Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2V8W3

Protein Details
Accession A0A1D2V8W3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
178-203VRLQHQGHSRERQKRTKERQELQILVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005378  Vps35  
IPR042491  Vps35_C  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0030906  C:retromer, cargo-selective complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF03635  Vps35  
Amino Acid Sequences MLNDSLTIIKQQTLLMKKCLDSKGKLMDALKHASTFLSELRTSALTPKHYYELYIVIYDALEYLSNYLKENHPNNHLSDLYELVQYAGNIVPRLYLMITVGTVYMSILNAPIKEIMKDMIEMCRGVQHPIRGLFLRYYLSQKTKDLLPDKSKVSENTSLEDSTEFIITNFIEMNKLWVRLQHQGHSRERQKRTKERQELQILVGSNLVRLSQLDGIDKFYYKNVILPRILEQIIQCRDLIAQEYLLDVVIQVFPDEFHLFTLDMLLKATLNLIPQVSLKKISISLMDRLANFIHREDGKLKNKESQKENGNETKTEIETKTEIETITENQNQNQNQKEKEKEKEEKIDNNQVDATEKEKEKENQFDLFQKFYSYIQKLDELRPDLSIDDITALLEKLCKLSLTYYPKNYKNIDTLLLHTLKRLDEFKDTREASSPITEQNLKNILLIPVDFVSIFEVHEQKSINLDLLLNLKNYTKLLESQSPKVQSFISQQFLDKILDYKMQLQNEDIVNCIFNLLSSIVNSNLSRNKKSKKSSSTSNSLLFALINQEKVAKILHLIYNKDPIENSKLLLVASKYLSKGGSKIKYTYSSLIFNFLKIIRRKITKYEKRINDYKREIKNIFKGLTKYINELYSFGSLELALKLLISVSNISNEIMMNEFTNEFFIKIFSIYEELINSKQQYQIITELISVLILYYKNFYVESKNDYDKENYDNLITKTVLYSVKLLKKPDQCRAVYFASHLWFQPNDFSSKSSKEKERGKEKESDSVNTENGENTENGANVGSVGSASITNNKRVMECLQKSLRISDSCIESSVSIELFIEILNQCIYYYIHGNLISAKYINDLIELIKNNLENVDIDELPVNHFKRTLNYISRQKLIDERFELIRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.39
3 0.41
4 0.42
5 0.49
6 0.54
7 0.53
8 0.48
9 0.52
10 0.55
11 0.54
12 0.57
13 0.52
14 0.51
15 0.5
16 0.51
17 0.45
18 0.36
19 0.34
20 0.29
21 0.27
22 0.22
23 0.19
24 0.19
25 0.17
26 0.17
27 0.2
28 0.2
29 0.2
30 0.24
31 0.27
32 0.27
33 0.31
34 0.34
35 0.36
36 0.35
37 0.36
38 0.32
39 0.31
40 0.27
41 0.24
42 0.21
43 0.17
44 0.16
45 0.15
46 0.12
47 0.08
48 0.07
49 0.06
50 0.08
51 0.11
52 0.12
53 0.14
54 0.17
55 0.21
56 0.29
57 0.36
58 0.4
59 0.44
60 0.47
61 0.48
62 0.5
63 0.46
64 0.39
65 0.34
66 0.3
67 0.24
68 0.22
69 0.19
70 0.15
71 0.15
72 0.13
73 0.13
74 0.12
75 0.13
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.11
80 0.12
81 0.11
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.07
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.14
99 0.14
100 0.15
101 0.16
102 0.15
103 0.15
104 0.16
105 0.17
106 0.17
107 0.18
108 0.18
109 0.17
110 0.21
111 0.21
112 0.24
113 0.26
114 0.25
115 0.3
116 0.32
117 0.35
118 0.3
119 0.32
120 0.29
121 0.27
122 0.27
123 0.23
124 0.26
125 0.29
126 0.33
127 0.34
128 0.34
129 0.35
130 0.36
131 0.42
132 0.43
133 0.45
134 0.46
135 0.49
136 0.5
137 0.51
138 0.51
139 0.46
140 0.47
141 0.46
142 0.41
143 0.39
144 0.38
145 0.34
146 0.31
147 0.28
148 0.23
149 0.16
150 0.14
151 0.11
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.15
161 0.15
162 0.18
163 0.17
164 0.2
165 0.23
166 0.3
167 0.34
168 0.36
169 0.41
170 0.47
171 0.55
172 0.61
173 0.67
174 0.68
175 0.74
176 0.76
177 0.79
178 0.82
179 0.86
180 0.87
181 0.88
182 0.85
183 0.86
184 0.85
185 0.77
186 0.68
187 0.61
188 0.5
189 0.4
190 0.35
191 0.25
192 0.17
193 0.14
194 0.12
195 0.08
196 0.08
197 0.1
198 0.1
199 0.12
200 0.14
201 0.15
202 0.18
203 0.19
204 0.2
205 0.18
206 0.16
207 0.18
208 0.15
209 0.19
210 0.2
211 0.24
212 0.24
213 0.25
214 0.27
215 0.29
216 0.29
217 0.26
218 0.23
219 0.26
220 0.27
221 0.27
222 0.23
223 0.19
224 0.19
225 0.18
226 0.2
227 0.12
228 0.1
229 0.09
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.08
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.12
249 0.1
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.1
262 0.12
263 0.13
264 0.14
265 0.13
266 0.13
267 0.14
268 0.14
269 0.17
270 0.18
271 0.19
272 0.21
273 0.23
274 0.22
275 0.22
276 0.22
277 0.2
278 0.18
279 0.16
280 0.17
281 0.15
282 0.18
283 0.2
284 0.29
285 0.36
286 0.4
287 0.41
288 0.44
289 0.5
290 0.55
291 0.55
292 0.53
293 0.52
294 0.52
295 0.57
296 0.56
297 0.52
298 0.46
299 0.43
300 0.38
301 0.31
302 0.29
303 0.24
304 0.19
305 0.18
306 0.18
307 0.18
308 0.16
309 0.15
310 0.12
311 0.13
312 0.13
313 0.17
314 0.21
315 0.2
316 0.21
317 0.27
318 0.29
319 0.32
320 0.36
321 0.36
322 0.35
323 0.41
324 0.47
325 0.47
326 0.52
327 0.57
328 0.58
329 0.59
330 0.64
331 0.63
332 0.63
333 0.63
334 0.65
335 0.56
336 0.5
337 0.44
338 0.35
339 0.31
340 0.24
341 0.2
342 0.16
343 0.16
344 0.16
345 0.21
346 0.25
347 0.28
348 0.33
349 0.33
350 0.31
351 0.32
352 0.38
353 0.35
354 0.32
355 0.28
356 0.22
357 0.21
358 0.19
359 0.25
360 0.19
361 0.19
362 0.19
363 0.23
364 0.25
365 0.27
366 0.29
367 0.25
368 0.24
369 0.23
370 0.22
371 0.18
372 0.16
373 0.13
374 0.09
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.04
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.08
388 0.15
389 0.23
390 0.27
391 0.33
392 0.4
393 0.43
394 0.47
395 0.47
396 0.43
397 0.37
398 0.35
399 0.31
400 0.26
401 0.25
402 0.24
403 0.24
404 0.22
405 0.19
406 0.19
407 0.16
408 0.17
409 0.16
410 0.14
411 0.19
412 0.2
413 0.22
414 0.28
415 0.28
416 0.27
417 0.28
418 0.27
419 0.21
420 0.22
421 0.2
422 0.13
423 0.15
424 0.18
425 0.15
426 0.18
427 0.2
428 0.18
429 0.17
430 0.17
431 0.15
432 0.12
433 0.12
434 0.09
435 0.07
436 0.07
437 0.06
438 0.05
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.08
444 0.08
445 0.1
446 0.1
447 0.09
448 0.11
449 0.11
450 0.1
451 0.09
452 0.08
453 0.08
454 0.11
455 0.12
456 0.1
457 0.11
458 0.11
459 0.11
460 0.11
461 0.11
462 0.09
463 0.1
464 0.14
465 0.2
466 0.23
467 0.26
468 0.31
469 0.33
470 0.32
471 0.3
472 0.27
473 0.22
474 0.25
475 0.25
476 0.24
477 0.22
478 0.22
479 0.22
480 0.23
481 0.21
482 0.16
483 0.13
484 0.11
485 0.12
486 0.13
487 0.18
488 0.2
489 0.21
490 0.21
491 0.2
492 0.22
493 0.22
494 0.21
495 0.15
496 0.12
497 0.11
498 0.1
499 0.1
500 0.06
501 0.04
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.06
506 0.07
507 0.07
508 0.09
509 0.09
510 0.11
511 0.17
512 0.21
513 0.25
514 0.32
515 0.39
516 0.45
517 0.53
518 0.59
519 0.62
520 0.63
521 0.69
522 0.68
523 0.68
524 0.64
525 0.58
526 0.5
527 0.41
528 0.36
529 0.26
530 0.19
531 0.17
532 0.14
533 0.12
534 0.11
