FuNGI

A0A1D2VC56

Protein Details

Accession

A0A1D2VC56

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
198-220	TDSVEKTKRRRGGRKHREKEAML	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
179-216	KKDEKKDGKKNEEKEGIKLTDSVEKTKRRRGGRKHREK
508-511	RRRK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039907 NOB1 IPR017117 Nob1_euk IPR036283 NOB1_Zf-like_sf IPR014881 NOB1_Zn-bd IPR002716 PIN_dom IPR033411 Ribonuclease_PIN
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0046872 F:metal ion binding GO:0004521 F:RNA endonuclease activity GO:0000469 P:cleavage involved in rRNA processing GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF08772 NOB1_Zn_bind PF17146 PIN_6
CDD	cd09876 PIN_Nob1-like

Amino Acid Sequences

MDEKNQKNQNETAVVGNTTGEVHPPSETQGQSEPEIPSINSLVLDAGPLITQNIGSFKQYAQNIFTTPAVFNEVKDENARRNLELHKDLIKIRQPKPEFVKKVLNFSKLTGDYNVLSINDIHIIALTYELEVELNKGDWRLRQYPGEVKNRPVKKSVDKNESIKKENKNQTKFDINDEKKDEKKDGKKNEEKEGIKLTDSVEKTKRRRGGRKHREKEAMLKDGFQIQFQKSSKNSQKIADIKINDRSSEKDKDQENKKDTTTEDEHDSDDEGEWITSESIQQEIIKEQEGEILFRNRNKKVIAKKVAVKAALASGDFAVQNVALQINLNLMNSMNGLKINRVRNYMLRCHGCFYLIPYNQEKKVNHKLQFCPRCGGATILRCLVSVDSSTGKVTPLLKKNFEWHKRGNKYSMSSPLSKNHLKKYGKSGFQHNKVNRKYEVPLLREDQKEYQQAIKDEDWSKRQNIKMLEQWIGGSDINPFAIDNSLRYHDQHSGGVRVNRGRYANASRRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.28
3	0.24
4	0.18
5	0.16
6	0.15
7	0.13
8	0.12
9	0.12
10	0.13
11	0.14
12	0.18
13	0.23
14	0.23
15	0.24
16	0.28
17	0.3
18	0.31
19	0.35
20	0.31
21	0.26
22	0.28
23	0.25
24	0.22
25	0.2
26	0.18
27	0.14
28	0.13
29	0.12
30	0.09
31	0.1
32	0.07
33	0.06
34	0.06
35	0.06
36	0.06
37	0.06
38	0.06
39	0.07
40	0.1
41	0.11
42	0.13
43	0.14
44	0.15
45	0.21
46	0.24
47	0.26
48	0.26
49	0.27
50	0.26
51	0.27
52	0.27
53	0.23
54	0.2
55	0.18
56	0.21
57	0.19
58	0.18
59	0.21
60	0.21
61	0.21
62	0.26
63	0.28
64	0.29
65	0.36
66	0.38
67	0.34
68	0.37
69	0.4
70	0.43
71	0.43
72	0.41
73	0.37
74	0.39
75	0.4
76	0.43
77	0.46
78	0.47
79	0.49
80	0.55
81	0.54
82	0.59
83	0.66
84	0.69
85	0.66
86	0.63
87	0.68
88	0.6
89	0.68
90	0.65
91	0.62
92	0.52
93	0.48
94	0.5
95	0.41
96	0.41
97	0.32
98	0.29
99	0.23
100	0.23
101	0.23
102	0.15
103	0.14
104	0.12
105	0.11
106	0.1
107	0.09
108	0.08
109	0.07
110	0.07
111	0.06
112	0.07
113	0.06
114	0.05
115	0.05
116	0.05
117	0.05
118	0.05
119	0.05
120	0.05
121	0.06
122	0.07
123	0.08
124	0.1
125	0.13
126	0.19
127	0.23
128	0.26
129	0.28
130	0.32
131	0.39
132	0.46
133	0.53
134	0.49
135	0.51
136	0.56
137	0.6
138	0.58
139	0.55
140	0.52
141	0.52
142	0.6
143	0.64
144	0.64
145	0.63
146	0.68
147	0.72
148	0.71
149	0.67
150	0.64
151	0.61
152	0.63
153	0.66
154	0.69
155	0.67
156	0.65
157	0.64
158	0.65
159	0.6
160	0.57
161	0.59
162	0.51
163	0.52
164	0.54
165	0.53
166	0.49
167	0.5
168	0.48
169	0.46
170	0.53
171	0.56
172	0.6
173	0.66
174	0.7
175	0.72
176	0.75
177	0.75
178	0.66
179	0.61
180	0.57
181	0.47
