Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GDZ4

Protein Details
Accession C1GDZ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-83SPTPADNRSRRRLHRLRKKEYFLRKQKPKPLSAREKRITBasic
216-236QFENRPVDRANKKFKWKNLDYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-81RSRRRLHRLRKKEYFLRKQKPKPLSAREKR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13.5, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016848  RNase_P/MRP_Rpp29-subunit  
IPR036980  RNase_P/MRP_Rpp29_sf  
IPR023538  RNP1  
IPR023534  Rof/RNase_P-like  
IPR002730  Rpp29/RNP1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0030677  C:ribonuclease P complex  
GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0033204  F:ribonuclease P RNA binding  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
KEGG pbn:PADG_05480  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01868  RNase_P-MRP_p29  
Amino Acid Sequences MADFASNTRVHIAEQLISRAHSPDTACDLFTERVKQKPLFLRPTSPTPADNRSRRRLHRLRKKEYFLRKQKPKPLSAREKRITGIYDLPKEEIKYDVFKGLHKMWIEYMQDVLDLKRDKSQVFINPLVHGSQLSSADFHGAELEVVRSRCVSRVGVKGIVVRDSKFTFVVVTEKDEAKTIPKEHTIFRFQIPLPACDGEDVKGEHKNLTFELHGSQFENRPVDRANKKFKWKNLDYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.24
3 0.22
4 0.23
5 0.23
6 0.21
7 0.2
8 0.18
9 0.17
10 0.18
11 0.24
12 0.24
13 0.23
14 0.23
15 0.26
16 0.26
17 0.28
18 0.33
19 0.29
20 0.34
21 0.4
22 0.4
23 0.43
24 0.5
25 0.56
26 0.57
27 0.57
28 0.58
29 0.57
30 0.63
31 0.6
32 0.53
33 0.47
34 0.43
35 0.47
36 0.5
37 0.54
38 0.55
39 0.59
40 0.66
41 0.69
42 0.75
43 0.78
44 0.79
45 0.82
46 0.84
47 0.85
48 0.86
49 0.88
50 0.87
51 0.87
52 0.87
53 0.87
54 0.87
55 0.87
56 0.86
57 0.87
58 0.85
59 0.82
60 0.81
61 0.8
62 0.81
63 0.8
64 0.81
65 0.76
66 0.71
67 0.63
68 0.56
69 0.48
70 0.39
71 0.37
72 0.32
73 0.31
74 0.29
75 0.3
76 0.28
77 0.27
78 0.24
79 0.19
80 0.15
81 0.15
82 0.15
83 0.19
84 0.18
85 0.19
86 0.22
87 0.21
88 0.24
89 0.21
90 0.21
91 0.17
92 0.21
93 0.21
94 0.17
95 0.16
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.1
101 0.11
102 0.11
103 0.14
104 0.16
105 0.16
106 0.17
107 0.21
108 0.21
109 0.25
110 0.28
111 0.25
112 0.24
113 0.25
114 0.23
115 0.19
116 0.14
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.11
137 0.13
138 0.14
139 0.17
140 0.22
141 0.25
142 0.25
143 0.26
144 0.27
145 0.26
146 0.29
147 0.25
148 0.2
149 0.21
150 0.2
151 0.21
152 0.18
153 0.17
154 0.13
155 0.12
156 0.16
157 0.13
158 0.16
159 0.17
160 0.18
161 0.18
162 0.18
163 0.18
164 0.19
165 0.23
166 0.21
167 0.23
168 0.28
169 0.3
170 0.33
171 0.39
172 0.4
173 0.37
174 0.37
175 0.39
176 0.33
177 0.38
178 0.35
179 0.3
180 0.29
181 0.27
182 0.25
183 0.21
184 0.22
185 0.16
186 0.18
187 0.18
188 0.17
189 0.2
190 0.21
191 0.23
192 0.24
193 0.25
194 0.22
195 0.24
196 0.23
197 0.19
198 0.22
199 0.21
200 0.21
201 0.21
202 0.23
203 0.24
204 0.28
205 0.31
206 0.28
207 0.29
208 0.31
209 0.39
210 0.45
211 0.5
212 0.56
213 0.6
214 0.71
215 0.76
216 0.81
217 0.82