Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4SWH4

Protein Details
Accession A0A1E4SWH4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-28SQLERELRSQSKRKQPSTSSRSNSRGSHydrophilic
421-443IKDSSKRVSKKDKKESRSIFREVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, plas 3, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR039777  IFRD  
IPR007701  Interferon-rel_develop_reg_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF05004  IFRD  
Amino Acid Sequences MSQLERELRSQSKRKQPSTSSRSNSRGSKTPNNETDTEDDFDNEMNEQLNFNRFDTLLISKMESAIQDNQEYGSADAALSPTKPSQGNQETRANSLLRSIITPISSRSPSTSTSTTTSPTAEKIKITNSTTVQEIISSLTTTTKSKLPTVTREFLFSQLYSHLTKILPSESFGIINDHDFENLVKLLATSRSDLEYVLALRSISAYVCSDLDEIATSVIEILFPVLLSKIQSATTTTQSSELDSSDINGQEDRHDEHNNDDVLPKISPEIVSSSIIAYASLMLLIFEDSSCYGLADQLPLLFSVVETYTSTGTSPTEQEETIIINALNGIGVIVTLLYKSGQDVNEVIEENLPSLVDLLENSSLSKRLLKSDGILIALLFELYDYTENYPSDDDELDEGEEGEYSPYTPYYQLQTILNSLIKDSSKRVSKKDKKESRSIFREVLKTVSFHTSSPKRQKELLLEQSDTGSSTLSSFKLNKSKALPIKSWFEYVRLIHLKYIYDSELSSQYVSSKELRNVLIKPDNNGNRSYADEFTSDAGNAIDGKEWKDRNTAANGIKKELKIKVARELKVRQQFGDLSLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.8
3 0.82
4 0.84
5 0.84
6 0.85
7 0.82
8 0.81
9 0.8
10 0.78
11 0.75
12 0.7
13 0.69
14 0.67
15 0.69
16 0.68
17 0.72
18 0.72
19 0.7
20 0.66
21 0.62
22 0.58
23 0.52
24 0.46
25 0.36
26 0.3
27 0.25
28 0.24
29 0.2
30 0.16
31 0.12
32 0.11
33 0.11
34 0.11
35 0.13
36 0.18
37 0.19
38 0.19
39 0.2
40 0.19
41 0.2
42 0.22
43 0.23
44 0.2
45 0.2
46 0.2
47 0.18
48 0.19
49 0.19
50 0.17
51 0.18
52 0.2
53 0.22
54 0.21
55 0.21
56 0.21
57 0.21
58 0.21
59 0.18
60 0.13
61 0.1
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.1
68 0.11
69 0.14
70 0.16
71 0.16
72 0.26
73 0.35
74 0.41
75 0.44
76 0.52
77 0.5
78 0.51
79 0.54
80 0.44
81 0.35
82 0.31
83 0.27
84 0.19
85 0.19
86 0.18
87 0.17
88 0.17
89 0.18
90 0.18
91 0.22
92 0.22
93 0.22
94 0.23
95 0.24
96 0.25
97 0.3
98 0.3
99 0.27
100 0.29
101 0.29
102 0.28
103 0.27
104 0.26
105 0.22
106 0.23
107 0.25
108 0.24
109 0.24
110 0.24
111 0.27
112 0.32
113 0.33
114 0.35
115 0.32
116 0.32
117 0.31
118 0.3
119 0.25
120 0.19
121 0.17
122 0.13
123 0.11
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.11
128 0.12
129 0.14
130 0.16
131 0.17
132 0.2
133 0.27
134 0.31
135 0.38
136 0.45
137 0.48
138 0.45
139 0.47
140 0.45
141 0.4
142 0.38
143 0.28
144 0.22
145 0.18
146 0.2
147 0.17
148 0.16
149 0.16
150 0.14
151 0.15
152 0.16
153 0.17
154 0.14
155 0.14
156 0.17
157 0.15
158 0.16
159 0.15
160 0.15
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.11
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.06
172 0.06
173 0.08
174 0.1
175 0.11
176 0.1
177 0.11
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.12
182 0.11
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.1
220 0.12
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.16
225 0.16
226 0.17
227 0.15
228 0.13
229 0.1
230 0.09
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.1
238 0.12
239 0.13
240 0.14
241 0.15
242 0.15
243 0.17
244 0.21
245 0.2
246 0.19
247 0.17
248 0.15
249 0.15
250 0.14
251 0.12
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.06
265 0.04
266 0.04
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.1
304 0.09
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.09
309 0.09
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.05
314 0.04
315 0.03
316 0.03
317 0.02
318 0.02
319 0.02
320 0.02
321 0.02
322 0.02
323 0.02
324 0.03
325 0.03
326 0.04
327 0.07
328 0.07
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.08
339 0.07
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.04
344 0.04
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.09
352 0.13
353 0.12
354 0.15
355 0.18
356 0.18
357 0.19
358 0.22
359 0.23
360 0.19
361 0.18
362 0.14
363 0.12
364 0.11
365 0.09
366 0.05
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.04
371 0.05
372 0.07
373 0.1
374 0.1
375 0.11
376 0.12
377 0.11
378 0.13
379 0.12
380 0.11
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.08
385 0.08
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.08
396 0.09
397 0.12
398 0.14
399 0.16
400 0.16
401 0.17
402 0.18
403 0.19
404 0.2
405 0.16
406 0.15
407 0.16
408 0.15
409 0.16
410 0.18
411 0.22
412 0.29
413 0.33
414 0.4
415 0.49
416 0.58
417 0.68
418 0.76
419 0.79
420 0.78
421 0.84
422 0.86
423 0.84
424 0.81
425 0.76
426 0.7
427 0.65
428 0.63
429 0.53
430 0.48
431 0.39
432 0.32
433 0.29
434 0.29
435 0.25
436 0.21
437 0.29
438 0.33
439 0.42
440 0.52
441 0.56
442 0.54
443 0.57
444 0.62
445 0.62
446 0.64
447 0.64
448 0.59
449 0.53
450 0.5
451 0.47
452 0.42
453 0.33
454 0.23
455 0.14
456 0.09
457 0.08
458 0.1
459 0.1
460 0.14
461 0.15
462 0.22
463 0.3
464 0.31
465 0.36
466 0.38
467 0.47
468 0.5
469 0.54
470 0.52
471 0.48
472 0.54
473 0.51
474 0.52
475 0.43
476 0.38
477 0.37
478 0.34
479 0.38
480 0.36
481 0.34
482 0.32
483 0.33
484 0.32
485 0.29
486 0.31
487 0.23
488 0.19
489 0.18
490 0.18
491 0.19
492 0.18
493 0.17
494 0.15
495 0.15
496 0.15
497 0.17
498 0.19
499 0.22
500 0.25
501 0.29
502 0.32
503 0.35
504 0.36
505 0.42
506 0.46
507 0.43
508 0.43
509 0.48
510 0.52
511 0.5
512 0.49
513 0.43
514 0.36
515 0.39
516 0.39
517 0.31
518 0.25
519 0.24
520 0.23
521 0.22
522 0.21
523 0.17
524 0.14
525 0.12
526 0.1
527 0.1
528 0.09
529 0.12
530 0.12
531 0.16
532 0.23
533 0.26
534 0.28
535 0.33
536 0.36
537 0.37
538 0.42
539 0.47
540 0.47
541 0.53
542 0.52
543 0.52
544 0.55
545 0.52
546 0.52
547 0.49
548 0.5
549 0.49
550 0.51
551 0.55
552 0.58
553 0.61
554 0.63
555 0.66
556 0.67
557 0.7
558 0.69
559 0.6
560 0.56
561 0.53