Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VJJ9

Protein Details
Accession A0A1D2VJJ9    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
190-218GEPTRKKIYKTTQRKNNYRKKTDNSYRDRHydrophilic
233-253DLFKSKKYLFKNNQNNHNPKLHydrophilic
331-359FRESRNTSRLRIRSRSRSRSRSPNSFFNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
321-351ARKPPSAPKAFRESRNTSRLRIRSRSRSRSR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_mito 2, mito 1.5, cyto 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDEDMNDVSMGVADRPEVIEQIDINAEAKKETDHSTLDGNIRLNSLKIDGVNDLSTTDIKTYLDHYLNDTISDEQDKILRFRIQWIDDNSLNVIFESIDDCSNALRILSVFDSVDASINSKITDKRRSKPFIKNLFSKSNYQEDEKLNQEDYKINRDANNNIIFTITQSTIDDKKVRNARERSRYYLLHGEPTRKKIYKTTQRKNNYRKKTDNSYRDRDQLNKSRYEDSFEDDLFKSKKYLFKNNQNNHNPKLYPDFRLKNNDNNDDADDADDLFGDKFSNSIKTGIVGNRNNENNNHNSNNNDNGNDNDDDDLFPGFRSARKPPSAPKAFRESRNTSRLRIRSRSRSRSRSPNSFFNSRSNKSLAERIETSRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.1
3 0.11
4 0.1
5 0.1
6 0.11
7 0.11
8 0.13
9 0.13
10 0.12
11 0.12
12 0.14
13 0.13
14 0.12
15 0.12
16 0.12
17 0.14
18 0.18
19 0.21
20 0.21
21 0.22
22 0.25
23 0.29
24 0.3
25 0.31
26 0.28
27 0.25
28 0.25
29 0.24
30 0.21
31 0.18
32 0.17
33 0.15
34 0.14
35 0.15
36 0.15
37 0.16
38 0.16
39 0.15
40 0.14
41 0.13
42 0.13
43 0.12
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.13
49 0.18
50 0.2
51 0.2
52 0.23
53 0.27
54 0.26
55 0.26
56 0.25
57 0.2
58 0.18
59 0.2
60 0.16
61 0.12
62 0.16
63 0.17
64 0.17
65 0.21
66 0.23
67 0.21
68 0.28
69 0.34
70 0.35
71 0.4
72 0.43
73 0.43
74 0.41
75 0.41
76 0.35
77 0.28
78 0.25
79 0.18
80 0.13
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.06
92 0.06
93 0.05
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.09
101 0.1
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.1
107 0.11
108 0.16
109 0.21
110 0.31
111 0.36
112 0.43
113 0.53
114 0.6
115 0.65
116 0.71
117 0.76
118 0.76
119 0.76
120 0.75
121 0.72
122 0.72
123 0.67
124 0.62
125 0.55
126 0.52
127 0.47
128 0.42
129 0.41
130 0.35
131 0.36
132 0.35
133 0.33
134 0.27
135 0.25
136 0.24
137 0.24
138 0.23
139 0.26
140 0.24
141 0.24
142 0.26
143 0.28
144 0.29
145 0.3
146 0.32
147 0.26
148 0.24
149 0.22
150 0.19
151 0.17
152 0.17
153 0.11
154 0.08
155 0.08
156 0.11
157 0.12
158 0.15
159 0.18
160 0.17
161 0.24
162 0.29
163 0.33
164 0.39
165 0.45
166 0.51
167 0.57
168 0.61
169 0.6
170 0.59
171 0.56
172 0.5
173 0.5
174 0.42
175 0.39
176 0.37
177 0.38
178 0.36
179 0.41
180 0.44
181 0.38
182 0.38
183 0.38
184 0.47
185 0.5
186 0.58
187 0.63
188 0.67
189 0.75
190 0.84
191 0.88
192 0.88
193 0.87
194 0.85
195 0.83
196 0.8
197 0.81
198 0.81
199 0.8
200 0.78
201 0.75
202 0.7
203 0.67
204 0.63
205 0.58
206 0.56
207 0.55
208 0.52
209 0.5
210 0.49
211 0.48
212 0.46
213 0.45
214 0.38
215 0.34
216 0.32
217 0.26
218 0.27
219 0.23
220 0.27
221 0.22
222 0.21
223 0.18
224 0.18
225 0.24
226 0.26
227 0.37
228 0.42
229 0.52
230 0.63
231 0.69
232 0.76
233 0.8
234 0.81
235 0.73
236 0.7
237 0.59
238 0.51
239 0.52
240 0.44
241 0.39
242 0.42
243 0.43
244 0.42
245 0.52
246 0.52
247 0.51
248 0.56
249 0.57
250 0.5
251 0.47
252 0.43
253 0.35
254 0.32
255 0.24
256 0.17
257 0.12
258 0.1
259 0.08
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.07
267 0.1
268 0.11
269 0.12
270 0.12
271 0.13
272 0.17
273 0.21
274 0.28
275 0.29
276 0.32
277 0.38
278 0.41
279 0.42
280 0.41
281 0.42
282 0.39
283 0.42
284 0.42
285 0.37
286 0.37
287 0.38
288 0.42
289 0.4
290 0.35
291 0.3
292 0.28
293 0.31
294 0.28
295 0.25
296 0.19
297 0.17
298 0.16
299 0.16
300 0.14
301 0.1
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.12
306 0.17
307 0.24
308 0.32
309 0.37
310 0.42
311 0.49
312 0.59
313 0.66
314 0.66
315 0.65
316 0.67
317 0.68
318 0.71
319 0.72
320 0.69
321 0.68
322 0.73
323 0.7
324 0.66
325 0.69
326 0.7
327 0.7
328 0.71
329 0.72
330 0.74
331 0.81
332 0.86
333 0.87
334 0.88
335 0.88
336 0.89
337 0.89
338 0.88
339 0.84
340 0.83
341 0.8
342 0.78
343 0.72
344 0.71
345 0.71
346 0.64
347 0.63
348 0.56
349 0.53
350 0.49
351 0.54
352 0.47
353 0.45
354 0.45