Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1FYI1

Protein Details
Accession C1FYI1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-34LPPCQVDCKWWKKGNCFRGSHydrophilic
270-293KRANHERRSRAIRRALRRRTGRAFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-291KRANHERRSRAIRRALRRRTGR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045072  MKRN-like  
IPR018957  Znf_C3HC4_RING-type  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0000209  P:protein polyubiquitination  
KEGG pbn:PADG_00857  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00097  zf-C3HC4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16521  RING-HC_MKRN  
Amino Acid Sequences MESEPQTTPETRRRLPPCQVDCKWWKKGNCFRGSECFFRHDAALAGVDALPGSRTASVAAGNSRNETTITDNPDEQCGICLETPSVFGLLVNCDHIFCLDCIRSWRSSVGNSAEDAINRTDSRVPKRTTKTCPLCRVKSEYVVPSSVYPTPPTAATAASNVASGSEIATTSSTETGESSSETRPKNEAKAKIIDKYLARLKGIPCRYFELSIQRWRELPAIENLDPNASDNRQAKFSGECLFGNECHFAHIHPITKAPYVFSKKEISLMKRANHERRSRAIRRALRRRTGRAFIVSEHRRELDRMLEALRVEEDYESSTPSDLVSPLEDDGPDALIDAGFVFYDMLVGSVPWLVESDEDELDDYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.7
3 0.74
4 0.74
5 0.76
6 0.75
7 0.75
8 0.77
9 0.77
10 0.77
11 0.74
12 0.72
13 0.73
14 0.8
15 0.81
16 0.8
17 0.77
18 0.72
19 0.74
20 0.72
21 0.68
22 0.61
23 0.55
24 0.47
25 0.43
26 0.39
27 0.3
28 0.25
29 0.2
30 0.18
31 0.13
32 0.13
33 0.11
34 0.1
35 0.09
36 0.07
37 0.06
38 0.05
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.07
43 0.08
44 0.1
45 0.11
46 0.16
47 0.18
48 0.19
49 0.21
50 0.21
51 0.21
52 0.2
53 0.2
54 0.22
55 0.23
56 0.28
57 0.28
58 0.3
59 0.3
60 0.31
61 0.3
62 0.24
63 0.2
64 0.15
65 0.15
66 0.12
67 0.12
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.11
72 0.1
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.11
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.13
86 0.11
87 0.13
88 0.17
89 0.2
90 0.21
91 0.21
92 0.24
93 0.22
94 0.23
95 0.26
96 0.26
97 0.24
98 0.23
99 0.23
100 0.21
101 0.19
102 0.2
103 0.16
104 0.14
105 0.13
106 0.14
107 0.18
108 0.22
109 0.3
110 0.36
111 0.39
112 0.45
113 0.54
114 0.6
115 0.63
116 0.68
117 0.71
118 0.71
119 0.78
120 0.77
121 0.73
122 0.7
123 0.7
124 0.62
125 0.56
126 0.52
127 0.45
128 0.38
129 0.34
130 0.31
131 0.24
132 0.24
133 0.2
134 0.17
135 0.14
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.13
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.08
166 0.1
167 0.15
168 0.16
169 0.17
170 0.2
171 0.22
172 0.28
173 0.33
174 0.36
175 0.34
176 0.41
177 0.41
178 0.41
179 0.4
180 0.36
181 0.3
182 0.3
183 0.31
184 0.25
185 0.24
186 0.24
187 0.25
188 0.3
189 0.35
190 0.33
191 0.29
192 0.32
193 0.34
194 0.32
195 0.32
196 0.32
197 0.31
198 0.37
199 0.38
200 0.34
201 0.33
202 0.33
203 0.33
204 0.25
205 0.22
206 0.2
207 0.23
208 0.23
209 0.23
210 0.21
211 0.2
212 0.19
213 0.18
214 0.16
215 0.1
216 0.16
217 0.19
218 0.2
219 0.21
220 0.22
221 0.21
222 0.2
223 0.22
224 0.2
225 0.19
226 0.17
227 0.18
228 0.2
229 0.19
230 0.2
231 0.19
232 0.15
233 0.14
234 0.14
235 0.11
236 0.16
237 0.18
238 0.19
239 0.18
240 0.21
241 0.22
242 0.24
243 0.24
244 0.2
245 0.26
246 0.29
247 0.3
248 0.31
249 0.33
250 0.31
251 0.37
252 0.41
253 0.38
254 0.4
255 0.45
256 0.46
257 0.51
258 0.6
259 0.63
260 0.66
261 0.69
262 0.66
263 0.68
264 0.74
265 0.72
266 0.71
267 0.72
268 0.72
269 0.75
270 0.8
271 0.81
272 0.81
273 0.82
274 0.82
275 0.8
276 0.77
277 0.7
278 0.65
279 0.58
280 0.51
281 0.54
282 0.5
283 0.45
284 0.42
285 0.39
286 0.35
287 0.34
288 0.33
289 0.28
290 0.25
291 0.24
292 0.22
293 0.23
294 0.22
295 0.22
296 0.2
297 0.15
298 0.13
299 0.12
300 0.11
301 0.12
302 0.12
303 0.13
304 0.13
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.13
309 0.1
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.12
314 0.13
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.11
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.04
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.1
343 0.13
344 0.12
345 0.13