FuNGI

C1FZ78

Protein Details

Accession

C1FZ78

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
367-402	ALTPAPPKPKTKKKEKKKKKKKKKRVAIQDPRSKLQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
372-392	PPKPKTKKKEKKKKKKKKKRV

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 7, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
KEGG	pbn:PADG_01104 -
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKSTNARGRPAASSRRTAGPTDSSSATPTSGPSNTTTNPNNPPISPSLSEPRSRNAPSASATPTTRGGVQRLQSLKKRAPTGSLVPLNPDGTAPKPTLRYQPRGGGEEVNEYKHYFSVALMNLARSGDLWRVRAMGSTIWLVRGGVISGGDGSGLLGSGISTWGRGGGRMKFGNGGRSGAERAHGLVTAKSEEGGKGESRDVSSDEESGGGPRFSIEQINIISDEEEEAGWEDNVELEEGKRKMPAKGSLSGGLGRGLRPIRVERQEHQERSVGVNTDSSLHKSAELRRQAKAKEKHGGDESLFVQDSEDEDAESVIESEEEVEITSENALGRAAQSEVRIKQEPTEDGDVLMVDTLPQATGDSALTPAPPKPKTKKKEKKKKKKKKKRVAIQDPRSKLQTEEERQEWDLHEQDIEHIKQTLGTITTHDKPAEGEEAAGREDEDKALEAPKDERSGRLFLIQFPPMTPNLIAQTPAADAMDQDVVETGAQTTTTQNPAIPSIKKEDTDNLAILKPTSVINNNTNGVSQFITAVNSSLPPGRVGKLNIHQSGRATIDWGGISFDLTKGSDVDFLQDAIVASEGNPKVSGEDDGTSLEEPRETLVWAMSQVTGKFVVTPDWEVLLGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.61
3	0.57
4	0.58
5	0.57
6	0.52
7	0.48
8	0.45
9	0.44
10	0.42
11	0.4
12	0.34
13	0.33
14	0.32
15	0.28
16	0.22
17	0.19
18	0.2
19	0.19
20	0.2
21	0.2
22	0.25
23	0.26
24	0.33
25	0.36
26	0.39
27	0.44
28	0.49
29	0.49
30	0.44
31	0.46
32	0.43
33	0.44
34	0.38
35	0.37
36	0.39
37	0.41
38	0.47
39	0.45
40	0.46
41	0.49
42	0.49
43	0.49
44	0.43
45	0.42
46	0.39
47	0.42
48	0.4
49	0.36
50	0.35
51	0.33
52	0.32
53	0.3
54	0.31
55	0.29
56	0.29
57	0.3
58	0.32
59	0.37
60	0.42
61	0.48
62	0.5
63	0.56
64	0.58
65	0.59
66	0.62
67	0.56
68	0.54
69	0.53
70	0.51
71	0.53
72	0.52
73	0.46
74	0.44
75	0.44
76	0.4
77	0.34
78	0.28
79	0.21
80	0.18
81	0.21
82	0.19
83	0.2
84	0.24
85	0.27
86	0.37
87	0.42
88	0.47
89	0.49
90	0.56
91	0.56
92	0.56
93	0.54
94	0.48
95	0.41
96	0.43
97	0.4
98	0.34
99	0.31
100	0.28
101	0.26
102	0.23
103	0.22
104	0.13
105	0.12
106	0.15
107	0.15
108	0.19
109	0.19
110	0.19
111	0.19
112	0.19
113	0.18
114	0.12
115	0.13
116	0.14
117	0.17
118	0.18
119	0.18
120	0.19
121	0.19
122	0.2
123	0.2
124	0.14
125	0.13
126	0.15
127	0.15
128	0.14
129	0.14
130	0.13
131	0.12
132	0.11
133	0.09
134	0.07
135	0.06
136	0.06
137	0.05
138	0.05
139	0.05
140	0.04
141	0.04
142	0.03
143	0.03
144	0.03
145	0.02
146	0.03
147	0.03
148	0.04
149	0.04
150	0.04
151	0.04
152	0.07
153	0.07
154	0.1
155	0.13
156	0.16
157	0.23
158	0.23
159	0.24
160	0.27
161	0.28
162	0.32
163	0.29
164	0.27
165	0.22
166	0.23
167	0.24
168	0.19
169	0.18
170	0.13
171	0.13
172	0.12
173	0.12
174	0.11
175	0.11
176	0.12
177	0.12
178	0.12
179	0.11
180	0.11
181	0.1
182	0.1
183	0.12
184	0.11
185	0.11
186	0.13
187	0.14
188	0.14
189	0.14
190	0.15
191	0.16
192	0.16
193	0.15
194	0.14
195	0.13
196	0.12
197	0.13
198	0.12
199	0.09
200	0.07
201	0.07
202	0.08
203	0.08
204	0.1
205	0.09
206	0.11
207	0.11
208	0.12
209	0.12
210	0.11
211	0.11
212	0.09
213	0.09
214	0.07
215	0.06
216	0.05
217	0.06
218	0.06
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.04
227	0.11
228	0.11
229	0.12
230	0.15
231	0.17
232	0.19
233	0.24
234	0.3
235	0.29
236	0.32
237	0.34
238	0.33
239	0.32
240	0.31
241	0.26
242	0.21
243	0.17
244	0.13
245	0.15
246	0.13
247	0.13
248	0.14
