Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VQN1

Protein Details
Accession A0A1D2VQN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
233-259INSLSEKSSKKKNKKISTKKNRIWGDNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-253KSSKKKNKKISTKKN
Subcellular Location(s) nucl 7.5, pero 7, cyto_nucl 6.5, extr 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR013822  Signal_recog_particl_SRP54_hlx  
IPR036225  SRP/SRP_N  
IPR000897  SRP54_GTPase_dom  
IPR042101  SRP54_N_sf  
Gene Ontology GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF00448  SRP54  
PF02881  SRP54_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00300  SRP54  
Amino Acid Sequences MLSKILIFTDSGFILYKYEHQKVPDSIINHFIQSNLISSINRSNINSFKDNAPENDVHDNHTHNNESVNKSNTDGSDNIDDANLIETYTYKSYNLKYIKQHSMSLIFLIVYPNIISINIKTLSNFFKILKNLFLSLIHQNFNNDKIDLYYLFNLKNNKDFLRFQNLIQLKIKEFNNSFEKNQSPINDSFESENTAITTTTTTTITTTTTTTNNINNNNNSDNNILKDKINEKINSLSEKSSKKKNKKISTKKNRIWGDNYNIDRDDPISKSLDFSNDKDSSISNSNSTSNINSISPNSNSNSNSNSNMDLNNLNQNSIKNNFKNSQGFKTFKEINDEIDEIISSNINSNSDISSKNNKSSSSSASASTYLKPFSFLQNYIGGKTITNADITKTIELLNNHLIKKNVSPEIASKITLNIQKNLLGSKTRTWESVELTAKRSLAEELQKILTPNTSIDLLHEIQLKLNSKQKNPYVISIVGVNGVGKSTNLSKLAFWLLQNNLRVLICACDTFRSGAVEQLKTHVNNLKNLSIDEKIKNQIELFEGGYGGSDLVAKIAKSAINYAKENQFDVILMDTAGRRHNDARLMAPLQSFARAANPDKIIMVGEALVGTDSVQQARNFNKAFGADRTLDFFIISKCDTVGDLIGSMVNMVYATGIPILFVGIGQTYTDLRTLSVDWAVRMLMS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.2
4 0.25
5 0.3
6 0.32
7 0.34
8 0.41
9 0.42
10 0.48
11 0.45
12 0.4
13 0.37
14 0.41
15 0.39
16 0.34
17 0.31
18 0.25
19 0.22
20 0.2
21 0.2
22 0.15
23 0.16
24 0.14
25 0.17
26 0.23
27 0.26
28 0.28
29 0.28
30 0.31
31 0.35
32 0.41
33 0.42
34 0.38
35 0.38
36 0.41
37 0.43
38 0.4
39 0.41
40 0.36
41 0.37
42 0.43
43 0.4
44 0.37
45 0.36
46 0.37
47 0.34
48 0.38
49 0.36
50 0.28
51 0.33
52 0.36
53 0.39
54 0.43
55 0.43
56 0.39
57 0.38
58 0.41
59 0.36
60 0.34
61 0.29
62 0.26
63 0.26
64 0.25
65 0.23
66 0.2
67 0.18
68 0.14
69 0.16
70 0.11
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.11
75 0.13
76 0.14
77 0.13
78 0.17
79 0.2
80 0.29
81 0.34
82 0.37
83 0.44
84 0.51
85 0.6
86 0.58
87 0.59
88 0.54
89 0.52
90 0.46
91 0.38
92 0.3
93 0.2
94 0.18
95 0.16
96 0.12
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.13
105 0.13
106 0.14
107 0.14
108 0.17
109 0.21
110 0.23
111 0.25
112 0.21
113 0.25
114 0.29
115 0.3
116 0.31
117 0.29
118 0.28
119 0.27
120 0.26
121 0.24
122 0.28
123 0.29
124 0.26
125 0.24
