Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GGW1

Protein Details
Accession C1GGW1    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-41GGGHGPRGGHNQRKRRYRDDDDYDRRQQRRRBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 16, cyto 5.5, cyto_nucl 4, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR027159  CBP80  
IPR015172  MIF4G-like_typ-1  
IPR015174  MIF4G-like_typ-2  
Gene Ontology GO:0005846  C:nuclear cap binding complex  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
KEGG pbn:PADG_06180  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09088  MIF4G_like  
PF09090  MIF4G_like_2  
Amino Acid Sequences MVDHESRGSGGGGHGPRGGHNQRKRRYRDDDDYDRRQQRRRYEEPLAVTVRKQLATIAESAVRKAEDDVAQIAKTVSEHYGDEDPEVKNTFVTLVLQLIGEQPLKIPFVAATVLTANTMKPELAAEVLKKVGEIAQSHIKAGNWRDVKLVLRFLACLQGLFEGEGIFPLLEELFSRAVDLQTASSEDSLGLELVKIILFTIPYIMSSSASGFEAQASALLEKTDIIASTPHTLEELVDPFPSNEGNEENRMSVIGLLQKQLQDEAKQGWELFCIPRPWTGLIPANKPRESENEENAEAKEGEEQNEETQDPFKTATKHIFPTIAVPNPVPNGPKPIFPDVYFSVYLDQDLETVPPITDVAASLLRDALADTIDMLDFNRIATAKFLIDVDCYFAPSTFIKRATPFDKIRDAVNAGVGDRSTWKPEDVAVDAVFSLLFQLPSAEHKLVYYHSVLTEACKIAPAAIAPSLGRAIRFLYRNVERMDLALSYRFLDWFAHHLSNFGFTWKWTEWVDDVELPAIHPKKSFICGALDKEIRLSFAQRIKGTLPEPYQALISENKEKDTPDFKYSLETTPYATEAQEIMQLIRKKATDADLQPHIQAIEQQAAASGVTDPLIPSTDAFVTSICYVGSKSLSHVLSCIERSKERLLSIGPQSPAARRQIITSVLEYWADQPGIGVNIIDKLLNYAILTPLSVIEWALVDHIDGGAALAKAHVYEMVAATMGKVTNRIRQIVAARVQLGLVEPQLSVIDETLRKERGDVGVMFDVIEGALVGVVGGAGAGDGMQGNGAMEGEGGIIPEWGRRWLRVFRRMKAVEEAFFTEAMTRAVPVGTMPPVQQQQVEEVSAPAEAEAAAVENNTEMADVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.23
4 0.32
5 0.4
6 0.42
7 0.51
8 0.59
9 0.67
10 0.77
11 0.83
12 0.83
13 0.84
14 0.83
15 0.84
16 0.84
17 0.86
18 0.85
19 0.85
20 0.86
21 0.85
22 0.82
23 0.79
24 0.77
25 0.76
26 0.77
27 0.76
28 0.75
29 0.74
30 0.74
31 0.72
32 0.71
33 0.67
34 0.59
35 0.52
36 0.5
37 0.45
38 0.38
39 0.33
40 0.27
41 0.25
42 0.25
43 0.26
44 0.22
45 0.23
46 0.24
47 0.24
48 0.25
49 0.21
50 0.19
51 0.19
52 0.22
53 0.18
54 0.2
55 0.23
56 0.23
57 0.22
58 0.22
59 0.21
60 0.16
61 0.14
62 0.14
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.15
67 0.19
68 0.19
69 0.2
70 0.22
71 0.22
72 0.23
73 0.25
74 0.21
75 0.17
76 0.17
77 0.16
78 0.13
79 0.14
80 0.11
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.11
86 0.13
87 0.12
88 0.11
89 0.11
90 0.13
91 0.14
92 0.13
93 0.12
94 0.1
95 0.11
96 0.12
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.1
105 0.11
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.11
111 0.14
112 0.13
113 0.15
114 0.16
115 0.15
116 0.14
117 0.14
118 0.14
119 0.15
120 0.15
121 0.18
122 0.26
123 0.27
124 0.28
125 0.29
126 0.28
127 0.3
128 0.32
129 0.36
130 0.3
131 0.3
132 0.31
133 0.32
134 0.35
135 0.34
136 0.35
137 0.28
138 0.26
139 0.26
140 0.24
141 0.27
142 0.23
143 0.19
144 0.15
145 0.14
146 0.14
147 0.13
148 0.13
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.05
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.1
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.09
194 0.1
195 0.09
196 0.1
197 0.1
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.09
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.13
222 0.13
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.09
230 0.09
231 0.11
232 0.13
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.16
237 0.16
238 0.14
239 0.11
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.13
244 0.15
245 0.16
246 0.16
247 0.18
248 0.18
249 0.14
250 0.16
251 0.17
252 0.17
253 0.17
254 0.17
255 0.15
256 0.14
257 0.15
258 0.14
259 0.16
260 0.17
261 0.17
262 0.19
263 0.21
264 0.22
265 0.2
266 0.23
267 0.26
268 0.28
269 0.34
270 0.4
271 0.44
272 0.43
273 0.43
274 0.41
275 0.4
276 0.44
277 0.42
278 0.39
279 0.38
280 0.38
281 0.38
282 0.36
283 0.31
284 0.24
285 0.19
286 0.19
287 0.15
288 0.15
289 0.16
290 0.16
291 0.15
292 0.17
293 0.17
294 0.12
295 0.13
296 0.12
297 0.11
298 0.12
299 0.14
300 0.15
301 0.17
302 0.23
303 0.25
304 0.27
305 0.27
306 0.27
307 0.24
308 0.27
309 0.29
310 0.25
311 0.22
312 0.2
313 0.2
314 0.2
315 0.21
316 0.18
317 0.14
318 0.19
319 0.19
320 0.22
321 0.24
322 0.28
323 0.29
324 0.27
325 0.32
326 0.26
327 0.29
328 0.26
329 0.22
330 0.19
331 0.17
332 0.17
333 0.12
334 0.1
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.05
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.07
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.09
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.08
381 0.1
382 0.1
383 0.13
384 0.13
385 0.15
386 0.15
387 0.17
388 0.22
389 0.23
390 0.3
391 0.29
392 0.3
393 0.33
394 0.32
395 0.31
396 0.28
397 0.27
398 0.2
399 0.19
400 0.15
401 0.11
402 0.1
403 0.09
404 0.08
405 0.09
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.11
412 0.13
413 0.12
414 0.13
415 0.1
416 0.1
417 0.1
418 0.09
419 0.08
420 0.06
421 0.05
422 0.04
423 0.04
424 0.03
425 0.04
426 0.04
427 0.07
428 0.1
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.1
433 0.11
434 0.12
435 0.11
436 0.09
437 0.08
438 0.09
439 0.09
440 0.1
441 0.12
442 0.1
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.08
447 0.08
448 0.07
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.06
458 0.08
459 0.11
460 0.13
461 0.13
462 0.19
463 0.21
464 0.25
465 0.25
466 0.25
467 0.21
468 0.2
469 0.2
470 0.14
471 0.13
472 0.1
473 0.09
474 0.08
475 0.09
476 0.08
477 0.08
478 0.08
479 0.08
480 0.11
481 0.14
482 0.14
483 0.14
484 0.15
485 0.14
486 0.16
487 0.15
488 0.13
489 0.1
490 0.09
491 0.14
492 0.13
493 0.15
494 0.13
495 0.14
496 0.14
497 0.15
498 0.17
499 0.13
500 0.12
501 0.11
502 0.11
503 0.09
504 0.14
505 0.14
506 0.13
507 0.13
508 0.14
509 0.15
510 0.18
511 0.19
512 0.15
513 0.19
514 0.21
515 0.24
516 0.28
517 0.27
518 0.25
519 0.26
520 0.24
521 0.21
522 0.18
523 0.17
524 0.16
525 0.2
526 0.25
527 0.23
528 0.25
529 0.25
530 0.28
531 0.27
532 0.27
533 0.24
534 0.21
535 0.21
536 0.19
537 0.19
538 0.15
539 0.16
540 0.14
541 0.16
542 0.22
543 0.22
544 0.22
545 0.23
546 0.23
547 0.25
548 0.28
549 0.29
550 0.25
551 0.26
552 0.25
553 0.28
554 0.3
555 0.29
556 0.26
557 0.22
558 0.2
559 0.19
560 0.21
561 0.17
562 0.15
563 0.13
564 0.1
565 0.1
566 0.1
567 0.1
568 0.09
569 0.14
570 0.17
571 0.16
572 0.19
573 0.19
574 0.18
575 0.2
576 0.23
577 0.24
578 0.25
579 0.29
580 0.31
581 0.32
582 0.31
583 0.29
584 0.25
585 0.19
586 0.17
587 0.14
588 0.12
589 0.11
590 0.11
591 0.11
592 0.11
593 0.11
594 0.09
595 0.07
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.07
602 0.06
603 0.06
604 0.08
605 0.08
606 0.09
607 0.09
608 0.08
609 0.09
610 0.09
611 0.09
612 0.07
613 0.07
614 0.07
615 0.08
616 0.1
617 0.08
618 0.1
619 0.16
620 0.17
621 0.17
622 0.17
623 0.17
624 0.19
625 0.2
626 0.23
627 0.2
628 0.21
629 0.25
630 0.29
631 0.31
632 0.28
633 0.29
634 0.26
635 0.29
636 0.32
637 0.34
638 0.3
639 0.29
640 0.3
641 0.31
642 0.33
643 0.31
644 0.3
645 0.24
646 0.26
647 0.27
648 0.29
649 0.28
650 0.26
651 0.23
652 0.2
653 0.2
654 0.19
655 0.16
656 0.15
657 0.13
658 0.11
659 0.09
660 0.09
661 0.1
662 0.1
663 0.08
664 0.06
665 0.07
666 0.08
667 0.08
668 0.07
669 0.08
670 0.08
671 0.08
672 0.08
673 0.08
674 0.09
675 0.09
676 0.09
677 0.07
678 0.07
679 0.07
680 0.07
681 0.06
682 0.05
683 0.05
684 0.05
685 0.06
686 0.05
687 0.05
688 0.05
689 0.05
690 0.04
691 0.04
692 0.04
693 0.06
694 0.06
695 0.06
696 0.06
697 0.06
698 0.06
699 0.06
700 0.07
701 0.05
702 0.06
703 0.06
704 0.07
705 0.07
706 0.07
707 0.07
708 0.08
709 0.09
710 0.08
711 0.13
712 0.15
713 0.22
714 0.26
715 0.28
716 0.27
717 0.31
718 0.35
719 0.37
720 0.4
721 0.36
722 0.33
723 0.31
724 0.3
725 0.25
726 0.22
727 0.16
728 0.11
729 0.09
730 0.08
731 0.08
732 0.09
733 0.09
734 0.08
735 0.08
736 0.12
737 0.13
738 0.16
739 0.21
740 0.23
741 0.22
742 0.23
743 0.26
744 0.25
745 0.28
746 0.26
747 0.26
748 0.26
749 0.26
750 0.25
751 0.21
752 0.18
753 0.12
754 0.11
755 0.06
756 0.03
757 0.03
758 0.03
759 0.03
760 0.02
761 0.02
762 0.02
763 0.02
764 0.02
765 0.02
766 0.02
767 0.02
768 0.02
769 0.03
770 0.03
771 0.03
772 0.03
773 0.04
774 0.04
775 0.04
776 0.04
777 0.04
778 0.04
779 0.05
780 0.05
781 0.05
782 0.05
783 0.06
784 0.06
785 0.08
786 0.1
787 0.16
788 0.17
789 0.2
790 0.26
791 0.35
792 0.44
793 0.53
794 0.6
795 0.6
796 0.69
797 0.69
798 0.67
799 0.67
800 0.62
801 0.54
802 0.49
803 0.47
804 0.38
805 0.35
806 0.31
807 0.23
808 0.19
809 0.17
810 0.14
811 0.1
812 0.1
813 0.1
814 0.09
815 0.09
816 0.11
817 0.13
818 0.15
819 0.15
820 0.21
821 0.25
822 0.26
823 0.28
824 0.26
825 0.28
826 0.28
827 0.29
828 0.23
829 0.2
830 0.19
831 0.17
832 0.16
833 0.1
834 0.08
835 0.06
836 0.05
837 0.05
838 0.05
839 0.05
840 0.05
841 0.06
842 0.05
843 0.06
844 0.06