FuNGI

C1GIU8

Protein Details

Accession

C1GIU8

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
221-249	EVFALKKREDEQRKKGDKRRSNKLQALGF	Hydrophilic
1182-1201	LVWSKEHKGRLKSKVKGILE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
228-241	REDEQRKKGDKRRS
1189-1197	KGRLKSKVK

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto_nucl 12, cyto 10, mito 2, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR034104 Lsm1 IPR010920 LSM_dom_sf IPR012978 RRP12-like_dom IPR001163 Sm_dom_euk/arc
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0000932 C:P-body GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing GO:0000956 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process GO:0008033 P:tRNA processing
KEGG	pbn:PADG_07184 -
Pfam	View protein in Pfam PF01423 LSM PF08161 NUC173
CDD	cd01728 LSm1

Amino Acid Sequences

MENLSLHDHNNGPAGRHGGGLPPPLPHGHQAYPPPSHPNPPHPGFQHQQQAPPGPPSSVPAPGQAPSPVPMMVPGPPQLPPQMFTTAAQLLDLTDSVLLETSEWTNSPLSSPRLRNAVFAEKLVLVLRDGRKLIGVLRSWDQFANLVLQGTVERIYAGHLFADVQRGIYLVRGENVLLLGEIRQCIYFSFDLQLTMPIPHCRDLDKEDDIPSGYRQASYDEVFALKKREDEQRKKGDKRRSNKLQALGFEAEHSGETSVVLSAVEDTLRDQHAEFTPTAYFAALLALLGQAINANQGIVNKDLAASIVYLLDIVSPFVPTPLLTSKFSQILTGLAPALTLPEAEAPLLKPSVGCLQSLLVAQDAAAWALPQSQIGPRRAMAGLMALAVDHRPKVRKRVHDSLMHVLKNPPPSPALDHPAADMCAETALQTLSESIAAAAKAKKGRHGHHQGSQHEPMVIHAVQLVKTIAMASGGWPTKKIEPLCELLMNVSRSSNEYLTMAAFEVFEIIFQGMADEFSSSKLPRLMEAISELKPAQNDSQLLPPWIAVVSRGYDVSAQVNPEETFEKLPELFELISSFLTSPSRNIRISASECLISFLVNCIPDSVILEPSIYDEKVFEKLAKIATELLSVKYQAAWMEVLNVLSVMFDALKWRSFPVLTDIVRTVGELRGYESFAGKKQADQVLGAAIAAMGPEAILNILPLNITNQKAGQAGRVWLLPILRDHVSNTRLAYFRSEFVPLSEALFQRVLEYGNAEKTVEVKIFETLIQQTWAILPGFCELPLDLTESFDQSFAELLANVLYKQTELRVDVGRALQNLVESNQAITSLDTETDDLILQRRISKEEAKRNLAHLSGFASNLLAVLFNVYSQTLPQFRGFLLQCINAYLSITDEKELIETFTRVITLLEASLAETETPEQKQSKVPGDRMPPTSHTLMDLLVTMSIYLPRSSFVTLFSLAAAVLNKKASDLQLIKKAYKLLPRLASTETGATALRERSSELQSLILSTADQTPPPARRDRLLAIHEIVTYLPTSDLHFIPSVLSEVVLGCKESNEKARTAAFTLLIHLAQRTIDPELNPRRHDTAPDAPATIEEFFTMVSAGLAGSSPHMVAASVTALSRLLFEFHNKLAPSMLSDLVETIDLFLTSNNREIVRSVLGFVKVAVVALPEDMLRPRLSSLVPNLLVWSKEHKGRLKSKVKGILERLIRRFWRASA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.26
3	0.26
4	0.25
5	0.23
6	0.26
7	0.29
8	0.27
9	0.24
10	0.26
11	0.28
12	0.29
13	0.29
14	0.31
15	0.29
16	0.34
17	0.4
18	0.45
19	0.47
20	0.48
21	0.52
22	0.49
23	0.55
24	0.55
25	0.57
26	0.6
27	0.59
28	0.64
29	0.59
30	0.64
31	0.6
32	0.61
33	0.62
34	0.55
35	0.58
36	0.56
37	0.58
38	0.53
39	0.53
40	0.47
41	0.38
42	0.36
43	0.34
44	0.31
45	0.31
46	0.29
47	0.27
48	0.28
49	0.27
50	0.29
51	0.27
52	0.25
53	0.22
54	0.22
55	0.19
56	0.16
57	0.17
58	0.16
59	0.17
60	0.18
61	0.18
62	0.18
63	0.2
64	0.22
65	0.26
66	0.26
67	0.25
68	0.26
69	0.28
70	0.27
71	0.26
72	0.29
73	0.26
74	0.24
75	0.22
76	0.18
77	0.14
78	0.14
79	0.13
80	0.09
81	0.06
82	0.06
83	0.06
84	0.07
85	0.06
86	0.06
87	0.08
88	0.08
89	0.09
90	0.1
91	0.12
92	0.12
93	0.12
94	0.15
95	0.19
96	0.23
97	0.3
98	0.34
99	0.37
100	0.44
101	0.44
102	0.45
103	0.46
104	0.49
105	0.42
106	0.39
107	0.37
108	0.29
109	0.3
110	0.27
111	0.22
112	0.13
113	0.19
114	0.21
115	0.23
116	0.23
117	0.23
118	0.23
119	0.23
120	0.26
121	0.25
122	0.25
123	0.25
124	0.28
125	0.3
126	0.3
127	0.3
128	0.27
129	0.21
130	0.2
131	0.19
132	0.16
133	0.14
134	0.12
135	0.12
136	0.12
137	0.12
138	0.11
139	0.08
140	0.07
141	0.07
142	0.09
143	0.1
144	0.1
145	0.09
146	0.09
147	0.1
148	0.11
149	0.16
150	0.13
151	0.13
152	0.12
153	0.12
