Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VMV6

Protein Details
Accession A0A1D2VMV6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
752-772DKDSNQTSLPKKKKLKPFFFSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR019039  T4-Rnl1-like_N  
IPR015966  tRNA_lig_kin_fungi  
IPR015965  tRNA_lig_PDEase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003972  F:RNA ligase (ATP) activity  
GO:0006388  P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation  
Pfam View protein in Pfam  
PF09511  RNA_lig_T4_1  
PF08302  tRNA_lig_CPD  
PF08303  tRNA_lig_kinase  
Amino Acid Sequences MASVDSELTLPFDPISPLFSSADEINLTNELVDTFNDLIHRKKSNPSAKLKGIPNKNIYKSFQDPNILLDSYKFNEWEYSNSKIPLPCNARGLFLLNSNNLDLYQNNNKIVIRGYDKFFNTDEVPKTKWSNLYQNSIGPYELTLKENGCILFISGLINGNLIVTSKHSTGYRHDIEKNHALYGKLLLEKQLSQKNINQSSFAKLLNKYNITLVAELCDDSFEEHIIRYSKKNSGLYLHGINYNSKVFQTYSIQKVHIFADAFGFKKIKYLIKDNIKDLKTFLDKCAETGTYNDKEIEGFVIRCKEKDTNYDFFWKYKFDEPYLMYRQWRELTKSYIAGKPINLLVKKIFKHKDVSTEYLNFVIPILDNNEFLKIQYTKGHGIIQLRELFLKHTKKTGVELASINDNNEEESLNNNNYHGENEKNSNLNRRQILLKAQKNKDYLKNYPDLENDINNIVKEFEQLVLNEKDSSYINTGYQKKSIDTDESATKTITKYVIIPVATIGCGKTTVFLTLKNLFSNWGHVQNDDIPLGKKNKNNLIDNSLKYLVSDIENYKGDNLIEPNVIMIDRNNHQFRERKQLFNDLERFKVKFFKDYSKNVDFKFICLNFLPGKDNQTADYWDLTTSRVKARGNNHQSIKVNKDGYDFALKIMNGFRSRFQPVNKIRTPDSLFDLVIDLETHTENSSRENVVTILNNIGQYFPKMLLNNDQTDIQLPSKEEIDVAFMRALGYTPTVEKVFRNTENKGKDNKREDKDSNQTSLPKKKKLKPFFFSINIDDKISFLKSVKSIILKSGISNDSNYSGPESVYHRLEQTNRIQNSFHVTLIHQNLYKSNQKLKLKSQNPVINQIWTNFESELSLILEGSYVVEKNESFSFIRLPLLANIKPYKIVWNKNLVCVAVKIVSVSHENSKSENLIERFNCVNEIPHITIGTVSSSIKPFASNALLNKAKAFLDNEFEGKFNSENEEVFVLNWPDEESDSKIFEYLPINAII
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.16
3 0.15
4 0.17
5 0.17
6 0.17
7 0.19
8 0.18
9 0.2
10 0.18
11 0.16
12 0.15
13 0.15
14 0.15
15 0.12
16 0.12
17 0.1
18 0.1
19 0.09
20 0.11
21 0.11
22 0.12
23 0.15
24 0.17
25 0.22
26 0.28
27 0.32
28 0.32
29 0.4
30 0.5
31 0.57
32 0.64
33 0.68
34 0.71
35 0.74
36 0.79
37 0.79
38 0.78
39 0.78
40 0.77
41 0.76
42 0.77
43 0.76
44 0.74
45 0.69
46 0.67
47 0.64
48 0.61
49 0.58
50 0.54
51 0.48
52 0.45
53 0.45
54 0.37
55 0.31
56 0.27
57 0.26
58 0.23
59 0.25
60 0.22
61 0.18
62 0.23
63 0.24
64 0.29
65 0.29
66 0.32
67 0.34
68 0.35
69 0.38
70 0.37
71 0.37
72 0.4
73 0.42
74 0.4
75 0.43
76 0.42
77 0.4
78 0.38
79 0.4
80 0.32
81 0.31
82 0.31
83 0.26
84 0.27
85 0.25
86 0.24
87 0.21
88 0.21
89 0.16
90 0.19
91 0.26
92 0.29
93 0.29
94 0.32
95 0.31
96 0.31
97 0.33
98 0.32
99 0.3
100 0.3
101 0.32
102 0.37
103 0.38
104 0.39
105 0.38
106 0.36
107 0.32
108 0.35
109 0.37
110 0.34
111 0.35
112 0.37
113 0.4
114 0.4
115 0.44
116 0.43
117 0.48
118 0.49
119 0.54
120 0.52
121 0.52
122 0.5
123 0.44
124 0.38
125 0.28
126 0.24
127 0.22
128 0.21
129 0.2
130 0.19
131 0.18
132 0.19
133 0.22
134 0.2
135 0.15
136 0.13
137 0.12
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.08
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.08
151 0.11
152 0.11
153 0.14
154 0.16
155 0.18
156 0.24
157 0.33
158 0.35
159 0.38
160 0.43
161 0.44
162 0.5
163 0.55
164 0.51
165 0.45
166 0.42
167 0.37
168 0.32
169 0.32
170 0.29
171 0.23
172 0.22
173 0.21
174 0.21
175 0.24
176 0.3
177 0.33
178 0.32
179 0.33
180 0.38
181 0.45
182 0.51
183 0.49
184 0.45
185 0.41
186 0.43
187 0.42
188 0.39
189 0.34
190 0.29
191 0.34
192 0.38
193 0.38
194 0.34
195 0.33
196 0.34
197 0.3
198 0.29
199 0.22
200 0.16
201 0.15
202 0.14
203 0.12
204 0.1
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.11
212 0.14
213 0.16
214 0.19
215 0.23
216 0.28
217 0.34
218 0.37
219 0.36
220 0.36
221 0.38
222 0.38
223 0.38
224 0.34
225 0.31
226 0.29
227 0.28
228 0.26
229 0.24
230 0.2
231 0.16
232 0.16
233 0.14
234 0.16
235 0.21
236 0.25
237 0.29
238 0.31
239 0.32
240 0.31
241 0.32
242 0.3
243 0.27
244 0.22
245 0.16
246 0.18
247 0.2
248 0.2
249 0.2
250 0.2
251 0.16
252 0.19
253 0.22
254 0.23
255 0.25
256 0.31
257 0.38
258 0.48
259 0.52
260 0.54
261 0.59
262 0.55
263 0.51
264 0.45
265 0.42
266 0.38
267 0.36
268 0.32
269 0.31
270 0.3
271 0.3
272 0.33
273 0.28
274 0.21
275 0.22
276 0.27
277 0.21
278 0.22
279 0.22
280 0.19
281 0.18
282 0.17
283 0.17
284 0.12
285 0.11
286 0.13
287 0.19
288 0.19
289 0.2
290 0.23
291 0.25
292 0.25
293 0.33
294 0.37
295 0.35
296 0.37
297 0.45
298 0.42
299 0.4
300 0.39
301 0.33
302 0.3
303 0.32
304 0.32
305 0.26
306 0.3
307 0.31
308 0.37
309 0.4
310 0.4
311 0.35
312 0.33
313 0.35
314 0.34
315 0.35
316 0.32
317 0.3
318 0.32
319 0.33
320 0.36
321 0.35
322 0.34
323 0.34
324 0.3
325 0.27
326 0.24
327 0.24
328 0.25
329 0.22
330 0.21
331 0.22
332 0.27
333 0.29
334 0.36
335 0.37
336 0.34
337 0.4
338 0.4
339 0.45
340 0.44
341 0.46
342 0.42
343 0.4
344 0.38
345 0.33
346 0.31
347 0.21
348 0.16
349 0.13
350 0.08
351 0.07
352 0.09
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.12
357 0.11
358 0.11
359 0.15
360 0.12
361 0.13
362 0.16
363 0.19
364 0.19
365 0.21
366 0.23
367 0.21
368 0.23
369 0.23
370 0.24
371 0.23
372 0.21
373 0.2
374 0.18
375 0.19
376 0.23
377 0.27
378 0.24
379 0.26
380 0.28
381 0.28
382 0.31
383 0.33
384 0.28
385 0.25
386 0.25
387 0.22
388 0.25
389 0.25
390 0.22
391 0.16
392 0.15
393 0.12
394 0.11
395 0.11
396 0.06
397 0.08
398 0.11
399 0.11
400 0.12
401 0.12
402 0.12
403 0.12
404 0.14
405 0.13
406 0.12
407 0.13
408 0.16
409 0.19
410 0.21
411 0.22
412 0.3
413 0.31
414 0.35
415 0.34
416 0.33
417 0.32
418 0.31
419 0.39
420 0.4
421 0.43
422 0.47
423 0.5
424 0.53
425 0.55
426 0.57
427 0.56
428 0.52
429 0.5
430 0.45
431 0.47
432 0.42
433 0.41
434 0.37
435 0.34
436 0.29
437 0.25
438 0.21
439 0.17
440 0.17
441 0.14
442 0.13
443 0.09
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.07
448 0.08
449 0.08
450 0.13
451 0.13
452 0.13
453 0.13
454 0.12
455 0.12
456 0.12
457 0.13
458 0.1
459 0.1
460 0.11
461 0.18
462 0.22
463 0.22
464 0.25
465 0.24
466 0.22
467 0.24
468 0.24
469 0.2
470 0.17
471 0.18
472 0.19
473 0.2
474 0.2
475 0.18
476 0.17
477 0.14
478 0.15
479 0.13
480 0.1
481 0.09
482 0.1
483 0.13
484 0.12
485 0.12
486 0.1
487 0.1
488 0.1
489 0.09
490 0.07
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.08
497 0.08
498 0.09
499 0.13
500 0.16
501 0.17
502 0.16
503 0.16
504 0.15
505 0.15
506 0.19
507 0.17
508 0.19
509 0.18
510 0.18
511 0.19
512 0.2
513 0.21
514 0.16
515 0.16
516 0.11
517 0.14
518 0.2
519 0.23
520 0.23
521 0.27
522 0.34
523 0.39
524 0.42
525 0.41
526 0.42
527 0.44
528 0.42
529 0.41
530 0.34
531 0.28
532 0.24
533 0.22
534 0.16
535 0.11
536 0.13
537 0.1
538 0.12
539 0.13
540 0.13
541 0.13
542 0.13
543 0.12
544 0.11
545 0.11
546 0.09
547 0.09
548 0.08
549 0.08
550 0.07
551 0.07
552 0.06
553 0.06
554 0.07
555 0.1
556 0.16
557 0.18
558 0.18
559 0.23
560 0.29
561 0.31
562 0.39
563 0.41
564 0.4
565 0.4
566 0.49
567 0.48
568 0.49
569 0.54
570 0.45
571 0.45
572 0.42
573 0.41
574 0.32
575 0.37
576 0.3
577 0.28
578 0.3
579 0.35
580 0.4
581 0.45
582 0.52
583 0.52
584 0.55
585 0.49
586 0.55
587 0.45
588 0.4
589 0.42
590 0.34
591 0.29
592 0.25
593 0.28
594 0.21
595 0.22
596 0.23
597 0.16
598 0.2
599 0.19
600 0.2
601 0.18
602 0.18
603 0.18
604 0.17
605 0.17
606 0.13
607 0.12
608 0.12
609 0.12
610 0.13
611 0.13
612 0.15
613 0.19
614 0.2
615 0.25
616 0.31
617 0.4
618 0.46
619 0.51
620 0.51
621 0.53
622 0.56
623 0.55
624 0.53
625 0.48
626 0.42
627 0.35
628 0.35
629 0.29
630 0.28
631 0.29
632 0.24
633 0.19
634 0.2
635 0.19
636 0.18
637 0.19
638 0.21
639 0.18
640 0.19
641 0.21
642 0.21
643 0.26
644 0.29
645 0.29
646 0.35
647 0.4
648 0.48
649 0.5
650 0.49
651 0.47
652 0.5
653 0.51
654 0.43
655 0.4
656 0.33
657 0.29
658 0.25
659 0.24
660 0.17
661 0.14
662 0.12
663 0.07
664 0.06
665 0.07
666 0.07
667 0.07
668 0.08
669 0.08
670 0.1
671 0.13
672 0.13
673 0.13
674 0.13
675 0.13
676 0.14
677 0.15
678 0.13
679 0.13
680 0.13
681 0.13
682 0.12
683 0.12
684 0.11
685 0.11
