Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1E4SXI5

Protein Details
Accession A0A1E4SXI5    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
149-168LPQQHQQQNHQHQKQHQPSQHydrophilic
265-286FINLSKGKTKRNPSKPHSSKTSHydrophilic
766-789KTDVIKKRQRGGTNKKVKKKSDGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
771-785KKRQRGGTNKKVKKK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013860  AreA_GATA  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR004855  TFIIA_asu/bsu  
IPR039355  Transcription_factor_GATA  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0005672  C:transcription factor TFIIA complex  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF08550  DUF1752  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MYYSNNQPPSPEAFKQNGDKSNSSLPQLPLQHQVLQQQYQQQLQQQQYQQMQQLQQQQQQQQQHPSMQVPHMQAIHMQMLQQQLHPQQLQQLAEQHQGQWHLQNGQPPTIHQQQPQQHQQQQQQQQQQQQQHQHQQQQPQQHHHQQQQLPQQHQQQNHQHQKQHQPSQQQQQQQPQQQQRAQNQLPTAQQPSQLRASQQQLLQTGPSHQSNIMRNKDLDVGSSVNSQSSVVDDQSATALWKMYSKAKASLPYRSRMENLTWRLMFINLSKGKTKRNPSKPHSSKTSQSMVATQRPALTNQESTSINNDNNYTSWPQFPDLNLLETETGESINTKAQINEQGSSVGSANDPKATDFNYIEHIKLIGSKIHSPDLAPVGSTASSSSTSKVGPEFVPGSFKRKEISPIMKPQYSKLSQSFINNANHNINDTQQPISMNNTGSGSGNQHDSKAGFPIDFGPMSLPASLSHHPSTSGLSEFGNDENGQNNSPLGYDHISSSIPSSLNHNPSLLNIHHPVTQNDFMGHGHHNSITGPSGGDVMYSPSQSSIASKTSSRFHPFTFDRPPSRAFGSTVKDEYNFDLDGDLNMFDSMSTGYSGTTPAGTPQLQPQGGTIGLVPLPQSSTATPSSLIQTLPNTMIKTPSATANSKNVRRQSVASKRKQSVASSRTKKSFDQGSSSTGTTPTIGSAPTFNNSSTMANTPTPTSSSSSHNNSNNSNTFNGIDQAGIACTNCHTKTTPLWRRNPEGQPLCNACGLFLKLHGVVRPLSLKTDVIKKRQRGGTNKKVKKKSDGDDLHPTPIILNGSNLASSNRSKKVGNEKKFSNSISGKGSTKVGQLASGFGSGFKRSDNDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDGEEVDNNDDDDDDDDDDEGDNDDDDDDDDGDDVRKKELSDGLSSSAATAATSTGDMEVLDFDSILNMTAHNHQGSGKGDLKLKAETGESGHNPGGDNGGNGTSSTGNNGTNSSNSNWDWLTMSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.55
3 0.6
4 0.59
5 0.58
6 0.56
7 0.54
8 0.58
9 0.55
10 0.5
11 0.48
12 0.43
13 0.45
14 0.47
15 0.46
16 0.44
17 0.44
18 0.46
19 0.42
20 0.47
21 0.45
22 0.44
23 0.45
24 0.45
25 0.45
26 0.44
27 0.45
28 0.44
29 0.46
30 0.47
31 0.52
32 0.49
33 0.53
34 0.54
35 0.55
36 0.54
37 0.52
38 0.51
39 0.5
40 0.55
41 0.54
42 0.55
43 0.58
44 0.59
45 0.61
46 0.66
47 0.67
48 0.65
49 0.63
50 0.62
51 0.58
52 0.55
53 0.53
54 0.47
55 0.47
56 0.41
57 0.4
58 0.36
59 0.33
60 0.3
61 0.28
62 0.29
63 0.23
64 0.2
65 0.19
66 0.24
67 0.25
68 0.24
69 0.27
70 0.26
71 0.32
72 0.33
73 0.3
74 0.31
75 0.35
76 0.35
77 0.32
78 0.35
79 0.33
80 0.37
81 0.37
82 0.32
83 0.3
84 0.32
85 0.3
86 0.28
87 0.28
88 0.27
89 0.28
90 0.33
91 0.33
92 0.34
93 0.33
94 0.32
95 0.35
96 0.4
97 0.43
98 0.41
99 0.47
100 0.5
101 0.59
102 0.67
103 0.69
104 0.66
