Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VMM9

Protein Details
Accession A0A1D2VMM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-59FEDDMKQILRTKKKKRNQRIKIGHGGTLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-52RTKKKKRNQRIK
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
IPR032819  TruB_C  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF16198  TruB_C_2  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MNGVFAVFKPSGYSSSELVVKLKKIFQKSLLFEDDMKQILRTKKKKRNQRIKIGHGGTLDPEASGILIIGIGTGTKKLNLFLLKCTKVYEAEALLGATTNSGDQTGDLVIKNSTDHINKDFVHETVSKFVGNVIQTPSIYSALKMNGKPLYEYARQNIPLPSKIPERNVKIDYINLVESDLLSRDHDYKFIKYDKSYSNPLTNDPENQKNLNELLANELEQEKKNLTNSSNVNVDKLHFSDKYKEICKQKNIIDDSTTYKSIPITDENVYKETLLDNYRAPLLHFTTKVSSGTYIRSLITDIGKGLKSSAYMVKLTRTQQSDFTQDSCFHLDQFENLDEKIWGPILKKTITSDYGAVNVQKEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.22
3 0.25
4 0.24
5 0.26
6 0.28
7 0.28
8 0.3
9 0.35
10 0.38
11 0.41
12 0.45
13 0.49
14 0.54
15 0.55
16 0.58
17 0.56
18 0.52
19 0.47
20 0.45
21 0.41
22 0.34
23 0.3
24 0.24
25 0.26
26 0.33
27 0.42
28 0.49
29 0.56
30 0.65
31 0.74
32 0.84
33 0.88
34 0.91
35 0.91
36 0.93
37 0.92
38 0.91
39 0.92
40 0.83
41 0.76
42 0.66
43 0.56
44 0.46
45 0.37
46 0.28
47 0.17
48 0.14
49 0.1
50 0.08
51 0.07
52 0.06
53 0.03
54 0.03
55 0.03
56 0.03
57 0.03
58 0.03
59 0.03
60 0.05
61 0.06
62 0.08
63 0.08
64 0.09
65 0.14
66 0.2
67 0.21
68 0.27
69 0.36
70 0.36
71 0.37
72 0.38
73 0.35
74 0.31
75 0.31
76 0.26
77 0.18
78 0.17
79 0.16
80 0.14
81 0.12
82 0.11
83 0.09
84 0.06
85 0.05
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.05
92 0.06
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.13
101 0.13
102 0.16
103 0.17
104 0.22
105 0.22
106 0.26
107 0.25
108 0.21
109 0.23
110 0.23
111 0.22
112 0.2
113 0.21
114 0.17
115 0.15
116 0.16
117 0.15
118 0.13
119 0.14
120 0.13
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.15
125 0.14
126 0.13
127 0.12
128 0.11
129 0.14
130 0.18
131 0.18
132 0.2
133 0.21
134 0.21
135 0.22
136 0.21
137 0.24
138 0.24
139 0.26
140 0.25
141 0.27
142 0.28
143 0.29
144 0.31
145 0.27
146 0.24
147 0.24
148 0.25
149 0.26
150 0.28
151 0.31
152 0.34
153 0.36
154 0.4
155 0.4
156 0.38
157 0.33
158 0.31
159 0.27
160 0.21
161 0.17
162 0.11
163 0.1
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.07
171 0.09
172 0.09
173 0.13
174 0.14
175 0.15
176 0.19
177 0.22
178 0.23
179 0.22
180 0.27
181 0.28
182 0.3
183 0.34
184 0.33
185 0.34
186 0.33
187 0.35
188 0.34
189 0.31
190 0.32
191 0.31
192 0.33
193 0.31
194 0.31
195 0.29
196 0.25
197 0.25
198 0.21
199 0.17
200 0.12
201 0.13
202 0.12
203 0.12
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.12
208 0.13
209 0.11
210 0.12
211 0.15
212 0.17
213 0.17
214 0.21
215 0.23
216 0.25
217 0.3
218 0.28
219 0.27
220 0.24
221 0.24
222 0.2
223 0.2
224 0.21
225 0.16
226 0.18
227 0.24
228 0.29
229 0.34
230 0.35
231 0.41
232 0.46
233 0.52
234 0.56
235 0.56
236 0.55
237 0.57
238 0.58
239 0.53
240 0.46
241 0.4
242 0.4
243 0.37
244 0.34
245 0.25
246 0.22
247 0.2
248 0.19
249 0.2
250 0.17
251 0.16
252 0.19
253 0.23
254 0.24
255 0.25
256 0.24
257 0.22
258 0.19
259 0.17
260 0.17
261 0.15
262 0.15
263 0.14
264 0.15
265 0.17
266 0.17
267 0.17
268 0.17
269 0.19
270 0.23
271 0.23
272 0.24
273 0.25
274 0.27
275 0.27
276 0.24
277 0.23
278 0.19
279 0.21
280 0.22
281 0.2
282 0.18
283 0.18
284 0.18
285 0.18
286 0.18
287 0.16
288 0.14
289 0.17
290 0.17
291 0.17
292 0.17
293 0.15
294 0.14
295 0.16
296 0.2
297 0.19
298 0.21
299 0.22
300 0.25
301 0.3
302 0.32
303 0.36
304 0.35
305 0.35
306 0.39
307 0.42
308 0.44
309 0.41
310 0.4
311 0.36
312 0.33
313 0.35
314 0.34
315 0.3
316 0.24
317 0.24
318 0.22
319 0.21
320 0.25
321 0.24
322 0.2
323 0.2
324 0.2
325 0.18
326 0.18
327 0.18
328 0.16
329 0.15
330 0.15
331 0.2
332 0.25
333 0.26
334 0.28
335 0.31
336 0.35
337 0.35
338 0.37
339 0.34
340 0.3
341 0.31
342 0.32
343 0.3