Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VBX5

Protein Details
Accession A0A1D2VBX5    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-47VNLVHNVQKKQHRERSQPNERKRWGLLEKKKDYKLRAADYHKKQDAHydrophilic
195-230LSNSQIRKLNKKKLKQLKLHRKRIQNEKKLRQVQLTHydrophilic
235-263REVMKNGNKKKLTKNSGNKVFKWKKERKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-51HRERSQPNERKRWGLLEKKKDYKLRAADYHKKQDALKKL
201-223RKLNKKKLKQLKLHRKRIQNEKK
240-263NGNKKKLTKNSGNKVFKWKKERKR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MVNLVHNVQKKQHRERSQPNERKRWGLLEKKKDYKLRAADYHKKQDALKKLRTKASLRNPDEYYHSMTRKRADDNGVLIASRGNDVLDVDQAKLLKTQDSNYINVMRLKELKKIEKFKDSPLLFMNDTSKLSKHTVFVDNKSDQIKFNPTKYFKTHKSLLNSSNRLTLDQVDNIKNSLNYNDAINNDSSNGILELSNSQIRKLNKKKLKQLKLHRKRIQNEKKLRQVQLTLDLSREVMKNGNKKKLTKNSGNKVFKWKKERKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.85
3 0.88
4 0.9
5 0.91
6 0.91
7 0.91
8 0.86
9 0.81
10 0.73
11 0.71
12 0.7
13 0.7
14 0.7
15 0.7
16 0.76
17 0.78
18 0.83
19 0.81
20 0.76
21 0.74
22 0.73
23 0.7
24 0.69
25 0.7
26 0.73
27 0.75
28 0.8
29 0.74
30 0.68
31 0.64
32 0.63
33 0.64
34 0.62
35 0.63
36 0.62
37 0.65
38 0.69
39 0.72
40 0.69
41 0.69
42 0.71
43 0.72
44 0.67
45 0.67
46 0.62
47 0.57
48 0.57
49 0.5
50 0.46
51 0.41
52 0.42
53 0.39
54 0.41
55 0.45
56 0.43
57 0.43
58 0.41
59 0.39
60 0.38
61 0.36
62 0.36
63 0.31
64 0.27
65 0.23
66 0.19
67 0.15
68 0.12
69 0.09
70 0.06
71 0.05
72 0.06
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.12
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.13
85 0.2
86 0.22
87 0.23
88 0.24
89 0.25
90 0.25
91 0.26
92 0.26
93 0.19
94 0.23
95 0.23
96 0.27
97 0.3
98 0.35
99 0.4
100 0.47
101 0.49
102 0.53
103 0.53
104 0.51
105 0.55
106 0.47
107 0.42
108 0.36
109 0.35
110 0.26
111 0.25
112 0.24
113 0.15
114 0.16
115 0.15
116 0.14
117 0.13
118 0.15
119 0.15
120 0.15
121 0.17
122 0.23
123 0.25
124 0.28
125 0.31
126 0.3
127 0.31
128 0.31
129 0.29
130 0.22
131 0.21
132 0.27
133 0.24
134 0.28
135 0.33
136 0.34
137 0.38
138 0.43
139 0.48
140 0.44
141 0.48
142 0.5
143 0.48
144 0.52
145 0.53
146 0.55
147 0.57
148 0.54
149 0.49
150 0.48
151 0.43
152 0.37
153 0.32
154 0.27
155 0.2
156 0.21
157 0.24
158 0.2
159 0.2
160 0.2
161 0.2
162 0.18
163 0.17
164 0.14
165 0.12
166 0.11
167 0.12
168 0.14
169 0.14
170 0.15
171 0.15
172 0.14
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.09
177 0.08
178 0.07
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.1
183 0.14
184 0.13
185 0.14
186 0.19
187 0.23
188 0.33
189 0.41
190 0.49
191 0.55
192 0.64
193 0.74
194 0.8
195 0.86
196 0.86
197 0.88
198 0.88
199 0.9
200 0.93
201 0.9
202 0.88
203 0.87
204 0.88
205 0.88
206 0.87
207 0.87
208 0.86
209 0.88
210 0.87
211 0.83
212 0.76
213 0.7
214 0.63
215 0.62
216 0.57
217 0.47
218 0.39
219 0.36
220 0.31
221 0.3
222 0.26
223 0.18
224 0.2
225 0.26
226 0.34
227 0.42
228 0.52
229 0.55
230 0.61
231 0.71
232 0.75
233 0.78
234 0.79
235 0.82
236 0.83
237 0.87
238 0.88
239 0.82
240 0.82
241 0.82
242 0.81
243 0.81