Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4SUH1

Protein Details
Accession A0A1E4SUH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-214APSSTKQQKTKAKKTKTYLDVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-93ADKSKAKKNGKPSVTGNEAGAKFKNKNHDVEGPKSTGRSAPKGKAFDKH
226-261APRDAPSTRGGARGGARGGARGGRGGARGGRTGSKD
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 10.832, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSSFNPFNILGDDVSDGETEFVSTPKEIVKKTTSSKKTDTPPPSADKSKAKKNGKPSVTGNEAGAKFKNKNHDVEGPKSTGRSAPKGKAFDKHSRTGRTETAKSQKNKLGDEAEAQVEAAEDVEAEDATVEAEEEEEEEEETVPVKSYEEYLAEQAASQLSLAAKPTKAANAGSEDKWTNNEVLVKKTEAFVAPSSTKQQKTKAKKTKTYLDVEVTVADSIPPPRAPRDAPSTRGGARGGARGGARGGRGGARGGRTGSKDSSAPKKVAYNEVNFPSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.1
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.08
8 0.08
9 0.09
10 0.09
11 0.1
12 0.15
13 0.2
14 0.2
15 0.25
16 0.3
17 0.35
18 0.43
19 0.53
20 0.55
21 0.57
22 0.61
23 0.64
24 0.66
25 0.7
26 0.67
27 0.64
28 0.63
29 0.63
30 0.64
31 0.62
32 0.6
33 0.6
34 0.61
35 0.64
36 0.68
37 0.7
38 0.69
39 0.74
40 0.78
41 0.72
42 0.71
43 0.66
44 0.63
45 0.59
46 0.54
47 0.45
48 0.42
49 0.39
50 0.35
51 0.32
52 0.29
53 0.27
54 0.29
55 0.38
56 0.35
57 0.38
58 0.4
59 0.47
60 0.48
61 0.51
62 0.51
63 0.44
64 0.41
65 0.38
66 0.34
67 0.3
68 0.28
69 0.3
70 0.32
71 0.36
72 0.42
73 0.47
74 0.48
75 0.51
76 0.53
77 0.56
78 0.55
79 0.57
80 0.57
81 0.57
82 0.59
83 0.56
84 0.55
85 0.52
86 0.49
87 0.48
88 0.5
89 0.53
90 0.52
91 0.53
92 0.51
93 0.48
94 0.46
95 0.43
96 0.37
97 0.3
98 0.29
99 0.25
100 0.21
101 0.17
102 0.15
103 0.11
104 0.09
105 0.07
106 0.05
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.02
115 0.03
116 0.03
117 0.02
118 0.02
119 0.02
120 0.02
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.04
130 0.05
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.05
145 0.04
146 0.05
147 0.04
148 0.05
149 0.06
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.12
157 0.12
158 0.16
159 0.19
160 0.19
161 0.21
162 0.2
163 0.19
164 0.21
165 0.2
166 0.15
167 0.13
168 0.18
169 0.17
170 0.2
171 0.21
172 0.21
173 0.2
174 0.2
175 0.2
176 0.16
177 0.16
178 0.14
179 0.17
180 0.17
181 0.18
182 0.24
183 0.29
184 0.33
185 0.34
186 0.42
187 0.48
188 0.57
189 0.66
190 0.71
191 0.75
192 0.79
193 0.82
194 0.83
195 0.81
196 0.76
197 0.69
198 0.63
199 0.55
200 0.46
201 0.4
202 0.3
203 0.23
204 0.17
205 0.12
206 0.09
207 0.09
208 0.11
209 0.12
210 0.14
211 0.17
212 0.21
213 0.23
214 0.27
215 0.36
216 0.38
217 0.41
218 0.42
219 0.44
220 0.41
221 0.42
222 0.37
223 0.32
224 0.28
225 0.28
226 0.25
227 0.24
228 0.23
229 0.21
230 0.22
231 0.2
232 0.18
233 0.16
234 0.16
235 0.15
236 0.16
237 0.18
238 0.2
239 0.21
240 0.22
241 0.24
242 0.27
243 0.29
244 0.32
245 0.32
246 0.31
247 0.32
248 0.36
249 0.43
250 0.44
251 0.42
252 0.41
253 0.45
254 0.47
255 0.53
256 0.53
257 0.49
258 0.51