FuNGI

A0A1E4T4T3

Protein Details

Accession

A0A1E4T4T3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
500-519	WHFRTNKKLKESSKNIHNRS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021605 CFIA_Pcf11_C IPR006569 CID_dom IPR047415 CID_Pcf11 IPR008942 ENTH_VHS IPR045154 PCF11-like IPR002014 VHS_dom
Gene Ontology	GO:0005849 C:mRNA cleavage factor complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0035091 F:phosphatidylinositol binding GO:0000993 F:RNA polymerase II complex binding GO:0043130 F:ubiquitin binding GO:0006886 P:intracellular protein transport GO:0006379 P:mRNA cleavage GO:0006378 P:mRNA polyadenylation GO:0006369 P:termination of RNA polymerase II transcription GO:0007034 P:vacuolar transport GO:0016192 P:vesicle-mediated transport
Pfam	View protein in Pfam PF11526 CFIA_Pcf11 PF04818 CID
PROSITE	View protein in PROSITE PS51391 CID PS50179 VHS
CDD	cd16982 CID_Pcf11

Amino Acid Sequences

MPDPNNPTPEQFGEEFFNSLSALTFNSRPIIESHTSLAMENLDAASEIVKAVEKRIKRAIPSQKLYALYLLDSICKNVGVPYTHLFNINIFKTFTSVYSLVDDPTRVKMIKLFKTWKIPMPITGLTVFQQEQLDRIEQFLIKATASNRPPEQQHNDQQSSRLLNGPLGKDALIFEIDELKNLVNSRRIQMPSDKKASQRFDLLQQLKTIINQPTVIAPQQLEAVQKQLITIREDEINKLNHFKMQQQQQRESAAAAAAAATAPAPLPNFTTAQFQDLMKLVSPPPEQTHINLATSSMYPFQQSQQRTYGNNPTTQDYYNLIKAFTNGQVPTQQQQQYQISQVNDPHQNNSRPSSSVENNNGYKSNVSGLSNLDFLQGLMKKGGTRSGATQQSTNTRNDAQKMNENGQKQYEFQTQLQESTLLGGQQEHLETFDSSVTPLLNPDELISKFDLTQSFINNHVPTSNEIALIYELKPNQCSNCPKRFFDINESKHLKELHLDWHFRTNKKLKESSKNIHNRSWFLSPSKWCEFKEDEIIGPLDNEAESGGLEVNSSTGKKNPLSREELFKKIVSVPEESENEITCGVCTEKLIAKFDEDSGEWVWRNAIKVRGRVLHYSCWIETDGKDNRDRSPERS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.29
3	0.24
4	0.22
5	0.17
6	0.16
7	0.14
8	0.09
9	0.1
10	0.12
11	0.14
12	0.15
13	0.18
14	0.18
15	0.18
16	0.2
17	0.25
18	0.24
19	0.25
20	0.26
21	0.27
22	0.27
23	0.26
24	0.25
25	0.19
26	0.16
27	0.14
28	0.11
29	0.08
30	0.07
31	0.07
32	0.07
33	0.06
34	0.06
35	0.06
36	0.09
37	0.1
38	0.15
39	0.22
40	0.24
41	0.3
42	0.4
43	0.44
44	0.46
45	0.55
46	0.6
47	0.64
48	0.68
49	0.67
50	0.63
51	0.6
52	0.57
53	0.49
54	0.39
55	0.29
56	0.26
57	0.21
58	0.18
59	0.17
60	0.17
61	0.15
62	0.14
63	0.13
64	0.13
65	0.17
66	0.16
67	0.19
68	0.21
69	0.25
70	0.25
71	0.27
72	0.26
73	0.24
74	0.28
75	0.26
76	0.25
77	0.22
78	0.21
79	0.21
80	0.21
81	0.19
82	0.19
83	0.18
84	0.17
85	0.2
86	0.2
87	0.19
88	0.2
89	0.2
90	0.16
91	0.18
92	0.21
93	0.18
94	0.18
95	0.23
96	0.3
97	0.37
98	0.44
99	0.47
100	0.49
101	0.58
102	0.62
103	0.62
104	0.61
105	0.55
106	0.49
107	0.49
108	0.44
109	0.37
110	0.34
111	0.28
112	0.22
113	0.23
114	0.2
115	0.16
116	0.17
117	0.15
118	0.16
119	0.17
120	0.19
121	0.16
122	0.17
123	0.16
124	0.15
125	0.15
126	0.17
127	0.15
128	0.13
129	0.15
130	0.16
131	0.22
132	0.24
133	0.28
134	0.27
135	0.3
136	0.34
137	0.4
138	0.46
139	0.47
140	0.54
141	0.58
142	0.61
143	0.57
144	0.56
145	0.52
146	0.47
147	0.39
148	0.34
149	0.25
150	0.24
151	0.27
152	0.26
153	0.23
154	0.21
155	0.19
156	0.16
157	0.16
158	0.14
159	0.1
160	0.09
161	0.07
162	0.14
163	0.14
164	0.14
165	0.14
166	0.13
167	0.14
168	0.16
169	0.18
170	0.17
171	0.19
172	0.21
173	0.27
174	0.29
175	0.3
176	0.39
177	0.46
178	0.47
179	0.52
180	0.52
181	0.5
182	0.57
183	0.59
184	0.52
185	0.48
186	0.43
187	0.41
188	0.48
189	0.46
190	0.39
191	0.35
192	0.35
193	0.29
194	0.28
195	0.28
196	0.21
197	0.19
198	0.18
199	0.18
200	0.17
201	0.19
202	0.18
203	0.14
204	0.11
205	0.1
206	0.11
207	0.12
208	0.12
209	0.1
210	0.12
211	0.11
212	0.11
213	0.11
214	0.13
215	0.14
216	0.15
217	0.16
218	0.15
219	0.19
220	0.2
221	0.21
222	0.22
223	0.23
224	0.23
225	0.25
226	0.24
227	0.22
228	0.23
229	0.25
230	0.28
231	0.35
232	0.4
233	0.43
234	0.47
235	0.46
236	0.47
237	0.43
238	0.36
239	0.26
240	0.2
241	0.14
242	0.09
243	0.06
244	0.04
245	0.04
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.04
252	0.04
253	0.06
254	0.07
255	0.08
256	0.09
257	0.14
258	0.13
259	0.15
260	0.16
261	0.14
262	0.15
263	0.14
264	0.14
265	0.1
266	0.11
267	0.1
268	0.13
269	0.14
270	0.14
271	0.15
272	0.18
273	0.18
274	0.18
275	0.24
276	0.2
277	0.2
278	0.18
279	0.17
280	0.14
281	0.14
282	0.13
283	0.09
284	0.08
285	0.08
286	0.09
287	0.12
288	0.17
289	0.18
290	0.2
291	0.24
292	0.27
293	0.28
294	0.31
295	0.37
296	0.33
297	0.35
298	0.33
299	0.3
300	0.29
301	0.28
302	0.26
303	0.2
304	0.2
305	0.19
306	0.18
307	0.16
308	0.14
309	0.14
310	0.15
311	0.13
312	0.15
313	0.12
314	0.12
315	0.15
316	0.16
317	0.17
318	0.22
319	0.23
320	0.21
321	0.26
322	0.27
323	0.25
324	0.27
325	0.29
326	0.23
327	0.22
328	0.24
329	0.23
330	0.28
331	0.27
332	0.28
333	0.3
334	0.33
335	0.33
336	0.34
337	0.31
338	0.26
339	0.27
340	0.3
341	0.27
342	0.3
343	0.33
344	0.34
345	0.34
346	0.34
347	0.33
348	0.28
349	0.25
350	0.19
351	0.16
352	0.13
353	0.12
354	0.12
355	0.12
356	0.13
357	0.13
358	0.13
359	0.11
360	0.09
361	0.08
362	0.11