249	0.17
250	0.22
251	0.28
252	0.31
253	0.31
254	0.4
255	0.48
256	0.48
257	0.47
258	0.43
259	0.37
260	0.36
261	0.35
262	0.26
263	0.18
264	0.17
265	0.15
266	0.15
267	0.14
268	0.14
269	0.13
270	0.12
271	0.13
272	0.15
273	0.21
274	0.26
275	0.35
276	0.35
277	0.36
278	0.41
279	0.43
280	0.5
281	0.51
282	0.49
283	0.49
284	0.47
285	0.48
286	0.45
287	0.43
288	0.34
289	0.29
290	0.24
291	0.18
292	0.17
293	0.13
294	0.11
295	0.09
296	0.09
297	0.08
298	0.07
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.04
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.03
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.05
323	0.05
324	0.06
325	0.08
326	0.12
327	0.13
328	0.17
329	0.19
330	0.18
331	0.2
332	0.22
333	0.22
334	0.22
335	0.24
336	0.2
337	0.18
338	0.18
339	0.15
340	0.12
341	0.11
342	0.07
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.05
354	0.05
355	0.06
356	0.07
357	0.09
358	0.15
359	0.18
360	0.25
361	0.34
362	0.44
363	0.52
364	0.63
365	0.71
366	0.77
367	0.85
368	0.9
369	0.92
370	0.94
371	0.97
372	0.97
373	0.98
374	0.98
375	0.98
376	0.97
377	0.96
378	0.96
379	0.96
380	0.96
381	0.94
382	0.92
383	0.85
384	0.76
385	0.67
386	0.56
387	0.46
388	0.42
389	0.41
390	0.37
391	0.38
392	0.37
393	0.38
394	0.38
395	0.39
396	0.33
397	0.26
398	0.23
399	0.18
400	0.16
401	0.13
402	0.15
403	0.19
404	0.18
405	0.16
406	0.15
407	0.14
408	0.15
409	0.15
410	0.14
411	0.1
412	0.1
413	0.11
414	0.15
415	0.18
416	0.19
417	0.19
418	0.18
419	0.17
420	0.19
421	0.19
422	0.14
423	0.13
424	0.11
425	0.12
426	0.12
427	0.12
428	0.1
429	0.08
430	0.08
431	0.08
432	0.08
433	0.07
434	0.08
435	0.1
436	0.11
437	0.11
438	0.13
439	0.16
440	0.2
441	0.2
442	0.22
443	0.23
444	0.26
445	0.25
446	0.29
447	0.27
448	0.26
449	0.3
450	0.29
451	0.26
452	0.24
453	0.26
454	0.2
455	0.22
456	0.18
457	0.15
458	0.15
459	0.15
460	0.15
461	0.13
462	0.13
463	0.12
464	0.12
465	0.1
466	0.07
467	0.07
468	0.08
469	0.09
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.06
477	0.05
478	0.05
479	0.06
480	0.08
481	0.11
482	0.13
483	0.14
484	0.15
485	0.16
486	0.2
487	0.24
488	0.24
489	0.24
490	0.29
491	0.32
492	0.32
493	0.33
494	0.34
495	0.34
496	0.35
497	0.33
498	0.28
499	0.27
500	0.26
501	0.24
502	0.19
503	0.15
504	0.12
505	0.15
506	0.17
507	0.2
508	0.24
509	0.28
510	0.29
511	0.29
512	0.29
513	0.25
514	0.23
515	0.18
516	0.15
517	0.12
518	0.11
519	0.12
520	0.11
521	0.12
522	0.1
523	0.1
524	0.11
525	0.13
526	0.13
527	0.14
528	0.16
529	0.17
530	0.21
531	0.24
532	0.3
533	0.35
534	0.43
535	0.47
536	0.47
537	0.47
538	0.44
539	0.46
540	0.41
541	0.33
542	0.26
543	0.21
544	0.21
545	0.19
546	0.18
547	0.15
548	0.12
549	0.13
550	0.12
551	0.11
552	0.1
553	0.11
554	0.11
555	0.1
556	0.11
557	0.14
558	0.13
559	0.16
560	0.15
561	0.15
562	0.14
563	0.14
564	0.13
565	0.1
566	0.1
567	0.07
568	0.07
569	0.15
570	0.15
571	0.16
572	0.16
573	0.16
574	0.16
575	0.18
576	0.2
577	0.14
578	0.15
579	0.15
580	0.16
581	0.17
582	0.17
583	0.17
584	0.15
585	0.13
586	0.12
587	0.13
588	0.12
589	0.11
590	0.12
591	0.12
592	0.12
593	0.13
594	0.14
595	0.14
596	0.17
597	0.16
598	0.18
599	0.17
600	0.16
601	0.17
602	0.16
603	0.18
604	0.18
605	0.21
606	0.2
607	0.21

C1FZ78

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer