Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VPA4

Protein Details
Accession A0A1D2VPA4    Localization Confidence Low Confidence Score 7.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
329-353MEIISSKKNAKRRNKALTGKVCSECHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 8.5, cyto_nucl 6, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR006145  PsdUridine_synth_RsuA/RluA  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF00849  PseudoU_synth_2  
CDD cd02557  PseudoU_synth_ScRIB2  
Amino Acid Sequences MSSYLFKNGLRIVPPHYITIDRFVRQSWADKHIVTTLLSAFDLKPYQYFATRKVSVTRKLPHLKENLVIDDPELLIDLVLRNSDLLSVVVHKHEIPVSDGTNFMEDANQNSFPKDEDRFKIPIVFEDDNLVVVNKPSGIPTHPTGRSYRLNSVTEVVKHQLNLEKIFNFNRLDRSTSGILIFSKNTKTNQKFQEQIAENKIKKSYLARVDGNFKEKHNTICNDLLFRISISGFPLQTTSLKEIMMNSLSVPQLAETHFKFLSYNPEKDQSLVICEPVTGRTHQIRIHLRNLGHPISNDTIYGFKGNTFKNSIETDKLIIQKILNHKELMEIISSKKNAKRRNKALTGKVCSECGTELFADPIKDDMLLYLHAFKYENIDNEWCFETTFPIWAKYEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.38
3 0.36
4 0.35
5 0.33
6 0.39
7 0.39
8 0.33
9 0.33
10 0.31
11 0.34
12 0.32
13 0.39
14 0.36
15 0.37
16 0.39
17 0.38
18 0.4
19 0.38
20 0.37
21 0.29
22 0.26
23 0.2
24 0.18
25 0.17
26 0.17
27 0.14
28 0.16
29 0.17
30 0.15
31 0.15
32 0.17
33 0.19
34 0.25
35 0.27
36 0.29
37 0.36
38 0.39
39 0.4
40 0.45
41 0.5
42 0.5
43 0.56
44 0.58
45 0.59
46 0.66
47 0.67
48 0.67
49 0.66
50 0.62
51 0.59
52 0.55
53 0.49
54 0.41
55 0.38
56 0.3
57 0.24
58 0.21
59 0.16
60 0.12
61 0.08
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.09
75 0.1
76 0.11
77 0.12
78 0.12
79 0.13
80 0.14
81 0.14
82 0.15
83 0.16
84 0.17
85 0.16
86 0.17
87 0.16
88 0.15
89 0.15
90 0.12
91 0.11
92 0.1
93 0.12
94 0.15
95 0.18
96 0.17
97 0.17
98 0.17
99 0.16
100 0.2
101 0.22
102 0.25
103 0.26
104 0.3
105 0.32
106 0.33
107 0.36
108 0.32
109 0.31
110 0.32
111 0.29
112 0.24
113 0.24
114 0.24
115 0.19
116 0.19
117 0.16
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.09
126 0.12
127 0.15
128 0.23
129 0.24
130 0.26
131 0.27
132 0.31
133 0.36
134 0.36
135 0.4
136 0.38
137 0.38
138 0.36
139 0.37
140 0.34
141 0.29
142 0.27
143 0.22
144 0.18
145 0.16
146 0.17
147 0.19
148 0.19
149 0.2
150 0.2
151 0.19
152 0.21
153 0.22
154 0.24
155 0.21
156 0.2
157 0.23
158 0.22
159 0.25
160 0.23
161 0.26
162 0.23
163 0.22
164 0.21
165 0.17
166 0.16
167 0.14
168 0.14
169 0.12
170 0.13
171 0.15
172 0.18
173 0.26
174 0.29
175 0.36
176 0.41
177 0.44
178 0.44
179 0.43
180 0.49
181 0.42
182 0.42
183 0.4
184 0.42
185 0.38
186 0.37
187 0.37
188 0.28
189 0.27
190 0.26
191 0.26
192 0.25
193 0.29
194 0.3
195 0.31
196 0.38
197 0.39
198 0.41
199 0.35
200 0.29
201 0.29
202 0.28
203 0.3
204 0.29
205 0.28
206 0.28
207 0.3
208 0.3
209 0.27
210 0.26
211 0.23
212 0.17
213 0.15
214 0.12
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.13
225 0.14
226 0.13
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.12
233 0.09
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.13
242 0.11
243 0.15
244 0.15
245 0.15
246 0.15
247 0.15
248 0.25
249 0.26
250 0.29
251 0.28
252 0.33
253 0.33
254 0.33
255 0.34
256 0.24
257 0.24
258 0.21
259 0.19
260 0.15
261 0.15
262 0.14
263 0.14
264 0.16
265 0.11
266 0.15
267 0.18
268 0.22
269 0.24
270 0.31
271 0.39
272 0.41
273 0.46
274 0.47
275 0.44
276 0.45
277 0.49
278 0.43
279 0.36
280 0.31
281 0.3
282 0.28
283 0.28
284 0.22
285 0.18
286 0.17
287 0.15
288 0.16
289 0.12
290 0.12
291 0.18
292 0.19
293 0.22
294 0.25
295 0.24
296 0.27
297 0.31
298 0.31
299 0.29
300 0.29
301 0.27
302 0.28
303 0.31
304 0.28
305 0.26
306 0.24
307 0.26
308 0.34
309 0.39
310 0.37
311 0.34
312 0.32
313 0.33
314 0.34
315 0.29
316 0.22
317 0.18
318 0.19
319 0.24
320 0.26
321 0.3
322 0.34
323 0.41
324 0.48
325 0.58
326 0.65
327 0.69
328 0.78
329 0.82
330 0.86
331 0.88
332 0.89
333 0.85
334 0.81
335 0.73
336 0.64
337 0.55
338 0.47
339 0.38
340 0.29
341 0.24
342 0.17
343 0.16
344 0.17
345 0.18
346 0.16
347 0.15
348 0.16
349 0.13
350 0.12
351 0.12
352 0.1
353 0.1
354 0.11
355 0.12
356 0.16
357 0.15
358 0.17
359 0.18
360 0.17
361 0.21
362 0.25
363 0.26
364 0.26
365 0.3
366 0.29
367 0.32
368 0.34
369 0.28
370 0.24
371 0.21
372 0.22
373 0.18
374 0.24
375 0.22
376 0.24