686 0.11
687 0.1
688 0.13
689 0.13
690 0.15
691 0.22
692 0.25
693 0.26
694 0.26
695 0.26
696 0.23
697 0.24
698 0.25
699 0.17
700 0.15
701 0.14
702 0.14
703 0.15
704 0.14
705 0.13
706 0.11
707 0.14
708 0.13
709 0.13
710 0.12
711 0.11
712 0.11
713 0.11
714 0.11
715 0.07
716 0.08
717 0.07
718 0.08
719 0.1
720 0.11
721 0.12
722 0.13
723 0.17
724 0.23
725 0.28
726 0.33
727 0.34
728 0.42
729 0.48
730 0.53
731 0.57
732 0.59
733 0.62
734 0.67
735 0.73
736 0.7
737 0.72
738 0.71
739 0.7
740 0.73
741 0.68
742 0.62
743 0.56
744 0.57
745 0.56
746 0.62
747 0.6
748 0.6
749 0.65
750 0.7
751 0.77
752 0.81
753 0.83
754 0.78
755 0.78
756 0.77
757 0.74
758 0.69
759 0.64
760 0.59
761 0.5
762 0.46
763 0.38
764 0.3
765 0.26
766 0.23
767 0.19
768 0.13
769 0.15
770 0.15
771 0.18
772 0.21
773 0.22
774 0.22
775 0.24
776 0.27
777 0.24
778 0.24
779 0.28
780 0.27
781 0.24
782 0.25
783 0.23
784 0.21
785 0.21
786 0.21
787 0.17
788 0.15
789 0.14
790 0.16
791 0.18
792 0.21
793 0.23
794 0.23
795 0.23
796 0.26
797 0.3
798 0.33
799 0.39
800 0.44
801 0.43
802 0.44
803 0.42
804 0.39
805 0.44
806 0.39
807 0.31
808 0.23
809 0.22
810 0.27
811 0.31
812 0.34
813 0.27
814 0.26
815 0.29
816 0.33
817 0.4
818 0.37
819 0.42
820 0.47
821 0.53
822 0.58
823 0.65
824 0.7
825 0.69
826 0.71
827 0.72
828 0.71
829 0.67
830 0.69
831 0.61
832 0.55
833 0.51
834 0.45
835 0.4
836 0.33
837 0.32
838 0.24
839 0.22
840 0.17
841 0.15
842 0.15
843 0.11
844 0.1
845 0.08
846 0.07
847 0.07
848 0.07
849 0.07
850 0.07
851 0.07
852 0.07
853 0.09
854 0.09
855 0.12
856 0.13
857 0.15
858 0.15
859 0.16
860 0.18
861 0.18
862 0.19
863 0.17
864 0.18
865 0.19
866 0.25
867 0.24
868 0.28
869 0.3
870 0.3
871 0.31
872 0.3
873 0.36
874 0.38
875 0.45
876 0.44
877 0.53
878 0.54
879 0.57
880 0.59
881 0.5
882 0.44
883 0.36
884 0.33
885 0.24
886 0.22
887 0.16
888 0.14
889 0.16
890 0.17
891 0.19
892 0.23
893 0.25
894 0.27
895 0.28
896 0.31
897 0.3
898 0.3
899 0.35
900 0.29
901 0.33
902 0.33
903 0.35
904 0.34
905 0.34
906 0.33
907 0.26
908 0.27
909 0.22
910 0.28
911 0.26
912 0.25
913 0.25
914 0.23
915 0.22
916 0.2
917 0.18
918 0.14
919 0.13
920 0.15
921 0.16
922 0.17
923 0.17
924 0.17
925 0.16
926 0.19
927 0.23
928 0.23
929 0.25
930 0.33
931 0.36
932 0.36
933 0.36
934 0.34
935 0.3
936 0.29
937 0.29
938 0.22
939 0.25
940 0.27
941 0.29
942 0.27
943 0.27
944 0.25
945 0.24
946 0.23
947 0.18
948 0.21
949 0.19
950 0.19
951 0.21
952 0.21
953 0.19
954 0.18
955 0.22
956 0.18
957 0.16
958 0.16
959 0.15
960 0.15
961 0.16
962 0.18
963 0.18
964 0.2
965 0.22
966 0.22
967 0.22
968 0.21
969 0.22
970 0.23
971 0.21