105 0.7
106 0.74
107 0.75
108 0.77
109 0.77
110 0.77
111 0.74
112 0.76
113 0.76
114 0.75
115 0.74
116 0.74
117 0.74
118 0.75
119 0.76
120 0.77
121 0.75
122 0.76
123 0.73
124 0.73
125 0.71
126 0.7
127 0.71
128 0.72
129 0.74
130 0.72
131 0.75
132 0.7
133 0.71
134 0.72
135 0.71
136 0.66
137 0.64
138 0.67
139 0.64
140 0.64
141 0.66
142 0.66
143 0.69
144 0.75
145 0.75
146 0.72
147 0.74
148 0.8
149 0.8
150 0.8
151 0.74
152 0.73
153 0.75
154 0.8
155 0.78
156 0.76
157 0.73
158 0.73
159 0.76
160 0.74
161 0.75
162 0.73
163 0.76
164 0.72
165 0.74
166 0.71
167 0.72
168 0.67
169 0.61
170 0.55
171 0.5
172 0.48
173 0.44
174 0.41
175 0.33
176 0.36
177 0.34
178 0.36
179 0.37
180 0.36
181 0.34
182 0.35
183 0.38
184 0.37
185 0.36
186 0.36
187 0.32
188 0.31
189 0.3
190 0.25
191 0.24
192 0.23
193 0.23
194 0.2
195 0.21
196 0.26
197 0.32
198 0.4
199 0.42
200 0.42
201 0.41
202 0.41
203 0.44
204 0.39
205 0.32
206 0.26
207 0.21
208 0.19
209 0.21
210 0.19
211 0.14
212 0.14
213 0.13
214 0.1
215 0.11
216 0.12
217 0.09
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.11
222 0.11
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.1
228 0.12
229 0.17
230 0.22
231 0.24
232 0.28
233 0.31
234 0.39
235 0.39
236 0.47
237 0.45
238 0.48
239 0.48
240 0.46
241 0.44
242 0.39
243 0.42
244 0.41
245 0.41
246 0.42
247 0.39
248 0.37
249 0.36
250 0.33
251 0.29
252 0.21
253 0.26
254 0.22
255 0.25
256 0.3
257 0.32
258 0.4
259 0.46
260 0.56
261 0.57
262 0.64
263 0.72
264 0.73
265 0.82
266 0.82
267 0.82
268 0.8
269 0.74
270 0.69
271 0.65
272 0.63
273 0.54
274 0.47
275 0.45
276 0.42
277 0.42
278 0.38
279 0.33
280 0.3
281 0.28
282 0.29
283 0.27
284 0.25
285 0.22
286 0.21
287 0.24
288 0.22
289 0.22
290 0.24
291 0.23
292 0.21
293 0.2
294 0.2
295 0.17
296 0.17
297 0.19
298 0.18
299 0.16
300 0.18
301 0.18
302 0.19
303 0.19
304 0.19
305 0.23
306 0.21
307 0.21
308 0.19
309 0.18
310 0.17
311 0.15
312 0.15
313 0.09
314 0.08
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.08
319 0.09
320 0.09
321 0.1
322 0.12
323 0.18
324 0.2
325 0.2
326 0.18
327 0.17
328 0.17
329 0.18
330 0.16
331 0.1
332 0.08
333 0.09
334 0.09
335 0.1
336 0.11
337 0.1
338 0.11
339 0.12
340 0.15
341 0.14
342 0.14
343 0.19
344 0.19
345 0.19
346 0.18
347 0.17
348 0.13
349 0.14
350 0.14
351 0.11
352 0.13
353 0.16
354 0.17
355 0.19
356 0.19
357 0.17
358 0.19
359 0.19
360 0.16
361 0.13
362 0.11
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.08
367 0.07
368 0.08
369 0.09
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.11
374 0.11
375 0.12
376 0.11
377 0.13
378 0.14
379 0.13
380 0.19
381 0.18
382 0.23
383 0.22
384 0.23
385 0.21
386 0.21
387 0.26
388 0.27
389 0.34
390 0.35
391 0.43
392 0.48
393 0.49
394 0.48
395 0.46
396 0.46
397 0.41
398 0.39
399 0.31
400 0.29
401 0.28
402 0.3
403 0.32
404 0.3
405 0.32
406 0.29
407 0.3
408 0.29
409 0.27
410 0.26
411 0.22
412 0.17
413 0.15
414 0.16
415 0.14
416 0.13
417 0.14
418 0.13
419 0.16
420 0.17
421 0.15
422 0.14
423 0.14
424 0.13
425 0.13
426 0.13
427 0.11
428 0.1
429 0.13
430 0.12
431 0.12
432 0.12
433 0.12
434 0.12
435 0.13
436 0.12
437 0.08
438 0.09
439 0.1
440 0.11
441 0.1
442 0.09
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.08
447 0.07
448 0.06
449 0.1
450 0.11
451 0.14
452 0.14
453 0.14
454 0.14
455 0.14
456 0.15
457 0.13
458 0.12
459 0.09
460 0.09
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.09
465 0.08
466 0.08
467 0.09
468 0.1
469 0.1
470 0.09
471 0.09
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.09
483 0.09
484 0.09
485 0.08
486 0.13
487 0.16
488 0.19
489 0.2
490 0.19
491 0.17
492 0.17
493 0.21
494 0.17
495 0.15
496 0.14
497 0.15
498 0.18
499 0.2
500 0.2
501 0.21
502 0.22
503 0.19
504 0.17
505 0.17
506 0.13
507 0.14
508 0.14
509 0.1
510 0.1
511 0.1
512 0.1
513 0.09
514 0.1
515 0.08
516 0.07
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.05
523 0.07
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.07
528 0.08
529 0.08
530 0.09
531 0.08
532 0.09
533 0.11
534 0.12
535 0.14
536 0.17
537 0.22
538 0.26
539 0.25
540 0.24
541 0.3
542 0.31
543 0.35
544 0.39
545 0.41
546 0.39
547 0.4
548 0.41
549 0.36
550 0.37
551 0.32
552 0.26
553 0.25
554 0.26
555 0.26
556 0.25
557 0.24
558 0.22
559 0.22
560 0.21
561 0.18
562 0.14
563 0.11
564 0.11
565 0.1
566 0.09
567 0.09
568 0.07
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.05
577 0.04
578 0.05
579 0.05
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.05
584 0.06
585 0.09
586 0.09
587 0.1
588 0.13
589 0.19
590 0.19
591 0.19
592 0.18
593 0.17
594 0.16
595 0.16
596 0.11
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.05
602 0.06
603 0.06
604 0.07
605 0.06
606 0.1
607 0.1
608 0.11
609 0.11
610 0.12
611 0.13
612 0.13
613 0.13
614 0.11
615 0.11
616 0.12
617 0.14
618 0.15
619 0.14
620 0.13
621 0.15
622 0.14
623 0.15
624 0.14
625 0.15
626 0.18
627 0.19
628 0.21
629 0.28
630 0.35
631 0.39
632 0.44
633 0.45
634 0.45
635 0.45
636 0.46
637 0.48
638 0.51
639 0.56
640 0.59
641 0.63
642 0.62
643 0.65
644 0.65
645 0.59
646 0.58
647 0.55
648 0.57
649 0.56
650 0.59
651 0.58
652 0.58
653 0.55
654 0.5
655 0.5
656 0.42
657 0.42
658 0.38
659 0.36
660 0.36
661 0.35
662 0.3
663 0.22
664 0.2
665 0.14
666 0.13
667 0.1
668 0.08
669 0.08
670 0.08
671 0.09
672 0.1
673 0.12
674 0.13
675 0.12
676 0.13
677 0.14
678 0.14
679 0.14
680 0.15
681 0.16
682 0.16
683 0.17
684 0.16
685 0.16
686 0.16
687 0.16
688 0.17
689 0.16
690 0.2
691 0.25
692 0.29
693 0.36
694 0.39
695 0.4
696 0.4
697 0.44
698 0.42
699 0.39
700 0.34
701 0.29
702 0.25
703 0.22
704 0.21
705 0.15
706 0.12
707 0.09
708 0.09
709 0.08
710 0.07
711 0.06
712 0.05
713 0.06
714 0.11
715 0.12
716 0.13
717 0.14
718 0.17
719 0.25
720 0.36
721 0.45
722 0.49
723 0.58
724 0.62
725 0.68
726 0.74
727 0.72
728 0.71
729 0.67
730 0.6
731 0.59
732 0.56
733 0.51
734 0.44
735 0.38
736 0.28
737 0.24
738 0.24
739 0.17
740 0.14
741 0.15
742 0.14
743 0.16
744 0.16
745 0.15
746 0.15
747 0.17
748 0.19
749 0.17
750 0.18
751 0.18
752 0.19
753 0.2
754 0.29
755 0.33
756 0.39
757 0.47
758 0.5
759 0.57
760 0.63
761 0.69
762 0.7
763 0.74
764 0.75
765 0.78
766 0.82
767 0.84
768 0.85
769 0.82
770 0.81
771 0.79
772 0.75
773 0.75
774 0.72
775 0.68
776 0.7
777 0.67
778 0.59
779 0.51
780 0.44
781 0.33
782 0.29
783 0.24
784 0.14
785 0.13
786 0.11
787 0.11
788 0.12
789 0.12
790 0.11
791 0.13
792 0.17
793 0.23
794 0.26
795 0.28
796 0.29
797 0.35
798 0.46
799 0.53
800 0.58
801 0.59
802 0.59
803 0.64
804 0.67
805 0.61
806 0.59
807 0.5
808 0.45
809 0.43
810 0.42
811 0.37
812 0.34
813 0.35
814 0.28
815 0.28
816 0.27
817 0.22
818 0.21
819 0.2
820 0.19
821 0.18
822 0.17
823 0.15
824 0.13
825 0.14
826 0.13
827 0.14
828 0.13
829 0.14
830 0.16
831 0.22
832 0.25
833 0.27
834 0.28
835 0.31
836 0.31
837 0.32
838 0.28
839 0.23
840 0.19
841 0.15
842 0.13
843 0.1
844 0.09
845 0.07
846 0.07
847 0.07
848 0.07
849 0.07
850 0.07
851 0.07
852 0.07
853 0.07
854 0.07
855 0.07
856 0.07
857 0.07
858 0.07
859 0.07
860 0.06
861 0.06
862 0.06
863 0.07
864 0.07
865 0.08
866 0.08
867 0.08
868 0.08
869 0.08
870 0.08
871 0.09
872 0.1
873 0.09
874 0.1
875 0.1
876 0.1
877 0.1
878 0.1
879 0.09
880 0.08
881 0.07
882 0.07
883 0.07
884 0.07
885 0.07
886 0.08
887 0.07
888 0.07
889 0.07
890 0.08
891 0.1
892 0.14
893 0.14
894 0.15
895 0.17
896 0.17
897 0.21
898 0.25
899 0.27
900 0.27
901 0.28
902 0.3
903 0.29
904 0.28
905 0.25
906 0.2
907 0.17
908 0.12
909 0.1
910 0.07
911 0.07
912 0.07
913 0.07
914 0.06
915 0.07
916 0.07
917 0.07
918 0.07
919 0.08
920 0.07
921 0.07
922 0.06
923 0.07
924 0.07
925 0.08
926 0.07
927 0.06
928 0.09
929 0.13
930 0.18
931 0.17
932 0.18
933 0.18
934 0.23
935 0.25
936 0.3
937 0.31
938 0.31
939 0.36
940 0.38
941 0.4
942 0.38
943 0.36
944 0.31
945 0.27
946 0.25
947 0.23
948 0.27
949 0.27
950 0.29
951 0.29
952 0.28
953 0.27
954 0.26
955 0.26
956 0.19
957 0.18
958 0.15
959 0.15
960 0.14
961 0.13
962 0.15
963 0.13
964 0.12
965 0.16
966 0.16
967 0.17
968 0.18
969 0.2
970 0.2
971 0.21
972 0.24
973 0.23
974 0.26
975 0.25
976 0.28
977 0.26
978 0.26