0.21
308 0.21
309 0.17
310 0.16
311 0.16
312 0.17
313 0.16
314 0.15
315 0.15
316 0.15
317 0.14
318 0.17
319 0.17
320 0.16
321 0.16
322 0.17
323 0.16
324 0.16
325 0.16
326 0.14
327 0.16
328 0.17
329 0.22
330 0.19
331 0.2
332 0.2
333 0.21
334 0.23
335 0.3
336 0.34
337 0.32
338 0.35
339 0.36
340 0.36
341 0.36
342 0.34
343 0.27
344 0.21
345 0.18
346 0.22
347 0.23
348 0.24
349 0.24
350 0.24
351 0.24
352 0.26
353 0.27
354 0.24
355 0.3
356 0.33
357 0.38
358 0.4
359 0.39
360 0.4
361 0.4
362 0.39
363 0.34
364 0.32
365 0.26
366 0.25
367 0.27
368 0.29
369 0.34
370 0.3
371 0.26
372 0.25
373 0.25
374 0.23
375 0.21
376 0.15
377 0.1
378 0.11
379 0.11
380 0.12
381 0.1
382 0.11
383 0.12
384 0.11
385 0.1
386 0.09
387 0.08
388 0.09
389 0.11
390 0.11
391 0.13
392 0.14
393 0.15
394 0.18
395 0.18
396 0.16
397 0.16
398 0.17
399 0.14
400 0.17
401 0.23
402 0.21
403 0.23
404 0.22
405 0.23
406 0.24
407 0.25
408 0.22
409 0.16
410 0.22
411 0.2
412 0.26
413 0.28
414 0.27
415 0.26
416 0.26
417 0.24
418 0.21
419 0.21
420 0.17
421 0.13
422 0.14
423 0.17
424 0.23
425 0.25
426 0.25
427 0.26
428 0.27
429 0.34
430 0.4
431 0.44
432 0.41
433 0.44
434 0.49
435 0.5
436 0.49
437 0.41
438 0.33
439 0.28
440 0.27
441 0.28
442 0.22
443 0.23
444 0.25
445 0.25
446 0.28
447 0.31
448 0.3
449 0.3
450 0.35
451 0.33
452 0.32
453 0.39
454 0.36
455 0.33
456 0.32
457 0.29
458 0.25
459 0.24
460 0.23
461 0.16
462 0.17
463 0.15
464 0.13
465 0.1
466 0.09
467 0.12
468 0.17
469 0.22
470 0.25
471 0.31
472 0.4
473 0.5
474 0.59
475 0.67
476 0.73
477 0.79
478 0.85
479 0.9
480 0.93
481 0.94
482 0.95