126 0.27
127 0.27
128 0.29
129 0.28
130 0.21
131 0.17
132 0.18
133 0.2
134 0.18
135 0.18
136 0.19
137 0.19
138 0.21
139 0.24
140 0.27
141 0.27
142 0.31
143 0.32
144 0.31
145 0.33
146 0.36
147 0.38
148 0.43
149 0.42
150 0.37
151 0.43
152 0.42
153 0.41
154 0.41
155 0.39
156 0.31
157 0.36
158 0.36
159 0.34
160 0.33
161 0.35
162 0.38
163 0.39
164 0.39
165 0.38
166 0.39
167 0.34
168 0.37
169 0.33
170 0.3
171 0.29
172 0.33
173 0.29
174 0.28
175 0.28
176 0.25
177 0.27
178 0.21
179 0.2
180 0.14
181 0.13
182 0.12
183 0.1
184 0.1
185 0.07
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.11
194 0.11
195 0.12
196 0.14
197 0.16
198 0.2
199 0.24
200 0.28
201 0.32
202 0.33
203 0.35
204 0.36
205 0.34
206 0.32
207 0.29
208 0.26
209 0.23
210 0.23
211 0.21
212 0.18
213 0.22
214 0.22
215 0.26
216 0.31
217 0.29
218 0.28
219 0.32
220 0.35
221 0.34
222 0.34
223 0.31
224 0.31
225 0.37
226 0.39
227 0.44
228 0.51
229 0.57
230 0.65
231 0.72
232 0.77
233 0.81
234 0.89
235 0.9
236 0.91
237 0.92
238 0.89
239 0.88
240 0.82
241 0.76
242 0.7
243 0.66
244 0.61
245 0.58
246 0.54
247 0.47
248 0.42
249 0.37
250 0.32
251 0.26
252 0.22
253 0.15
254 0.15
255 0.14
256 0.14
257 0.15
258 0.16
259 0.2
260 0.2
261 0.21
262 0.26
263 0.25
264 0.25
265 0.24
266 0.24
267 0.21
268 0.23
269 0.22
270 0.16
271 0.16
272 0.17
273 0.17
274 0.18
275 0.15
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.11
280 0.12
281 0.14
282 0.14
283 0.16
284 0.16
285 0.19
286 0.2
287 0.21
288 0.23
289 0.22
290 0.23
291 0.22
292 0.22
293 0.19
294 0.18
295 0.18
296 0.15
297 0.14
298 0.18
299 0.17
300 0.16
301 0.16
302 0.16
303 0.17
304 0.2
305 0.25
306 0.2
307 0.25
308 0.26
309 0.3
310 0.36
311 0.36
312 0.39
313 0.4
314 0.41
315 0.38
316 0.42
317 0.4
318 0.34
319 0.38
320 0.32
321 0.28
322 0.28
323 0.27
324 0.21
325 0.17
326 0.16
327 0.09
328 0.09
329 0.07
330 0.04
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.09
338 0.1
339 0.12
340 0.2
341 0.22
342 0.25
343 0.27
344 0.26
345 0.28
346 0.3
347 0.31
348 0.27
349 0.26
350 0.23
351 0.23
352 0.24
353 0.22
354 0.21
355 0.18
356 0.14
357 0.13
358 0.14
359 0.14
360 0.17
361 0.19
362 0.18
363 0.19
364 0.24
365 0.24
366 0.22
367 0.23
368 0.18
369 0.15
370 0.15
371 0.14
372 0.09
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.11
377 0.12
378 0.12
379 0.1
380 0.11
381 0.12
382 0.12
383 0.15
384 0.19
385 0.22
386 0.23
387 0.24
388 0.24
389 0.23
390 0.25
391 0.27
392 0.23
393 0.19
