Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GHL8

Protein Details
Accession C1GHL8    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-63ARDYNVKKAKLQRLREKARDRNPDEFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-47K
187-220KSKKQIEAEERARKEILAARRLKKRAAEVRSKKL
257-265KWKIRERKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pbn:PADG_06754  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MSSMRNAVQRRVHRERAQPSGREKWGILEKHKDYSLRARDYNVKKAKLQRLREKARDRNPDEFAFGMMSDKTKTQGRHGARGSETAANLSHEAIKLLKTQDAGYLRVVGERVRRQLERVEQEVRLQDGISGVFEGAKGGKIIFADSLQEQKRLKEEKGRENGDRDVDGDGDEEGEQSSGEKQRQAQKSKKQIEAEERARKEILAARRLKKRAAEVRSKKLEALRMQHKELVAAERELDRQRAKMENSVGGVNKYGIKWKIRERKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.77
3 0.78
4 0.77
5 0.74
6 0.73
7 0.72
8 0.68
9 0.62
10 0.54
11 0.51
12 0.52
13 0.51
14 0.5
15 0.5
16 0.5
17 0.52
18 0.55
19 0.49
20 0.45
21 0.49
22 0.52
23 0.49
24 0.48
25 0.47
26 0.54
27 0.59
28 0.65
29 0.63
30 0.58
31 0.57
32 0.65
33 0.71
34 0.7
35 0.74
36 0.74
37 0.76
38 0.82
39 0.86
40 0.86
41 0.86
42 0.87
43 0.87
44 0.82
45 0.79
46 0.74
47 0.65
48 0.58
49 0.48
50 0.39
51 0.28
52 0.22
53 0.17
54 0.12
55 0.12
56 0.1
57 0.1
58 0.12
59 0.16
60 0.18
61 0.22
62 0.31
63 0.33
64 0.41
65 0.43
66 0.46
67 0.42
68 0.43
69 0.4
70 0.33
71 0.29
72 0.22
73 0.2
74 0.16
75 0.15
76 0.13
77 0.12
78 0.09
79 0.1
80 0.09
81 0.1
82 0.11
83 0.12
84 0.13
85 0.12
86 0.13
87 0.17
88 0.18
89 0.19
90 0.17
91 0.17
92 0.16
93 0.16
94 0.16
95 0.13
96 0.17
97 0.19
98 0.22
99 0.25
100 0.25
101 0.26
102 0.3
103 0.36
104 0.34
105 0.34
106 0.33
107 0.3
108 0.32
109 0.31
110 0.27
111 0.2
112 0.15
113 0.11
114 0.09
115 0.08
116 0.06
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.05
131 0.06
132 0.07
133 0.13
134 0.14
135 0.18
136 0.18
137 0.19
138 0.25
139 0.28
140 0.29
141 0.31
142 0.38
143 0.43
144 0.51
145 0.55
146 0.51
147 0.51
148 0.52
149 0.45
150 0.38
151 0.29
152 0.22
153 0.17
154 0.15
155 0.11
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.08
165 0.11
166 0.12
167 0.14
168 0.19
169 0.28
170 0.37
171 0.45
172 0.51
173 0.57
174 0.67
175 0.73
176 0.75
177 0.71
178 0.68
179 0.69
180 0.7
181 0.7
182 0.68
183 0.62
184 0.58
185 0.53
186 0.47
187 0.4
188 0.37
189 0.35
190 0.34
191 0.41
192 0.45
193 0.54
194 0.57
195 0.58
196 0.56
197 0.58
198 0.59
199 0.59
200 0.64
201 0.64
202 0.71
203 0.75
204 0.72
205 0.65
206 0.6
207 0.6
208 0.55
209 0.55
210 0.55
211 0.52
212 0.54
213 0.54
214 0.5
215 0.44
216 0.4
217 0.36
218 0.28
219 0.23
220 0.22
221 0.21
222 0.26
223 0.26
224 0.3
225 0.27
226 0.27
227 0.3
228 0.35
229 0.37
230 0.39
231 0.41
232 0.39
233 0.39
234 0.41
235 0.39
236 0.33
237 0.31
238 0.26
239 0.25
240 0.21
241 0.27
242 0.28
243 0.32
244 0.38
245 0.47