182	0.39
183	0.36
184	0.28
185	0.26
186	0.26
187	0.27
188	0.28
189	0.35
190	0.39
191	0.46
192	0.52
193	0.54
194	0.63
195	0.69
196	0.74
197	0.77
198	0.84
199	0.84
200	0.85
201	0.83
202	0.75
203	0.74
204	0.69
205	0.65
206	0.54
207	0.48
208	0.39
209	0.38
210	0.36
211	0.27
212	0.24
213	0.17
214	0.24
215	0.24
216	0.28
217	0.23
218	0.33
219	0.39
220	0.42
221	0.44
222	0.38
223	0.45
224	0.46
225	0.48
226	0.44
227	0.38
228	0.35
229	0.4
230	0.39
231	0.32
232	0.28
233	0.27
234	0.27
235	0.31
236	0.29
237	0.27
238	0.31
239	0.38
240	0.46
241	0.51
242	0.5
243	0.47
244	0.47
245	0.43
246	0.39
247	0.38
248	0.32
249	0.26
250	0.26
251	0.24
252	0.23
253	0.21
254	0.21
255	0.15
256	0.12
257	0.1
258	0.07
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.04
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.07
271	0.08
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.11
276	0.11
277	0.11
278	0.13
279	0.17
280	0.18
281	0.22
282	0.28
283	0.25
284	0.28
285	0.3
286	0.35
287	0.39
288	0.48
289	0.51
290	0.51
291	0.57
292	0.59
293	0.6
294	0.53
295	0.44
296	0.34
297	0.28
298	0.23
299	0.16
300	0.11
301	0.07
302	0.08
303	0.08
304	0.07
305	0.06
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.07
319	0.07
320	0.08
321	0.06
322	0.07
323	0.08
324	0.11
325	0.17
326	0.23
327	0.26
328	0.29
329	0.31
330	0.35
331	0.4
332	0.43
333	0.45
334	0.44
335	0.42
336	0.42
337	0.39
338	0.35
339	0.3
340	0.29
341	0.3
342	0.28
343	0.3
344	0.34
345	0.38
346	0.41
347	0.47
348	0.43
349	0.42
350	0.5
351	0.55
352	0.55
353	0.58
354	0.63
355	0.67
356	0.74
357	0.68
358	0.61
359	0.53
360	0.49
361	0.42
362	0.38
363	0.33
364	0.29
365	0.29
366	0.27
367	0.27
368	0.25
369	0.24
370	0.21
371	0.16
372	0.12
373	0.11
374	0.11
375	0.12
376	0.13
377	0.12
378	0.12
379	0.14
380	0.18
381	0.25
382	0.32
383	0.37
384	0.4
385	0.42
386	0.5
387	0.58
388	0.61
389	0.6
390	0.61
391	0.66
392	0.71
393	0.74
394	0.72
395	0.68
396	0.65
397	0.64
398	0.63
399	0.57
400	0.54
401	0.52
402	0.51
403	0.52
404	0.55
405	0.55
406	0.54
407	0.59
408	0.58
409	0.59
410	0.64
411	0.66
412	0.66
413	0.65
414	0.67
415	0.68
416	0.72
417	0.77
418	0.74
419	0.75
420	0.72
421	0.75
422	0.67
423	0.61
424	0.56
425	0.55
426	0.56
427	0.49
428	0.49
429	0.48
430	0.53
431	0.5
432	0.51
433	0.48
434	0.46
435	0.48
436	0.44
437	0.45
438	0.43
439	0.43
440	0.44
441	0.4
442	0.41
443	0.41
444	0.44
445	0.45
446	0.45
447	0.5
448	0.52
449	0.54
450	0.54
451	0.54
452	0.55
453	0.55
454	0.55
455	0.52
456	0.45
457	0.41
458	0.36
459	0.33
460	0.26
461	0.18
462	0.15
463	0.13
464	0.12
465	0.12
466	0.11
467	0.09
468	0.13
469	0.13
470	0.13
471	0.16
472	0.2
473	0.22
474	0.24
475	0.27
476	0.29
477	0.31
478	0.35
479	0.34
480	0.35
481	0.4
482	0.43
483	0.45
484	0.46
485	0.46
486	0.47
487	0.45
488	0.43
489	0.44
490	0.5
491	0.54

A0A1D2VC56

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer