Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VB08

Protein Details
Accession A0A1D2VB08    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
256-279IAAKNKQLREKQKLEKEKEKEEKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
260-282NKQLREKQKLEKEKEKEEKEKES
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046962  Atg3  
IPR007135  Atg3/Atg10  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0019776  F:Atg8 ligase activity  
GO:0006914  P:autophagy  
Pfam View protein in Pfam  
PF03987  Autophagy_act_C  
Amino Acid Sequences MFRSTLSSWREYLTPVSHKSTFKKTGEITPEEFVEAGDYLVFKFPTWQWSPASANKRKDFLPKDKQFLVTRHVPSYQRASTYLGMDNNEEDEEEIIGEDGWTATHISKLQKNKNDNNNSHDNQSKTTNKTTDNENSIDEIEDIEDIEDFDEEIDLNDDNNDNNFNNSNYSNKDRRNYDLYIGYSTSYKVPKMYLVGFDSNGIPLNPDQMFEDISGDYRDKTATIEKAPFLNDTTSVSIHPCRHATVMKVLMARAEIAAKNKQLREKQKLEKEKEKEEKEKESDKNIIKRVAKLGLMDSDDTGADIDDDEEWESIGKDIYDNQSEIIRVDQYLIIFLKFIASVTPGINHDYTMDAF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.41
4 0.45
5 0.49
6 0.53
7 0.58
8 0.6
9 0.55
10 0.58
11 0.55
12 0.58
13 0.6
14 0.6
15 0.53
16 0.47
17 0.45
18 0.38
19 0.35
20 0.26
21 0.19
22 0.14
23 0.1
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.1
28 0.11
29 0.09
30 0.13
31 0.14
32 0.22
33 0.26
34 0.29
35 0.28
36 0.34
37 0.39
38 0.44
39 0.53
40 0.53
41 0.58
42 0.59
43 0.59
44 0.57
45 0.62
46 0.62
47 0.63
48 0.65
49 0.64
50 0.66
51 0.67
52 0.7
53 0.65
54 0.6
55 0.56
56 0.53
57 0.49
58 0.45
59 0.47
60 0.42
61 0.41
62 0.45
63 0.42
64 0.35
65 0.33
66 0.34
67 0.31
68 0.32
69 0.32
70 0.26
71 0.24
72 0.23
73 0.22
74 0.19
75 0.17
76 0.14
77 0.1
78 0.09
79 0.08
80 0.07
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.04
86 0.04
87 0.03
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.07
92 0.1
93 0.15
94 0.2
95 0.3
96 0.37
97 0.44
98 0.53
99 0.6
100 0.67
101 0.73
102 0.72
103 0.69
104 0.7
105 0.64
106 0.59
107 0.55
108 0.46
109 0.39
110 0.42
111 0.42
112 0.37
113 0.41
114 0.4
115 0.38
116 0.39
117 0.42
118 0.41
119 0.39
120 0.36
121 0.31
122 0.29
123 0.26
124 0.25
125 0.18
126 0.12
127 0.09
128 0.07
129 0.06
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.11
153 0.11
154 0.14
155 0.15
156 0.21
157 0.27
158 0.3
159 0.34
160 0.35
161 0.38
162 0.41
163 0.39
164 0.35
165 0.33
166 0.3
167 0.26
168 0.24
169 0.21
170 0.16
171 0.15
172 0.15
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.14
179 0.14
180 0.14
181 0.15
182 0.16
183 0.16
184 0.16
185 0.15
186 0.13
187 0.12
188 0.1
189 0.08
190 0.06
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.11
197 0.1
198 0.11
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.09
208 0.13
209 0.14
210 0.17
211 0.19
212 0.2
213 0.21
214 0.22
215 0.21
216 0.18
217 0.16
218 0.14
219 0.14
220 0.14
221 0.14
222 0.13
223 0.14
224 0.17
225 0.18
226 0.21
227 0.19
228 0.19
229 0.21
230 0.23
231 0.23
232 0.25
233 0.26
234 0.27
235 0.26
236 0.25
237 0.23
238 0.21
239 0.19
240 0.13
241 0.12
242 0.11
243 0.14
244 0.18
245 0.21
246 0.27
247 0.3
248 0.37
249 0.42
250 0.5
251 0.56
252 0.62
253 0.68
254 0.73
255 0.8
256 0.81
257 0.82
258 0.79
259 0.8
260 0.8
261 0.78
262 0.78
263 0.73
264 0.73
265 0.7
266 0.73
267 0.66
268 0.63
269 0.63
270 0.62
271 0.63
272 0.6
273 0.62
274 0.56
275 0.56
276 0.54
277 0.5
278 0.44
279 0.37
280 0.34
281 0.3
282 0.29
283 0.26
284 0.21
285 0.18
286 0.16
287 0.15
288 0.12
289 0.08
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.12
305 0.17
306 0.2
307 0.2
308 0.2
309 0.21
310 0.22
311 0.22
312 0.2
313 0.16
314 0.13
315 0.14
316 0.15
317 0.13
318 0.17
319 0.17
320 0.14
321 0.13
322 0.13
323 0.13
324 0.11
325 0.11
326 0.08
327 0.09
328 0.11
329 0.12
330 0.15
331 0.15
332 0.19
333 0.19
334 0.18
335 0.17