Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VHK5

Protein Details
Accession A0A1D2VHK5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
422-447VEDVGSRGKRAKRPKRLSNLDNPDIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
347-358SKKKSRKGGKGS
428-437RGKRAKRPKR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038886  E3_SLX5/Rfp1  
Amino Acid Sequences MNTNEINTNTNFIRSGIRAINQALVELTNSTSINNALSRISNYAPAHRRLSMMRFNNHNNYRHQINSNRNNHRHSHNGGHNHGIDIGLGLDLGLGWERLHNHLHSHSHSHSHLHNRGSSTDFGSNILFEPDFDDEEEVEFDAEDFFNDYILENQYFDARARSGSTVIINGLTNREMGLIRSEEERMMNSRFKEQENYSRVYKEKLTKQLEKMKEENNGYTSKIDPQVKVCCPLCGVILGEGIPHEYKAINRYDLIKKIRESKNKENQEQNKNDLGDVKIEEKNVTKKEFKDEEMDNIEVVENYFEDEFAREVVNEEVIGKEDNVEKLLYHYVVNYNNSEVVGGEEGSKKKSRKGGKGSRSEGTILNMVYKKLSKIYDCQAPYQLSLRLSQFDVELSQKVFFSKCGHVYCGRCVNRILNPLVVEDVGSRGKRAKRPKRLSNLDNPDIAAPKKCVSQSCGKVFRKNFTQLYMQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.27
3 0.27
4 0.28
5 0.3
6 0.3
7 0.34
8 0.29
9 0.28
10 0.23
11 0.18
12 0.17
13 0.14
14 0.13
15 0.11
16 0.11
17 0.11
18 0.11
19 0.12
20 0.13
21 0.13
22 0.14
23 0.13
24 0.15
25 0.17
26 0.19
27 0.2
28 0.25
29 0.26
30 0.34
31 0.39
32 0.42
33 0.44
34 0.42
35 0.44
36 0.41
37 0.47
38 0.47
39 0.49
40 0.5
41 0.54
42 0.59
43 0.67
44 0.69
45 0.67
46 0.62
47 0.6
48 0.58
49 0.55
50 0.55
51 0.54
52 0.57
53 0.63
54 0.68
55 0.73
56 0.75
57 0.75
58 0.73
59 0.7
60 0.67
61 0.63
62 0.62
63 0.59
64 0.61
65 0.59
66 0.6
67 0.54
68 0.47
69 0.41
70 0.32
71 0.23
72 0.15
73 0.13
74 0.06
75 0.05
76 0.04
77 0.04
78 0.03
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.06
84 0.08
85 0.11
86 0.14
87 0.15
88 0.18
89 0.23
90 0.28
91 0.29
92 0.34
93 0.33
94 0.36
95 0.36
96 0.36
97 0.37
98 0.41
99 0.44
100 0.41
101 0.43
102 0.4
103 0.41
104 0.41
105 0.37
106 0.31
107 0.27
108 0.24
109 0.22
110 0.2
111 0.18
112 0.15
113 0.15
114 0.11
115 0.09
116 0.1
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.09
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.08
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.12
149 0.12
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.11
154 0.12
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.1
165 0.09
166 0.1
167 0.11
168 0.12
169 0.11
170 0.12
171 0.13
172 0.13
173 0.16
174 0.18
175 0.18
176 0.23
177 0.25
178 0.26
179 0.3
180 0.3
181 0.36
182 0.37
183 0.4
184 0.36
185 0.36
186 0.36
187 0.33
188 0.35
189 0.33
190 0.36
191 0.42
192 0.47
193 0.5
194 0.56
195 0.63
196 0.63
197 0.6
198 0.57
199 0.51
200 0.5
201 0.46
202 0.4
203 0.34
204 0.3
205 0.26
206 0.23
207 0.2
208 0.17
209 0.21
210 0.22
211 0.2
212 0.23
213 0.28
214 0.28
215 0.33
216 0.3
217 0.24
218 0.22
219 0.22
220 0.18
221 0.13
222 0.12
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.05
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.12
238 0.18
239 0.21
240 0.28
241 0.31
242 0.31
243 0.31
244 0.4
245 0.47
246 0.51
247 0.55
248 0.6
249 0.66
250 0.71
251 0.75
252 0.75
253 0.76
254 0.77
255 0.72
256 0.66
257 0.6
258 0.52
259 0.47
260 0.4
261 0.31
262 0.23
263 0.21
264 0.2
265 0.17
266 0.17
267 0.18
268 0.18
269 0.24
270 0.26
271 0.29
272 0.29
273 0.29
274 0.38
275 0.4
276 0.38
277 0.37
278 0.35
279 0.36
280 0.35
281 0.34
282 0.25
283 0.22
284 0.2
285 0.15
286 0.13
287 0.09
288 0.04
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.06
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.07
305 0.08
306 0.06
307 0.08
308 0.1
309 0.1
310 0.11
311 0.11
312 0.1
313 0.11
314 0.14
315 0.13
316 0.11
317 0.12
318 0.15
319 0.18
320 0.2
321 0.19
322 0.18
323 0.18
324 0.18
325 0.16
326 0.12
327 0.1
328 0.09
329 0.08
330 0.09
331 0.13
332 0.14
333 0.18
334 0.24
335 0.24
336 0.29
337 0.37
338 0.44
339 0.5
340 0.6
341 0.67
342 0.71
343 0.8
344 0.79
345 0.74
346 0.67
347 0.58
348 0.49
349 0.41
350 0.33
351 0.23
352 0.24
353 0.23
354 0.21
355 0.21
356 0.21
357 0.2
358 0.22
359 0.25
360 0.22
361 0.26
362 0.32
363 0.38
364 0.39
365 0.4
366 0.41
367 0.39
368 0.38
369 0.36
370 0.34
371 0.27
372 0.28
373 0.27
374 0.24
375 0.23
376 0.22
377 0.19
378 0.16
379 0.17
380 0.16
381 0.16
382 0.15
383 0.15
384 0.15
385 0.16
386 0.16
387 0.17
388 0.19
389 0.23
390 0.29
391 0.3
392 0.34
393 0.4
394 0.42
395 0.47
396 0.53
397 0.49
398 0.45
399 0.45
400 0.46
401 0.46
402 0.49
403 0.44
404 0.38
405 0.36
406 0.34
407 0.32
408 0.27
409 0.21
410 0.15
411 0.16
412 0.18
413 0.17
414 0.18
415 0.23
416 0.31
417 0.39
418 0.5
419 0.58
420 0.64
421 0.74
422 0.83
423 0.87
424 0.9
425 0.9
426 0.9
427 0.89
428 0.82
429 0.73
430 0.64
431 0.55
432 0.49
433 0.43
434 0.36
435 0.29
436 0.27
437 0.3
438 0.33
439 0.34
440 0.36
441 0.44
442 0.5
443 0.57
444 0.65
445 0.65
446 0.71
447 0.72
448 0.75
449 0.73
450 0.73
451 0.66