Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1G8Q6

Protein Details
Accession C1G8Q6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
417-458KQYMTPRKLEWKGNPNPKPKEVKPKDTKSKECKEKTNAKKAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
427-458WKGNPNPKPKEVKPKDTKSKECKEKTNAKKAG
Subcellular Location(s) cyto 15, nucl 8, pero 4, mito_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001412  aa-tRNA-synth_I_CS  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR002306  Trp-tRNA-ligase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004830  F:tryptophan-tRNA ligase activity  
GO:0006436  P:tryptophanyl-tRNA aminoacylation  
KEGG pbn:PADG_03642  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00178  AA_TRNA_LIGASE_I  
CDD cd00806  TrpRS_core  
Amino Acid Sequences MSAPPPPGMAEVIVPVLDGEKKAATEQQIDPWNVEAGHDEQGNTLAIDYVAISQKWATKLIDDELLQRFERLTGHKPHRWLRRGLFFSHRDFDHILNKYEAGEPFFMYTGRGPSTDALHLGHTIPFSFTKWLQDVFDVPLVIMLTDDEKALFKDNLNFEDTHKFGLQNAKDIIACGFDLKKTFIFSDLDYVKGHFLMNVWEFSKLVTFNQVRGAFGFNESTNIGRIVFPAVQCAAAFATSYPEIWSDNPPTERTKAIGKIPCLIPMAIDQDPYFRLVRDNASRMRYPGPKPALIHSKFLTALQGTGGKMSASDPNSAIFMTDTPNQIKNKINKHAFSGGRDTVEEHRRLGGNPDVDVSFQYLSYFEEDDEKLKRIEEGYRKGEILTGELKKMAIDLLQEYVAEFQQRRKHVTDELLKQYMTPRKLEWKGNPNPKPKEVKPKDTKSKECKEKTNAKKAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.09
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.11
7 0.11
8 0.12
9 0.14
10 0.19
11 0.2
12 0.25
13 0.27
14 0.32
15 0.39
16 0.39
17 0.38
18 0.35
19 0.34
20 0.28
21 0.26
22 0.21
23 0.16
24 0.19
25 0.19
26 0.17
27 0.16
28 0.17
29 0.17
30 0.14
31 0.12
32 0.08
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.09
37 0.11
38 0.11
39 0.12
40 0.13
41 0.18
42 0.19
43 0.22
44 0.2
45 0.19
46 0.22
47 0.24
48 0.27
49 0.24
50 0.27
51 0.28
52 0.31
53 0.28
54 0.26
55 0.24
56 0.2
57 0.24
58 0.23
59 0.26
60 0.33
61 0.42
62 0.46
63 0.53
64 0.61
65 0.67
66 0.69
67 0.7
68 0.68
69 0.69
70 0.68
71 0.66
72 0.66
73 0.61
74 0.6
75 0.57
76 0.49
77 0.42
78 0.4
79 0.39
80 0.38
81 0.37
82 0.34
83 0.3
84 0.3
85 0.28
86 0.29
87 0.27
88 0.21
89 0.19
90 0.17
91 0.17
92 0.17
93 0.15
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.14
101 0.17
102 0.17
103 0.17
104 0.15
105 0.14
106 0.15
107 0.15
108 0.14
109 0.12
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.12
114 0.14
115 0.14
116 0.17
117 0.19
118 0.2
119 0.19
120 0.19
121 0.19
122 0.19
123 0.19
124 0.15
125 0.13
126 0.13
127 0.12
128 0.1
129 0.08
130 0.06
131 0.05
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.06
136 0.07
137 0.1
138 0.1
139 0.11
140 0.17
141 0.19
142 0.21
143 0.23
144 0.23
145 0.22
146 0.27
147 0.26
148 0.23
149 0.21
150 0.19
151 0.19
152 0.27
153 0.25
154 0.24
155 0.24
156 0.23
157 0.22
158 0.22
159 0.2
160 0.13
161 0.12
162 0.09
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.11
167 0.11
168 0.12
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.18
174 0.17
175 0.18
176 0.17
177 0.17
178 0.15
179 0.14
180 0.14
181 0.08
182 0.07
183 0.09
184 0.1
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.13
191 0.09
192 0.08
193 0.14
194 0.14
195 0.15
196 0.22
197 0.22
198 0.21
199 0.21
200 0.23
201 0.15
202 0.16
203 0.16
204 0.09
205 0.1
206 0.11
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.07
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.08
231 0.09
232 0.12
233 0.12
234 0.15
235 0.16
236 0.18
237 0.2
238 0.21
239 0.21
240 0.19
241 0.22
242 0.22
243 0.27
244 0.29
245 0.28
246 0.31
247 0.31
248 0.32
249 0.28
250 0.25
251 0.18
252 0.16
253 0.19
254 0.14
255 0.15
256 0.12
257 0.12
258 0.13
259 0.14
260 0.13
261 0.09
262 0.11
263 0.12
264 0.17
265 0.2
266 0.25
267 0.27
268 0.31
269 0.32
270 0.32
271 0.36
272 0.38
273 0.36
274 0.4
275 0.4
276 0.39
277 0.4
278 0.43
279 0.48
280 0.43
281 0.44
282 0.36
283 0.34
284 0.31
285 0.3
286 0.26
287 0.16
288 0.14
289 0.12
290 0.13
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.08
295 0.08
296 0.09
297 0.13
298 0.13
299 0.14
300 0.14
301 0.14
302 0.15
303 0.15
304 0.14
305 0.09
306 0.08
307 0.1
308 0.12
309 0.15
310 0.17
311 0.22
312 0.23
313 0.27
314 0.33
315 0.38
316 0.43
317 0.5
318 0.54
319 0.51
320 0.55
321 0.6
322 0.55
323 0.51
324 0.49
325 0.42
326 0.36
327 0.35
328 0.32
329 0.31
330 0.36
331 0.34
332 0.28
333 0.29
334 0.29
335 0.29
336 0.31
337 0.29
338 0.24
339 0.23
340 0.24
341 0.21
342 0.2
343 0.2
344 0.17
345 0.12
346 0.1
347 0.1
348 0.09
349 0.09
350 0.11
351 0.11
352 0.1
353 0.13
354 0.14
355 0.17
356 0.2
357 0.2
358 0.19
359 0.18
360 0.2
361 0.18
362 0.26
363 0.32
364 0.38
365 0.41
366 0.43
367 0.43
368 0.41
369 0.42
370 0.33
371 0.28
372 0.27
373 0.24
374 0.23
375 0.23
376 0.23
377 0.2
378 0.2
379 0.17
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.11
384 0.12
385 0.12
386 0.12
387 0.13
388 0.13
389 0.15
390 0.15
391 0.2
392 0.27
393 0.32
394 0.37
395 0.39
396 0.42
397 0.44
398 0.52
399 0.55
400 0.56
401 0.6
402 0.58
403 0.54
404 0.51
405 0.53
406 0.51
407 0.45
408 0.39
409 0.36
410 0.43
411 0.5
412 0.58
413 0.59
414 0.62
415 0.69
416 0.77
417 0.82
418 0.82
419 0.83
420 0.82
421 0.82
422 0.8
423 0.81
424 0.8
425 0.82
426 0.82
427 0.86
428 0.88
429 0.89
430 0.92
431 0.9
432 0.92
433 0.92
434 0.89
435 0.88
436 0.87
437 0.88
438 0.88