Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VPB0

Protein Details
Accession A0A1D2VPB0    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-68GEKHQDRRRNKGSSHNRRGVSKNPRGFNSRSPRPRPRSRSRPRSRPRVSASPIBasic
178-199RSRGRPRGPRGRFNENKRRPAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-62DRRRNKGSSHNRRGVSKNPRGFNSRSPRPRPRSRSRPRSRPR
176-200SFRSRGRPRGPRGRFNENKRRPAEN
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0051028  P:mRNA transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF13865  FoP_duplication  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12418  RRM_Aly_REF_like  
Amino Acid Sequences MSNSSILEKTLDEIIGEKHQDRRRNKGSSHNRRGVSKNPRGFNSRSPRPRPRSRSRPRSRPRVSASPIEEIRPSELESLSERTPYLKVKNLHYDLTQKDLTELFERIAPVKFTRIQYNTSGGSTGVAYVCFTDPSFNNLAIEKYDGKKAAGQIISVQNGVPLKDRLSSPVPRQPASFRSRGRPRGPRGRFNENKRRPAENRKTLEDLDDELSNYMNGERNQTEPNPDALNGNDNLNQVTKDTSGLDAELDSYMNETSTNTRFPAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.19
3 0.22
4 0.22
5 0.29
6 0.36
7 0.45
8 0.49
9 0.57
10 0.6
11 0.66
12 0.68
13 0.7
14 0.75
15 0.77
16 0.82
17 0.8
18 0.75
19 0.73
20 0.74
21 0.73
22 0.72
23 0.71
24 0.68
25 0.66
26 0.66
27 0.66
28 0.65
29 0.65
30 0.64
31 0.65
32 0.67
33 0.7
34 0.77
35 0.8
36 0.87
37 0.86
38 0.87
39 0.88
40 0.89
41 0.91
42 0.91
43 0.93
44 0.92
45 0.93
46 0.89
47 0.88
48 0.84
49 0.83
50 0.77
51 0.74
52 0.68
53 0.64
54 0.58
55 0.5
56 0.43
57 0.34
58 0.32
59 0.25
60 0.22
61 0.16
62 0.15
63 0.15
64 0.16
65 0.19
66 0.16
67 0.16
68 0.15
69 0.15
70 0.17
71 0.2
72 0.21
73 0.24
74 0.27
75 0.32
76 0.41
77 0.42
78 0.42
79 0.4
80 0.42
81 0.37
82 0.39
83 0.34
84 0.24
85 0.23
86 0.21
87 0.21
88 0.17
89 0.16
90 0.11
91 0.12
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.13
96 0.11
97 0.14
98 0.18
99 0.18
100 0.24
101 0.25
102 0.27
103 0.27
104 0.3
105 0.28
106 0.24
107 0.22
108 0.15
109 0.14
110 0.11
111 0.09
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.07
120 0.07
121 0.1
122 0.12
123 0.11
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.11
128 0.13
129 0.11
130 0.11
131 0.14
132 0.14
133 0.14
134 0.15
135 0.16
136 0.2
137 0.18
138 0.16
139 0.18
140 0.2
141 0.21
142 0.19
143 0.17
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.12
148 0.1
149 0.1
150 0.12
151 0.13
152 0.15
153 0.2
154 0.24
155 0.27
156 0.33
157 0.35
158 0.34
159 0.36
160 0.36
161 0.38
162 0.39
163 0.42
164 0.39
165 0.45
166 0.54
167 0.61
168 0.65
169 0.67
170 0.7
171 0.74
172 0.77
173 0.77
174 0.75
175 0.77
176 0.77
177 0.78
178 0.8
179 0.78
180 0.81
181 0.76
182 0.77
183 0.73
184 0.76
185 0.77
186 0.75
187 0.72
188 0.68
189 0.68
190 0.6
191 0.56
192 0.46
193 0.38
194 0.3
195 0.25
196 0.2
197 0.16
198 0.15
199 0.13
200 0.11
201 0.1
202 0.12
203 0.12
204 0.17
205 0.18
206 0.2
207 0.25
208 0.26
209 0.3
210 0.27
211 0.3
212 0.27
213 0.26
214 0.25
215 0.22
216 0.25
217 0.2
218 0.21
219 0.21
220 0.2
221 0.2
222 0.2
223 0.19
224 0.16
225 0.17
226 0.15
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.14
231 0.14
232 0.13
233 0.11
234 0.11
235 0.1
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.13
244 0.16
245 0.19