535 0.11
536 0.11
537 0.12
538 0.12
539 0.07
540 0.07
541 0.1
542 0.13
543 0.16
544 0.19
545 0.19
546 0.27
547 0.27
548 0.26
549 0.24
550 0.23
551 0.25
552 0.23
553 0.22
554 0.16
555 0.16
556 0.15
557 0.17
558 0.15
559 0.11
560 0.12
561 0.14
562 0.13
563 0.13
564 0.14
565 0.13
566 0.17
567 0.23
568 0.27
569 0.27
570 0.29
571 0.31
572 0.34
573 0.36
574 0.36
575 0.3
576 0.29
577 0.27
578 0.31
579 0.28
580 0.24
581 0.24
582 0.22
583 0.27
584 0.26
585 0.31
586 0.3
587 0.36
588 0.38
589 0.46
590 0.55
591 0.57
592 0.64
593 0.69
594 0.72
595 0.73
596 0.8
597 0.77
598 0.75
599 0.75
600 0.74
601 0.7
602 0.7
603 0.65
604 0.63
605 0.64
606 0.6
607 0.53
608 0.48
609 0.43
610 0.39
611 0.44
612 0.39
613 0.35
614 0.31
615 0.31
616 0.28
617 0.27
618 0.25
619 0.19
620 0.18
621 0.14
622 0.12
623 0.1
624 0.1
625 0.09
626 0.07
627 0.06
628 0.05
629 0.05
630 0.05
631 0.05
632 0.05
633 0.06
634 0.07
635 0.08
636 0.09
637 0.09
638 0.09
639 0.09
640 0.09
641 0.09
642 0.08
643 0.07
644 0.08
645 0.08
646 0.08
647 0.1
648 0.1
649 0.09
650 0.08
651 0.09
652 0.08
653 0.08
654 0.08
655 0.07
656 0.09
657 0.09
658 0.1
659 0.11
660 0.12
661 0.13
662 0.16
663 0.16
664 0.16
665 0.18
666 0.19
667 0.19
668 0.2
669 0.21
670 0.19
671 0.18
672 0.17
673 0.14
674 0.13
675 0.11
676 0.08
677 0.05
678 0.06
679 0.06
680 0.06
681 0.08
682 0.08
683 0.09
684 0.1
685 0.11
686 0.15
687 0.18
688 0.24
689 0.27
690 0.32
691 0.33
692 0.35
693 0.37
694 0.34
695 0.36
696 0.32
697 0.28
698 0.25
699 0.28
700 0.27
701 0.27
702 0.24
703 0.2
704 0.18
705 0.21
706 0.2
707 0.16
708 0.19
709 0.24
710 0.32
711 0.36
712 0.39
713 0.43
714 0.52
715 0.57
716 0.62
717 0.63
718 0.57
719 0.56
720 0.58
721 0.53
722 0.45
723 0.4
724 0.35
725 0.29
726 0.29
727 0.25
728 0.23
729 0.2
730 0.2
731 0.24
732 0.22
733 0.23
734 0.23
735 0.25
736 0.26
737 0.32
738 0.38
739 0.4
740 0.46
741 0.51
742 0.59
743 0.67
744 0.73
745 0.75
746 0.72
747 0.74
748 0.69
749 0.69
750 0.64
751 0.58
752 0.51
753 0.47
754 0.43
755 0.35
756 0.32
757 0.25
758 0.22
759 0.21
760 0.16
761 0.15
762 0.15
763 0.14
764 0.14
765 0.13
766 0.11
767 0.09
768 0.09
769 0.07
770 0.05
771 0.05
772 0.05
773 0.06
774 0.07
775 0.15
776 0.18
777 0.22
778 0.25
779 0.26
780 0.26
781 0.29
782 0.34
783 0.36
784 0.36
785 0.41
786 0.44
787 0.47
788 0.48
789 0.49
790 0.5
791 0.41
792 0.41
793 0.37
794 0.37
795 0.33
796 0.33
797 0.3
798 0.23
799 0.23
800 0.21
801 0.16
802 0.11
803 0.1
804 0.09
805 0.08
806 0.08
807 0.1
808 0.08
809 0.1
810 0.1
811 0.1
812 0.09
813 0.11
814 0.12
815 0.11
816 0.14
817 0.14
818 0.18
819 0.18
820 0.19
821 0.21
822 0.22
823 0.21
824 0.18
825 0.17
826 0.15
827 0.17
828 0.17
829 0.14
830 0.13
831 0.13
832 0.18
833 0.2
834 0.2
835 0.21
836 0.21
837 0.21
838 0.21
839 0.2
840 0.15
841 0.16
842 0.19
843 0.16
844 0.16
845 0.19
846 0.19
847 0.22
848 0.28
849 0.26
850 0.23
851 0.25
852 0.26
853 0.29
854 0.35
855 0.41
856 0.42
857 0.51
858 0.59
859 0.63
860 0.66
861 0.62
862 0.58
863 0.58
864 0.55
865 0.53
866 0.47
867 0.45