Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1G0B4

Protein Details
Accession C1G0B4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-107VSLPQKPPTHTRKKDRSDAFRECHydrophilic
270-293VRSSEDRIKRMTKKCPNPGCGWRIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 11, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR002867  IBR_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
KEGG pbn:PADG_00304  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
Amino Acid Sequences MGVTYRRKSGVPNPRKTIANKTRDMPFPSANIAATPNLPLANTVFELIRNTNALSSANSHGLSAPGAIVTPSPMMDVTRIQPTKVSLPQKPPTHTRKKDRSDAFRECVICAELKPLGWKGANFPSFPRCAHGPQTCSDCVSKHIIITLKTRAPINHNQVASKGVIDWSICTCPQCNMTLTESEIRSALSRSENAVITGIVSRKELESHPRWASCLSITCSSGQIFPEGAQSEKVVCIKCGASSCFLHGIPWHTKYTCGQYDDSHPNAQSVRSSEDRIKRMTKKCPNPGCGWRIQKSGGCPNMLCIKCSRPFRWDEAKWDENVVPEPE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.72
3 0.7
4 0.71
5 0.7
6 0.69
7 0.63
8 0.61
9 0.63
10 0.64
11 0.65
12 0.59
13 0.52
14 0.45
15 0.44
16 0.41
17 0.34
18 0.28
19 0.25
20 0.2
21 0.18
22 0.16
23 0.14
24 0.13
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.13
29 0.12
30 0.12
31 0.11
32 0.12
33 0.15
34 0.15
35 0.16
36 0.14
37 0.14
38 0.14
39 0.14
40 0.14
41 0.13
42 0.15
43 0.17
44 0.18
45 0.18
46 0.18
47 0.17
48 0.17
49 0.15
50 0.12
51 0.09
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.05
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.11
64 0.12
65 0.21
66 0.21
67 0.21
68 0.22
69 0.24
70 0.29
71 0.34
72 0.39
73 0.35
74 0.44
75 0.52
76 0.56
77 0.58
78 0.61
79 0.64
80 0.69
81 0.72
82 0.74
83 0.76
84 0.77
85 0.83
86 0.82
87 0.82
88 0.8
89 0.78
90 0.71
91 0.66
92 0.59
93 0.5
94 0.42
95 0.33
96 0.24
97 0.17
98 0.16
99 0.12
100 0.11
101 0.13
102 0.12
103 0.14
104 0.14
105 0.14
106 0.16
107 0.24
108 0.26
109 0.24
110 0.25
111 0.27
112 0.28
113 0.28
114 0.27
115 0.22
116 0.23
117 0.3
118 0.32
119 0.3
120 0.3
121 0.35
122 0.32
123 0.31
124 0.29
125 0.22
126 0.2
127 0.22
128 0.2
129 0.15
130 0.18
131 0.18
132 0.2
133 0.23
134 0.24
135 0.21
136 0.22
137 0.23
138 0.22
139 0.25
140 0.31
141 0.34
142 0.35
143 0.34
144 0.33
145 0.32
146 0.33
147 0.27
148 0.19
149 0.12
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.1
160 0.11
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.16
167 0.18
168 0.17
169 0.16
170 0.14
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.11
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.11
183 0.1
184 0.11
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.11
191 0.12
192 0.18
193 0.21
194 0.28
195 0.31
196 0.31
197 0.31
198 0.3
199 0.3
200 0.23
201 0.24
202 0.21
203 0.19
204 0.2
205 0.2
206 0.21
207 0.2
208 0.2
209 0.16
210 0.13
211 0.11
212 0.11
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.14
220 0.17
221 0.14
222 0.13
223 0.15
224 0.14
225 0.16
226 0.19
227 0.18
228 0.19
229 0.19
230 0.21
231 0.23
232 0.22
233 0.21
234 0.19
235 0.23
236 0.24
237 0.27
238 0.28
239 0.25
240 0.28
241 0.3
242 0.36
243 0.36
244 0.33
245 0.32
246 0.31
247 0.38
248 0.43
249 0.44
250 0.39
251 0.34
252 0.33
253 0.33
254 0.31
255 0.27
256 0.22
257 0.24
258 0.24
259 0.28
260 0.33
261 0.41
262 0.44
263 0.46
264 0.53
265 0.56
266 0.62
267 0.68
268 0.71
269 0.74
270 0.8
271 0.84
272 0.81
273 0.8
274 0.81
275 0.76
276 0.75
277 0.73
278 0.67
279 0.62
280 0.61
281 0.56
282 0.54
283 0.57
284 0.53
285 0.47
286 0.42
287 0.43
288 0.48
289 0.45
290 0.4
291 0.34
292 0.37
293 0.41
294 0.49
295 0.49
296 0.45
297 0.5
298 0.57
299 0.64
300 0.61
301 0.63
302 0.63
303 0.64
304 0.58
305 0.57
306 0.5
307 0.42