Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VIT1

Protein Details
Accession A0A1D2VIT1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
296-355IIDRNTRRSRKISKRRDSRQQKRTLRRLQASERRIKKEAELRKLQRKQKIKSFFKFVKNIHydrophilic
367-389VVYVYIKVQMRNKKRQYKNVGLLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
302-346RRSRKISKRRDSRQQKRTLRRLQASERRIKKEAELRKLQRKQKIK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.333, cyto 5, cyto_mito 3.833, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013320  ConA-like_dom_sf  
IPR005052  Lectin_leg  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0030246  F:carbohydrate binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03388  Lectin_leg-like  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51328  L_LECTIN_LIKE  
CDD cd07308  lectin_leg-like  
Amino Acid Sequences FGSNSINSFSNEELNSILGGHSRNLKIIKKIENPKFNLKSPYLKNDLSGETSPNWNFNGDILIRNNKYVRLTSEQKHQSSRVFSNSKINETSFELEFYLSINGKGMVNGLHGDGMAIFLSTEQLGKGPVMGAQENFNGLSIIVDTYKNGRAGVFPYVQAWLNDGTQSYDKDNDGKANEITGCVGRSLWNPKQGVVKARLFYVQDGYISLDFDYRNDENWKNCFTLQDIFLPKDFYLGFSAQTGDLYQNVDLVETHLYSLYKFNDEPIDEFNDLLQIMSDPDPNSPDKFEDAIEEVIIDRNTRRSRKISKRRDSRQQKRTLRRLQASERRIKKEAELRKLQRKQKIKSFFKFVKNILLFIIASFILYVVYVYIKVQMRNKKRQYKNVGLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.15
4 0.13
5 0.11
6 0.12
7 0.13
8 0.2
9 0.2
10 0.25
11 0.31
12 0.35
13 0.41
14 0.47
15 0.54
16 0.56
17 0.66
18 0.71
19 0.74
20 0.76
21 0.79
22 0.77
23 0.73
24 0.71
25 0.65
26 0.65
27 0.62
28 0.64
29 0.6
30 0.55
31 0.52
32 0.49
33 0.46
34 0.42
35 0.37
36 0.32
37 0.27
38 0.33
39 0.31
40 0.29
41 0.27
42 0.22
43 0.21
44 0.18
45 0.21
46 0.16
47 0.2
48 0.22
49 0.3
50 0.3
51 0.33
52 0.34
53 0.32
54 0.34
55 0.32
56 0.33
57 0.33
58 0.39
59 0.39
60 0.48
61 0.53
62 0.55
63 0.57
64 0.55
65 0.52
66 0.51
67 0.52
68 0.51
69 0.45
70 0.43
71 0.49
72 0.48
73 0.47
74 0.43
75 0.4
76 0.33
77 0.33
78 0.35
79 0.25
80 0.23
81 0.19
82 0.16
83 0.16
84 0.14
85 0.13
86 0.1
87 0.1
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.07
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.05
103 0.04
104 0.03
105 0.03
106 0.04
107 0.04
108 0.05
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.05
115 0.07
116 0.08
117 0.09
118 0.1
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.08
125 0.07
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.09
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.14
139 0.17
140 0.16
141 0.13
142 0.13
143 0.15
144 0.15
145 0.14
146 0.13
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.1
152 0.11
153 0.12
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.14
158 0.15
159 0.16
160 0.16
161 0.16
162 0.15
163 0.15
164 0.14
165 0.12
166 0.12
167 0.1
168 0.09
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.1
173 0.17
174 0.19
175 0.24
176 0.24
177 0.26
178 0.31
179 0.32
180 0.34
181 0.33
182 0.33
183 0.28
184 0.28
185 0.29
186 0.24
187 0.22
188 0.19
189 0.14
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.07
198 0.08
199 0.12
200 0.11
201 0.13
202 0.17
203 0.19
204 0.21
205 0.24
206 0.26
207 0.23
208 0.23
209 0.22
210 0.19
211 0.2
212 0.18
213 0.21
214 0.21
215 0.21
216 0.21
217 0.22
218 0.19
219 0.18
220 0.17
221 0.12
222 0.13
223 0.12
224 0.12
225 0.11
226 0.12
227 0.1
228 0.1
229 0.09
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.12
246 0.12
247 0.13
248 0.13
249 0.15
250 0.17
251 0.18
252 0.19
253 0.18
254 0.22
255 0.19
256 0.19
257 0.18
258 0.15
259 0.14
260 0.12
261 0.1
262 0.05
263 0.07
264 0.08
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.13
269 0.15
270 0.17
271 0.16
272 0.17
273 0.17
274 0.18
275 0.17
276 0.17
277 0.17
278 0.17
279 0.15
280 0.13
281 0.11
282 0.13
283 0.13
284 0.11
285 0.1
286 0.18
287 0.26
288 0.3
289 0.35
290 0.41
291 0.52
292 0.63
293 0.73
294 0.76
295 0.79
296 0.86
297 0.9
298 0.92
299 0.93
300 0.93
301 0.92
302 0.91
303 0.91
304 0.91
305 0.92
306 0.91
307 0.9
308 0.87
309 0.85
310 0.85
311 0.84
312 0.83
313 0.82
314 0.81
315 0.77
316 0.72
317 0.66
318 0.63
319 0.62
320 0.63
321 0.62
322 0.64
323 0.66
324 0.74
325 0.82
326 0.82
327 0.82
328 0.83
329 0.82
330 0.81
331 0.84
332 0.83
333 0.81
334 0.83
335 0.82
336 0.81
337 0.8
338 0.72
339 0.71
340 0.62
341 0.55
342 0.46
343 0.4
344 0.31
345 0.23
346 0.23
347 0.12
348 0.11
349 0.1
350 0.09
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.04
355 0.05
356 0.06
357 0.06
358 0.13
359 0.17
360 0.22
361 0.3
362 0.4
363 0.5
364 0.6
365 0.71
366 0.75
367 0.81
368 0.87
369 0.89