Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VK17

Protein Details
Accession A0A1D2VK17    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
263-304NSLKHRLQINKKSSKRGKKFENAVKQIKKKERKNNNNSGVSLHydrophilic
668-690VGPVKYKESKKERLTRVQEGREDHydrophilic
698-726RGKRSNPHSTTNREKARKKNFVMMIHKRSHydrophilic
734-754SLRDKQKVLKAHISKQKKRGHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
272-295NKKSSKRGKKFENAVKQIKKKERK
687-754GREDREKFGSSRGKRSNPHSTTNREKARKKNFVMMIHKRSVQGKVKLSLRDKQKVLKAHISKQKKRGH
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 9.5, mito 3, pero 3, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027312  Sda1  
IPR007949  SDA1_C  
IPR012977  SDA1_N  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08158  NUC130_3NT  
PF05285  SDA1  
Amino Acid Sequences MVKRSRAAILPTNVILLQNLVKRDPQSYKEEFLQQYEHYYHLKNIIVLQEENNSESIQQFIVLIDFVTAVSTCFPKETAEFPNDIKDLLLNSPQSLTSELREKLIQCLVTLRNKKVITSEELLLILFPLLSIYSSSNKDTILHSNLNAKALRKQIYSNLITLMKSVNNGAKNQKINRLAQSFLFNLLKDKEGSQSLWVSKIVRELWRRQIWFDETTVQIMKEATLHPNPKVATSGANFFLGSDNDREEALADDSSDDEGIDMNSLKHRLQINKKSSKRGKKFENAVKQIKKKERKNNNNSGVSLNFSAIHLLRDPQGFAEELFSTHLSGKNFKKFDLDQKIIFMNLISRLISNHKLIVLGIYSFFLKYLTPKQKNVTQIMAACAQATHDLVPPEFINEMVRKIANEFVSDGVSSEAAAAGINTIREILSRAPLAIDEPLLQDLTEYKGSKAKPVNIAAKSLISLYREVAPEMLLKKDRGKTASIQLQNIKNGTTKEKKLNFGNQNVVENIPYIELLNEYQKNNKEENKDEGNDSDWNIDENDEDESDMEYGPWVNVDDNGDDDMNGFININDDSDDESNEQENGKSLIDSDLDLSSDEEEDDDQTAQEDGKVPNKEVKLDEMLITSRILTPADFAKLDELKMEAGISKLIRGKSQPVNEEKIDHSTLVGPVKYKESKKERLTRVQEGREDREKFGSSRGKRSNPHSTTNREKARKKNFVMMIHKRSVQGKVKLSLRDKQKVLKAHISKQKKRGH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.26
3 0.19
4 0.2
5 0.19
6 0.21
7 0.21
8 0.25
9 0.26
10 0.33
11 0.37
12 0.38
13 0.42
14 0.45
15 0.48
16 0.49
17 0.56
18 0.51
19 0.48
20 0.47
21 0.39
22 0.4
23 0.36
24 0.35
25 0.3
26 0.3
27 0.29
28 0.3
29 0.31
30 0.27
31 0.28
32 0.29
33 0.3
34 0.29
35 0.28
36 0.28
37 0.28
38 0.28
39 0.25
40 0.21
41 0.18
42 0.17
43 0.16
44 0.11
45 0.1
46 0.09
47 0.08
48 0.09
49 0.08
50 0.07
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.12
63 0.14
64 0.18
65 0.23
66 0.25
67 0.28
68 0.28
69 0.34
70 0.32
71 0.3
72 0.25
73 0.2
74 0.19
75 0.19
76 0.23
77 0.17
78 0.18
79 0.18
80 0.19
81 0.19
82 0.2
83 0.19
84 0.17
85 0.24
86 0.24
87 0.25
88 0.28
89 0.28
90 0.29
91 0.32
92 0.29
93 0.22
94 0.27
95 0.3
96 0.37
97 0.43
98 0.41
99 0.45
100 0.45
101 0.45
102 0.44
103 0.43
104 0.39
105 0.37
106 0.35
107 0.28
108 0.28
109 0.27
110 0.22
111 0.18
112 0.12
113 0.07
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.05
119 0.08
120 0.12
121 0.15
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.19
126 0.21
127 0.25
128 0.27
129 0.26
130 0.26
131 0.33
132 0.34
133 0.37
134 0.36
135 0.31
136 0.31
137 0.35
138 0.38
139 0.32
140 0.34
141 0.36
142 0.42
143 0.42
144 0.37
145 0.35
146 0.33
147 0.31
148 0.29
149 0.25
150 0.17
151 0.16
152 0.18
153 0.19
154 0.19
155 0.23
156 0.28
157 0.33
158 0.39
159 0.42
160 0.48
161 0.49
162 0.51
163 0.55
164 0.52
165 0.47
166 0.42
167 0.42
168 0.34
169 0.33
170 0.3
171 0.22
172 0.23
173 0.23
174 0.22
175 0.19
176 0.19
177 0.17
178 0.18
179 0.19
180 0.19
181 0.22
182 0.21
183 0.22
184 0.23
185 0.21
186 0.19
187 0.23
188 0.24
189 0.27
190 0.31
191 0.35
192 0.44
193 0.5
194 0.5
195 0.47
196 0.49
197 0.46
198 0.43
199 0.38
200 0.32
201 0.25
202 0.26
203 0.26
204 0.2
205 0.16
206 0.14
207 0.13
208 0.11
209 0.12
210 0.15
211 0.2
212 0.22
213 0.22
214 0.27
215 0.27
216 0.25
217 0.26
218 0.21
219 0.19
220 0.18
221 0.21
222 0.18
223 0.18
224 0.17
225 0.16
226 0.17
227 0.13
228 0.13
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.08
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.06
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.08
251 0.1
252 0.1
253 0.14
254 0.19
255 0.26
256 0.36
257 0.45
258 0.53
259 0.62
260 0.67
261 0.72
262 0.78
263 0.81
264 0.8
265 0.79
266 0.78
267 0.76
268 0.82
269 0.81
270 0.82
271 0.79
272 0.79
273 0.78
274 0.76
275 0.76
276 0.76
277 0.77
278 0.76
279 0.78
280 0.8
281 0.83
282 0.86
283 0.88
284 0.87
285 0.82
286 0.74
287 0.66
288 0.55
289 0.46
290 0.36
291 0.26
292 0.17
293 0.12
294 0.12
295 0.1
296 0.1
297 0.08
298 0.08
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.1
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.08
308 0.08
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.1
313 0.13
314 0.12
315 0.18
316 0.22
317 0.28
318 0.29
319 0.28
320 0.32
321 0.31
322 0.4
323 0.43
324 0.41
325 0.34
326 0.35
327 0.35
328 0.3
329 0.28
330 0.18
331 0.11
332 0.09
333 0.09
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.11
338 0.14
339 0.13
340 0.13
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.11
345 0.08
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.07
355 0.16
356 0.26
357 0.3
358 0.33
359 0.36
360 0.4
361 0.45
362 0.46
363 0.38
364 0.3
365 0.27
366 0.26
367 0.24
368 0.2
369 0.14
370 0.11
371 0.1
372 0.08
373 0.08
374 0.06
375 0.07
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.08
380 0.09
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.09
389 0.1
390 0.13
391 0.11
392 0.11
393 0.11
394 0.11
395 0.11
396 0.11
397 0.1
398 0.07
399 0.06
400 0.06
401 0.05
402 0.04
403 0.04
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.04
408 0.03
409 0.03
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.06
414 0.06
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.09
421 0.08
422 0.07
423 0.06
424 0.06
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.06
429 0.06
430 0.08
431 0.11
432 0.11
433 0.12
434 0.16
435 0.17
436 0.23
437 0.27
438 0.29
439 0.31
440 0.36
441 0.43
442 0.4
443 0.42
444 0.36
445 0.32
446 0.28
447 0.22
448 0.18
449 0.12
450 0.11
451 0.1
452 0.13
453 0.13
454 0.13
455 0.12
456 0.11
457 0.13
458 0.14
459 0.16
460 0.15
461 0.16
462 0.22
463 0.26
464 0.28
465 0.27
466 0.29
467 0.29
468 0.35
469 0.42
470 0.39
471 0.39
472 0.42
473 0.43
474 0.43
475 0.4
476 0.33
477 0.27
478 0.26
479 0.3
480 0.31
481 0.32
482 0.39
483 0.44
484 0.48
485 0.51
486 0.59
487 0.58
488 0.56
489 0.59
490 0.51
491 0.49
492 0.44
493 0.39
494 0.29
495 0.23
496 0.18
497 0.11
498 0.09
499 0.07
500 0.06
501 0.06
502 0.07
503 0.12
504 0.15
505 0.16
506 0.22
507 0.27
508 0.3
509 0.34
510 0.39
511 0.39
512 0.4
513 0.46
514 0.47
515 0.44
516 0.41
517 0.38
518 0.35
519 0.3
520 0.27
521 0.22
522 0.15
523 0.14
524 0.13
525 0.12
526 0.09
527 0.09
528 0.09
529 0.08
530 0.08
531 0.07
532 0.08
533 0.08
534 0.08
535 0.07
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.06
542 0.07
543 0.09
544 0.09
545 0.09
546 0.11
547 0.11
548 0.1
549 0.1
550 0.09
551 0.08
552 0.08
553 0.07
554 0.05
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.07
559 0.07
560 0.1
561 0.1
562 0.12
563 0.11
564 0.12
565 0.13
566 0.13
567 0.13
568 0.11
569 0.12
570 0.12
571 0.11
572 0.1
573 0.1
574 0.11
575 0.11
576 0.11
577 0.11
578 0.1
579 0.1
580 0.1
581 0.1
582 0.09
583 0.09
584 0.08
585 0.07
586 0.07
587 0.08
588 0.08
589 0.08
590 0.07
591 0.08
592 0.08
593 0.08
594 0.09
595 0.12
596 0.13
597 0.2
598 0.22
599 0.23
600 0.29
601 0.3
602 0.33
603 0.3
604 0.33
605 0.3
606 0.3
607 0.29
608 0.24
609 0.24
610 0.21
611 0.2
612 0.16
613 0.13
614 0.12
615 0.12
616 0.1
617 0.11
618 0.12
619 0.15
620 0.15
621 0.14
622 0.19
623 0.2
624 0.2
625 0.19
626 0.17
627 0.14
628 0.14
629 0.14
630 0.09
631 0.09
632 0.11
633 0.11
634 0.14
635 0.18
636 0.19
637 0.22
638 0.24
639 0.31
640 0.36
641 0.43
642 0.47
643 0.48
644 0.53
645 0.52
646 0.53
647 0.47
648 0.45
649 0.4
650 0.32
651 0.27
652 0.23
653 0.25
654 0.26
655 0.25
656 0.21
657 0.21
658 0.28
659 0.35
660 0.37
661 0.43
662 0.48
663 0.57
664 0.65
665 0.74
666 0.76
667 0.79
668 0.83
669 0.83
670 0.84
671 0.82
672 0.79
673 0.76
674 0.75
675 0.73
676 0.68
677 0.61
678 0.57
679 0.52
680 0.45
681 0.48
682 0.5
683 0.47
684 0.54
685 0.6
686 0.63
687 0.66
688 0.73
689 0.75
690 0.7
691 0.75
692 0.72
693 0.72
694 0.74
695 0.78
696 0.8
697 0.78
698 0.81
699 0.82
700 0.85
701 0.87
702 0.81
703 0.81
704 0.78
705 0.79
706 0.81
707 0.81
708 0.78
709 0.73
710 0.71
711 0.65
712 0.61
713 0.61
714 0.59
715 0.57
716 0.56
717 0.58
718 0.61
719 0.67
720 0.68
721 0.66
722 0.67
723 0.67
724 0.65
725 0.66
726 0.67
727 0.67
728 0.69
729 0.72
730 0.7
731 0.71
732 0.76
733 0.79
734 0.81