Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VG24

Protein Details
Accession A0A1D2VG24    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-29PRKVAPSPFAKKNKASKKTKNPLFEASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-21FAKKNKASKKT
243-255AKLAKRAKKAAEA
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9.833, mito 8.5, cyto_mito 7.333, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029064  L30e-like  
IPR001921  Ribosomal_L7A/L8  
IPR004038  Ribosomal_L7Ae/L30e/S12e/Gad45  
IPR018492  Ribosomal_L7Ae/L8/Nhp2  
Gene Ontology GO:0022625  C:cytosolic large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01248  Ribosomal_L7Ae  
Amino Acid Sequences MAPRKVAPSPFAKKNKASKKTKNPLFEASAKNFGIGQAIQPKRNLSRFVKWPEYVRLQRQKKILQIRLKVPPAITQFQSTLDKNTTIQAFKLLNKYRPETASEKKERLTKEAAGIAQGKTKFDVSSKPFVVKYGLNHVVSLIENKKAKLVLIANDVDPIELVIFLPALCKATGTSYAIVKNKSRLGQLVHKKNAAAVALTDVKEEDKPALAQLISTIDSTFAEKYEDNKRHWGGGIMGAKTQAKLAKRAKKAAEAAKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.8
3 0.8
4 0.83
5 0.84
6 0.86
7 0.9
8 0.9
9 0.88
10 0.82
11 0.79
12 0.75
13 0.72
14 0.67
15 0.61
16 0.6
17 0.51
18 0.46
19 0.39
20 0.32
21 0.28
22 0.2
23 0.2
24 0.23
25 0.27
26 0.29
27 0.31
28 0.36
29 0.39
30 0.44
31 0.47
32 0.43
33 0.48
34 0.54
35 0.6
36 0.63
37 0.59
38 0.59
39 0.58
40 0.62
41 0.6
42 0.61
43 0.64
44 0.63
45 0.66
46 0.69
47 0.67
48 0.66
49 0.69
50 0.68
51 0.66
52 0.66
53 0.67
54 0.68
55 0.66
56 0.59
57 0.49
58 0.47
59 0.43
60 0.4
61 0.35
62 0.29
63 0.26
64 0.28
65 0.32
66 0.26
67 0.24
68 0.22
69 0.22
70 0.2
71 0.22
72 0.21
73 0.18
74 0.17
75 0.19
76 0.19
77 0.21
78 0.29
79 0.3
80 0.34
81 0.37
82 0.4
83 0.39
84 0.38
85 0.4
86 0.37
87 0.4
88 0.44
89 0.46
90 0.45
91 0.45
92 0.48
93 0.45
94 0.43
95 0.4
96 0.31
97 0.29
98 0.29
99 0.26
100 0.23
101 0.24
102 0.2
103 0.2
104 0.19
105 0.16
106 0.14
107 0.14
108 0.12
109 0.12
110 0.18
111 0.18
112 0.24
113 0.24
114 0.26
115 0.25
116 0.25
117 0.27
118 0.21
119 0.19
120 0.2
121 0.24
122 0.22
123 0.22
124 0.21
125 0.2
126 0.19
127 0.2
128 0.14
129 0.14
130 0.15
131 0.15
132 0.16
133 0.16
134 0.15
135 0.16
136 0.17
137 0.15
138 0.18
139 0.19
140 0.18
141 0.18
142 0.18
143 0.14
144 0.12
145 0.09
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.07
159 0.1
160 0.11
161 0.13
162 0.14
163 0.19
164 0.22
165 0.25
166 0.25
167 0.27
168 0.29
169 0.3
170 0.3
171 0.28
172 0.3
173 0.37
174 0.46
175 0.51
176 0.51
177 0.51
178 0.49
179 0.47
180 0.44
181 0.34
182 0.25
183 0.15
184 0.15
185 0.17
186 0.17
187 0.16
188 0.14
189 0.15
190 0.15
191 0.15
192 0.12
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.13
197 0.12
198 0.11
199 0.11
200 0.13
201 0.12
202 0.12
203 0.11
204 0.09
205 0.1
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.16
212 0.26
213 0.32
214 0.33
215 0.42
216 0.43
217 0.43
218 0.43
219 0.41
220 0.33
221 0.36
222 0.37
223 0.3
224 0.29
225 0.29
226 0.29
227 0.26
228 0.28
229 0.24
230 0.21
231 0.3
232 0.39
233 0.46
234 0.53
235 0.62
236 0.63
237 0.67
238 0.73