363	0.11
364	0.1
365	0.1
366	0.11
367	0.11
368	0.12
369	0.15
370	0.13
371	0.13
372	0.16
373	0.23
374	0.27
375	0.28
376	0.29
377	0.27
378	0.32
379	0.34
380	0.32
381	0.28
382	0.27
383	0.28
384	0.3
385	0.33
386	0.29
387	0.33
388	0.35
389	0.39
390	0.39
391	0.38
392	0.37
393	0.36
394	0.33
395	0.27
396	0.28
397	0.29
398	0.28
399	0.27
400	0.32
401	0.3
402	0.29
403	0.29
404	0.24
405	0.18
406	0.16
407	0.15
408	0.08
409	0.08
410	0.07
411	0.07
412	0.08
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.08
417	0.08
418	0.09
419	0.09
420	0.08
421	0.08
422	0.08
423	0.08
424	0.07
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.08
429	0.08
430	0.12
431	0.12
432	0.14
433	0.14
434	0.14
435	0.14
436	0.16
437	0.16
438	0.14
439	0.16
440	0.17
441	0.17
442	0.19
443	0.23
444	0.21
445	0.21
446	0.19
447	0.18
448	0.18
449	0.22
450	0.2
451	0.16
452	0.16
453	0.16
454	0.16
455	0.17
456	0.15
457	0.13
458	0.14
459	0.15
460	0.18
461	0.19
462	0.21
463	0.26
464	0.36
465	0.4
466	0.49
467	0.53
468	0.53
469	0.57
470	0.61
471	0.58
472	0.58
473	0.61
474	0.55
475	0.59
476	0.62
477	0.57
478	0.54
479	0.5
480	0.4
481	0.33
482	0.32
483	0.31
484	0.34
485	0.36
486	0.33
487	0.42
488	0.48
489	0.46
490	0.53
491	0.52
492	0.52
493	0.57
494	0.65
495	0.63
496	0.68
497	0.76
498	0.76
499	0.77
500	0.81
501	0.77
502	0.75
503	0.71
504	0.64
505	0.59
506	0.55
507	0.48
508	0.42
509	0.45
510	0.43
511	0.46
512	0.5
513	0.5
514	0.46
515	0.49
516	0.49
517	0.46
518	0.49
519	0.43
520	0.37
521	0.34
522	0.34
523	0.28
524	0.23
525	0.19
526	0.11
527	0.09
528	0.08
529	0.06
530	0.05
531	0.05
532	0.05
533	0.06
534	0.05
535	0.05
536	0.05
537	0.06
538	0.08
539	0.09
540	0.1
541	0.13
542	0.19
543	0.23
544	0.32
545	0.39
546	0.44
547	0.51
548	0.53
549	0.6
550	0.6
551	0.62
552	0.58
553	0.5
554	0.46
555	0.42
556	0.43
557	0.35
558	0.33
559	0.3
560	0.33
561	0.35
562	0.35
563	0.33
564	0.29
565	0.27
566	0.24
567	0.21
568	0.14
569	0.13
570	0.12
571	0.11
572	0.11
573	0.13
574	0.19
575	0.22
576	0.26
577	0.25
578	0.27
579	0.28
580	0.29
581	0.29
582	0.24
583	0.23
584	0.21
585	0.25
586	0.22
587	0.21
588	0.23
589	0.21
590	0.24
591	0.26
592	0.32
593	0.34
594	0.4
595	0.46
596	0.51
597	0.53
598	0.58
599	0.57
600	0.57
601	0.56
602	0.55
603	0.48
604	0.43
605	0.41
606	0.35
607	0.32
608	0.33
609	0.36
610	0.36
611	0.43
612	0.43
613	0.46
614	0.53

A0A1E4T4T3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer