Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1FZ53

Protein Details
Accession C1FZ53    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
555-575EGWSTVSSKQRNNRRGNQARGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
246-259PRSKDGPGFRKASP
271-274RPPR
380-398RQKKEAEEKAKAEKAEKQK
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 8, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pbn:PADG_01079  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAPAKPKAQKMSVGTFLADENFGSWADEMDEFPLPVPEPRASYGGERRTFSGYGNDTGGIERDHRGYAIREELPLPTQPPYTAHIGNLSFEAAQADISELFKECQVTNVRIVEDKMTRAPKGFGYVEFATLEGLKKALTFQGTSLQGRNIRVSVAEPPKERQETRDFSDWSRKGPLPDVPSQRRVSDRPGFGARGQDALSDVGDRTGRRAFEPADGKVRDYGNWERKGPLSPSPAPTSLASEGGRPRSKDGPGFRKASPAWGEARSQEGSRPPRREFHERPAPERTPTAPELDNQWRARMRPDPPAPKSAAPAPEAVPAAPPAPAQRPKLNLQKRTVEAEPASPTATTGDSKASPFGGARPIDTSAREREVEERRQLALRQKKEAEEKAKAEKAEKQKAAKEQEQLTKEEASVKGGSAVTTANGAKEDGSDAPQAGKNIEILRRTGHTEEATVVEQASAAPAANEKPGIPKEPAARQQQPQQQQQQQQQQQSAPPSKANGNWRNGPARTRGGGHGHAPPRGFVQGHAKAQQNRGAPAQEHAPAPTPATPAEPEEEGWSTVSSKQRNNRRGNQARG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.4
3 0.36
4 0.3
5 0.24
6 0.17
7 0.11
8 0.11
9 0.1
10 0.1
11 0.09
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.11
16 0.12
17 0.13
18 0.12
19 0.13
20 0.14
21 0.13
22 0.15
23 0.18
24 0.18
25 0.2
26 0.22
27 0.24
28 0.24
29 0.3
30 0.37
31 0.42
32 0.45
33 0.43
34 0.43
35 0.46
36 0.45
37 0.39
38 0.38
39 0.32
40 0.3
41 0.3
42 0.28
43 0.24
44 0.24
45 0.24
46 0.17
47 0.15
48 0.15
49 0.16
50 0.16
51 0.16
52 0.18
53 0.19
54 0.22
55 0.27
56 0.26
57 0.25
58 0.26
59 0.27
60 0.27
61 0.26
62 0.24
63 0.2
64 0.2
65 0.19
66 0.2
67 0.22
68 0.25
69 0.24
70 0.23
71 0.25
72 0.25
73 0.25
74 0.23
75 0.21
76 0.15
77 0.14
78 0.14
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.09
88 0.11
89 0.13
90 0.11
91 0.17
92 0.21
93 0.23
94 0.27
95 0.29
96 0.29
97 0.29
98 0.3
99 0.29
100 0.26
101 0.26
102 0.28
103 0.3
104 0.3
105 0.29
106 0.3
107 0.26
108 0.3
109 0.29
110 0.23
111 0.26
112 0.25
113 0.25
114 0.23
115 0.22
116 0.16
117 0.16
118 0.16
119 0.09
120 0.09
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.12
128 0.19
129 0.22
130 0.24
131 0.24
132 0.26
133 0.28
134 0.29
135 0.3
136 0.23
137 0.2
138 0.19
139 0.19
140 0.23
141 0.27
142 0.31
143 0.31
144 0.34
145 0.41
146 0.45
147 0.44
148 0.41
149 0.43
150 0.43
151 0.46
152 0.51
153 0.46
154 0.44
155 0.54
156 0.49
157 0.43
158 0.44
159 0.4
160 0.34
161 0.36
162 0.38
163 0.33
164 0.4
165 0.47
166 0.46
167 0.51
168 0.51
169 0.5
170 0.49
171 0.46
172 0.46
173 0.44
174 0.4
175 0.38
176 0.4
177 0.39
178 0.36
179 0.38
180 0.3
181 0.24
182 0.23
183 0.18
184 0.16
185 0.14
186 0.13
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.1
191 0.09
192 0.11
193 0.14
194 0.14
195 0.14
196 0.17
197 0.17
198 0.22
199 0.26
200 0.26
201 0.31
202 0.31
203 0.3
204 0.31
205 0.3
206 0.24
207 0.26
208 0.33
209 0.34
210 0.37
211 0.37
212 0.35
213 0.36
214 0.39
215 0.36
216 0.33
217 0.31
218 0.31
219 0.34
220 0.35
221 0.35
222 0.33
223 0.31
224 0.28
225 0.22
226 0.21
227 0.18
228 0.17
229 0.19
230 0.24
231 0.26
232 0.23
233 0.26
234 0.27
235 0.29
236 0.32
237 0.38
238 0.4
239 0.42
240 0.46
241 0.43
242 0.44
243 0.42
244 0.42
245 0.36
246 0.3
247 0.28
248 0.25
249 0.26
250 0.21
251 0.24
252 0.19
253 0.17
254 0.17
255 0.21
256 0.28
257 0.34
258 0.39
259 0.37
260 0.42
261 0.48
262 0.55
263 0.54
264 0.55
265 0.58
266 0.54
267 0.57
268 0.59
269 0.54
270 0.46
271 0.42
272 0.35
273 0.29
274 0.28
275 0.27
276 0.19
277 0.18
278 0.23
279 0.26
280 0.32
281 0.27
282 0.3
283 0.28
284 0.28
285 0.31
286 0.31
287 0.29
288 0.31
289 0.39
290 0.45
291 0.46
292 0.49
293 0.49
294 0.44
295 0.42
296 0.37
297 0.32
298 0.24
299 0.23
300 0.2
301 0.2
302 0.19
303 0.17
304 0.14
305 0.11
306 0.11
307 0.09
308 0.09
309 0.08
310 0.14
311 0.19
312 0.22
313 0.25
314 0.29
315 0.35
316 0.45
317 0.51
318 0.52
319 0.51
320 0.54
321 0.53
322 0.54
323 0.48
324 0.42
325 0.34
326 0.3
327 0.27
328 0.22
329 0.2
330 0.15
331 0.15
332 0.12
333 0.12
334 0.1
335 0.09
336 0.1
337 0.1
338 0.11
339 0.12
340 0.11
341 0.1
342 0.1
343 0.11
344 0.15
345 0.14
346 0.14
347 0.15
348 0.17
349 0.17
350 0.19
351 0.21
352 0.18
353 0.21
354 0.21
355 0.2
356 0.25
357 0.31
358 0.36
359 0.37
360 0.36
361 0.35
362 0.36
363 0.39
364 0.41
365 0.43
366 0.41
367 0.43
368 0.44
369 0.47
370 0.52
371 0.57
372 0.54
373 0.51
374 0.51
375 0.52
376 0.53
377 0.49
378 0.44
379 0.44
380 0.47
381 0.5
382 0.51
383 0.48
384 0.5
385 0.57
386 0.62
387 0.59
388 0.56
389 0.53
390 0.56
391 0.53
392 0.5
393 0.45
394 0.38
395 0.33
396 0.32
397 0.26
398 0.21
399 0.19
400 0.17
401 0.18
402 0.17
403 0.16
404 0.12
405 0.12
406 0.09
407 0.11
408 0.11
409 0.08
410 0.09
411 0.09
412 0.08
413 0.09
414 0.1
415 0.09
416 0.11
417 0.11
418 0.11
419 0.14
420 0.16
421 0.16
422 0.14
423 0.14
424 0.14
425 0.17
426 0.21
427 0.2
428 0.19
429 0.21
430 0.23
431 0.26
432 0.25
433 0.25
434 0.22
435 0.21
436 0.21
437 0.21
438 0.2
439 0.17
440 0.15
441 0.11
442 0.1
443 0.09
444 0.08
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.06
449 0.07
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.15
454 0.18
455 0.22
456 0.22
457 0.26
458 0.31
459 0.39
460 0.47
461 0.5
462 0.54
463 0.55
464 0.62
465 0.66
466 0.68
467 0.69
468 0.71
469 0.7
470 0.72
471 0.76
472 0.78
473 0.77
474 0.74
475 0.7
476 0.63
477 0.6
478 0.6
479 0.58
480 0.5
481 0.45
482 0.42
483 0.41
484 0.44
485 0.49
486 0.49
487 0.49
488 0.53
489 0.56
490 0.61
491 0.59
492 0.57
493 0.53
494 0.51
495 0.47
496 0.44
497 0.43
498 0.41
499 0.42
500 0.42
501 0.44
502 0.42
503 0.43
504 0.4
505 0.36
506 0.33
507 0.34
508 0.3
509 0.25
510 0.31
511 0.35
512 0.4
513 0.44
514 0.49
515 0.51
516 0.55
517 0.58
518 0.52
519 0.47
520 0.46
521 0.45
522 0.39
523 0.36
524 0.35
525 0.33
526 0.3
527 0.29
528 0.28
529 0.25
530 0.27
531 0.27
532 0.24
533 0.21
534 0.24
535 0.23
536 0.22
537 0.25
538 0.23
539 0.21
540 0.23
541 0.24
542 0.21
543 0.21
544 0.19
545 0.18
546 0.22
547 0.29
548 0.31
549 0.37
550 0.46
551 0.55
552 0.64
553 0.73
554 0.78
555 0.82