Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1G8D8

Protein Details
Accession C1G8D8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
186-206EQSRRLRRAFRAERKRRENAQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
190-202RLRRAFRAERKRR
272-292QGRGRPGEKGKGKEKRARKPE
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 9, cyto 6.5, mito 4, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pbn:PADG_03524  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MYYVPPDQEGLTTGNKLANKHPLGSRARHLHTTGELTVRFEMPFAVWCSTCQPADTVLIGQGVRFNALKKRVGNYYSTPIYSFRMKHSICGGWIEIRTDPQNTAYVVTEGGRRRDTGELEKGGYEEDGEIRLRLRQAGEGGVGAAEKDAFAKLEGKVADQKRVMTEKMRMEELIKVQERDWEDPYEQSRRLRRAFRAERKRRENAQEVTEALRDKMSLGIELLEESEGDRVRTGMVDFAPDPGSIAGGDVARRVISKPLFETKSIAKTPPDQGRGRPGEKGKGKEKRARKPEAVAAQRKALLQQELSGNTRAAVDPFLQDDDTDWTPGGKKRRTARSAGVVRAGGEPIQERKHENGNDKGDEGEVNGDGGTPDGENKNRNWQVAATVTNSETPNMPLRGESPIRLVGYGSSDDSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.24
3 0.26
4 0.29
5 0.36
6 0.35
7 0.39
8 0.41
9 0.46
10 0.5
11 0.54
12 0.58
13 0.57
14 0.59
15 0.58
16 0.56
17 0.51
18 0.48
19 0.48
20 0.41
21 0.38
22 0.34
23 0.31
24 0.32
25 0.29
26 0.25
27 0.2
28 0.18
29 0.13
30 0.16
31 0.17
32 0.18
33 0.17
34 0.18
35 0.21
36 0.24
37 0.24
38 0.2
39 0.18
40 0.17
41 0.19
42 0.19
43 0.17
44 0.14
45 0.16
46 0.16
47 0.15
48 0.15
49 0.13
50 0.14
51 0.14
52 0.16
53 0.21
54 0.26
55 0.32
56 0.33
57 0.37
58 0.42
59 0.43
60 0.46
61 0.43
62 0.46
63 0.43
64 0.4
65 0.37
66 0.32
67 0.33
68 0.34
69 0.31
70 0.28
71 0.34
72 0.34
73 0.35
74 0.39
75 0.38
76 0.33
77 0.34
78 0.31
79 0.25
80 0.26
81 0.24
82 0.2
83 0.2
84 0.21
85 0.2
86 0.19
87 0.17
88 0.19
89 0.17
90 0.18
91 0.16
92 0.15
93 0.14
94 0.14
95 0.18
96 0.19
97 0.22
98 0.21
99 0.21
100 0.23
101 0.26
102 0.29
103 0.29
104 0.33
105 0.31
106 0.31
107 0.31
108 0.28
109 0.25
110 0.21
111 0.15
112 0.09
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.11
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.13
124 0.14
125 0.13
126 0.12
127 0.11
128 0.09
129 0.08
130 0.06
131 0.05
132 0.04
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.08
139 0.08
140 0.12
141 0.12
142 0.13
143 0.21
144 0.22
145 0.27
146 0.26
147 0.26
148 0.26
149 0.29
150 0.29
151 0.25
152 0.29
153 0.29
154 0.3
155 0.3
156 0.26
157 0.25
158 0.26
159 0.25
160 0.26
161 0.23
162 0.22
163 0.21
164 0.25
165 0.26
166 0.26
167 0.26
168 0.21
169 0.2
170 0.22
171 0.25
172 0.26
173 0.26
174 0.28
175 0.32
176 0.36
177 0.41
178 0.44
179 0.45
180 0.52
181 0.6
182 0.65
183 0.71
184 0.75
185 0.79
186 0.81
187 0.82
188 0.78
189 0.74
190 0.72
191 0.64
192 0.57
193 0.48
194 0.42
195 0.37
196 0.32
197 0.26
198 0.18
199 0.14
200 0.1
201 0.09
202 0.1
203 0.08
204 0.07
205 0.06
206 0.07
207 0.06
208 0.07
209 0.06
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.08
224 0.08
225 0.1
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.08
230 0.08
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.06
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.12
242 0.13
243 0.14
244 0.17
245 0.25
246 0.27
247 0.27
248 0.29
249 0.27
250 0.33
251 0.33
252 0.32
253 0.26
254 0.28
255 0.35
256 0.4
257 0.43
258 0.38
259 0.39
260 0.47
261 0.51
262 0.49
263 0.48
264 0.43
265 0.46
266 0.5
267 0.54
268 0.54
269 0.57
270 0.63
271 0.66
272 0.72
273 0.73
274 0.76
275 0.78
276 0.73
277 0.69
278 0.69
279 0.7
280 0.7
281 0.67
282 0.6
283 0.54
284 0.52
285 0.46
286 0.4
287 0.34
288 0.27
289 0.2
290 0.21
291 0.22
292 0.23
293 0.25
294 0.24
295 0.21
296 0.19
297 0.19
298 0.17
299 0.14
300 0.12
301 0.11
302 0.1
303 0.12
304 0.13
305 0.12
306 0.11
307 0.12
308 0.15
309 0.15
310 0.15
311 0.14
312 0.13
313 0.17
314 0.22
315 0.3
316 0.3
317 0.37
318 0.45
319 0.56
320 0.6
321 0.63
322 0.65
323 0.67
324 0.69
325 0.65
326 0.6
327 0.5
328 0.46
329 0.41
330 0.34
331 0.24
332 0.18
333 0.18
334 0.19
335 0.22
336 0.23
337 0.25
338 0.28
339 0.36
340 0.41
341 0.45
342 0.49
343 0.52
344 0.52
345 0.5
346 0.47
347 0.39
348 0.33
349 0.26
350 0.19
351 0.12
352 0.1
353 0.09
354 0.09
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.06
359 0.09
360 0.14
361 0.18
362 0.21
363 0.24
364 0.35
365 0.38
366 0.4
367 0.38
368 0.34
369 0.35
370 0.37
371 0.37
372 0.29
373 0.27
374 0.27
375 0.3
376 0.29
377 0.25
378 0.21
379 0.22
380 0.26
381 0.25
382 0.25
383 0.21
384 0.23
385 0.3
386 0.31
387 0.3
388 0.27
389 0.31
390 0.31
391 0.31
392 0.29
393 0.22
394 0.23
395 0.24