394 0.2
395 0.2
396 0.25
397 0.25
398 0.23
399 0.18
400 0.16
401 0.2
402 0.25
403 0.24
404 0.21
405 0.21
406 0.22
407 0.23
408 0.23
409 0.2
410 0.17
411 0.18
412 0.19
413 0.23
414 0.22
415 0.22
416 0.24
417 0.25
418 0.25
419 0.3
420 0.32
421 0.29
422 0.31
423 0.32
424 0.29
425 0.27
426 0.25
427 0.18
428 0.17
429 0.2
430 0.18
431 0.19
432 0.2
433 0.21
434 0.21
435 0.2
436 0.17
437 0.13
438 0.12
439 0.11
440 0.1
441 0.09
442 0.1
443 0.13
444 0.13
445 0.14
446 0.18
447 0.16
448 0.17
449 0.21
450 0.23
451 0.22
452 0.28
453 0.31
454 0.31
455 0.39
456 0.42
457 0.47
458 0.46
459 0.46
460 0.44
461 0.39
462 0.36
463 0.29
464 0.25
465 0.16
466 0.14
467 0.11
468 0.07
469 0.06
470 0.06
471 0.05
472 0.06
473 0.08
474 0.11
475 0.13
476 0.14
477 0.13
478 0.16
479 0.19
480 0.19
481 0.17
482 0.19
483 0.21
484 0.25
485 0.27
486 0.25
487 0.23
488 0.22
489 0.22
490 0.17
491 0.15
492 0.11
493 0.11
494 0.12
495 0.11
496 0.12
497 0.13
498 0.14
499 0.15
500 0.14
501 0.19
502 0.23
503 0.24
504 0.23
505 0.25
506 0.28
507 0.25
508 0.29
509 0.29
510 0.27
511 0.31
512 0.35
513 0.35
514 0.31
515 0.32
516 0.31
517 0.29
518 0.31
519 0.28
520 0.29
521 0.32
522 0.32
523 0.33
524 0.3
525 0.28
526 0.25
527 0.24
528 0.2
529 0.15
530 0.14
531 0.12
532 0.11
533 0.1
534 0.07
535 0.05
536 0.05
537 0.04
538 0.05
539 0.07
540 0.06
541 0.07
542 0.09
543 0.1
544 0.1
545 0.16
546 0.22
547 0.26
548 0.28
549 0.32
550 0.36
551 0.36
552 0.37
553 0.31
554 0.26
555 0.21
556 0.19
557 0.16
558 0.11
559 0.09
560 0.09
561 0.1
562 0.11
563 0.15
564 0.15
565 0.17
566 0.19
567 0.23
568 0.27
569 0.29
570 0.3
571 0.32
572 0.33
573 0.32
574 0.3
575 0.28
576 0.24
577 0.23
578 0.2
579 0.15
580 0.18
581 0.2
582 0.23
583 0.27
584 0.27
585 0.26
586 0.26
587 0.26
588 0.22
589 0.18
590 0.15
591 0.09
592 0.07
593 0.07
594 0.06
595 0.06
596 0.05
597 0.05
598 0.07
599 0.08
600 0.1
601 0.14
602 0.16
603 0.21
604 0.24
605 0.32
606 0.31
607 0.31
608 0.32
609 0.3
610 0.33
611 0.32
612 0.34
613 0.28
614 0.28
615 0.32
616 0.3
617 0.27
618 0.24
619 0.22
620 0.18
621 0.19
622 0.19
623 0.15
624 0.14
625 0.14
626 0.14
627 0.14
628 0.14
629 0.11
630 0.1
631 0.1
632 0.1
633 0.09
634 0.08
635 0.07
636 0.05
637 0.05
638 0.04
639 0.05
640 0.04
641 0.05
642 0.06
643 0.06
644 0.06
645 0.06
646 0.07
647 0.06
648 0.06
649 0.06
650 0.05
651 0.06
652 0.06
653 0.08
654 0.08
655 0.1
656 0.11
657 0.11
658 0.11
659 0.13
660 0.14
661 0.15
662 0.19
663 0.2
664 0.19
665 0.2