154	0.12
155	0.13
156	0.15
157	0.11
158	0.12
159	0.12
160	0.12
161	0.12
162	0.13
163	0.1
164	0.08
165	0.07
166	0.07
167	0.08
168	0.09
169	0.09
170	0.09
171	0.09
172	0.1
173	0.14
174	0.13
175	0.13
176	0.16
177	0.15
178	0.16
179	0.16
180	0.18
181	0.14
182	0.16
183	0.17
184	0.19
185	0.21
186	0.23
187	0.24
188	0.24
189	0.26
190	0.29
191	0.32
192	0.32
193	0.33
194	0.31
195	0.32
196	0.31
197	0.28
198	0.25
199	0.25
200	0.2
201	0.18
202	0.17
203	0.18
204	0.2
205	0.2
206	0.2
207	0.16
208	0.17
209	0.18
210	0.19
211	0.2
212	0.18
213	0.19
214	0.22
215	0.32
216	0.41
217	0.5
218	0.58
219	0.65
220	0.75
221	0.82
222	0.86
223	0.87
224	0.86
225	0.85
226	0.86
227	0.85
228	0.85
229	0.82
230	0.81
231	0.75
232	0.67
233	0.65
234	0.55
235	0.45
236	0.35
237	0.28
238	0.21
239	0.16
240	0.15
241	0.09
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.06
246	0.06
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.06
254	0.09
255	0.1
256	0.1
257	0.1
258	0.14
259	0.16
260	0.19
261	0.18
262	0.17
263	0.17
264	0.17
265	0.17
266	0.13
267	0.1
268	0.07
269	0.08
270	0.05
271	0.05
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.03
278	0.03
279	0.05
280	0.04
281	0.04
282	0.05
283	0.07
284	0.09
285	0.1
286	0.1
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.08
292	0.06
293	0.06
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.06
305	0.06
306	0.05
307	0.09
308	0.14
309	0.17
310	0.19
311	0.21
312	0.24
313	0.26
314	0.27
315	0.24
316	0.18
317	0.16
318	0.15
319	0.14
320	0.11
321	0.08
322	0.08
323	0.07
324	0.07
325	0.06
326	0.05
327	0.04
328	0.05
329	0.06
330	0.06
331	0.07
332	0.07
333	0.09
334	0.09
335	0.08
336	0.07
337	0.09
338	0.16
339	0.16
340	0.15
341	0.14
342	0.14
343	0.16
344	0.16
345	0.15
346	0.08
347	0.07
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.05
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.06
359	0.11
360	0.17
361	0.19
362	0.21
363	0.2
364	0.23
365	0.23
366	0.22
367	0.17
368	0.12
369	0.1
370	0.09
371	0.08
372	0.05
373	0.05
374	0.06
375	0.06
376	0.07
377	0.09
378	0.16
379	0.19
380	0.29
381	0.37
382	0.46
383	0.54
384	0.62
385	0.66
386	0.67
387	0.68
388	0.68
389	0.67
390	0.58
391	0.5
392	0.43
393	0.41
394	0.4
395	0.36
396	0.28
397	0.22
398	0.23
399	0.27
400	0.29
401	0.3
402	0.25
403	0.25
404	0.24
405	0.24
406	0.23
407	0.17
408	0.13
409	0.07
410	0.06
411	0.06
412	0.05
413	0.04
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.04
419	0.05
420	0.04
421	0.04
422	0.05
423	0.05
424	0.08
425	0.09
426	0.12
427	0.17
428	0.17
429	0.25
430	0.3
431	0.34
432	0.42
433	0.51
434	0.52
435	0.55
436	0.62
437	0.58
438	0.58
439	0.57
440	0.47
441	0.38
442	0.33
443	0.27
444	0.23
445	0.2
446	0.13
447	0.12
448	0.12
449	0.11
450	0.12
451	0.12
452	0.07
453	0.07
454	0.07
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.04
459	0.09
460	0.11
461	0.11
462	0.12
463	0.14
464	0.16
465	0.22
466	0.22
467	0.2
468	0.22
469	0.25
470	0.26
471	0.24
472	0.22
473	0.18
474	0.21
475	0.19
476	0.16
477	0.13
478	0.12
479	0.13
480	0.15
481	0.14
482	0.11
483	0.1
484	0.1
485	0.1
486	0.1
487	0.08
488	0.06
489	0.06
490	0.05
491	0.05
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.03
498	0.04
499	0.03
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.05
505	0.07
506	0.07
507	0.09
508	0.11
509	0.11
510	0.11
511	0.13
512	0.12
513	0.11
514	0.14
515	0.16
516	0.14
517	0.15
518	0.15
519	0.13
520	0.13
521	0.14
522	0.12
523	0.12
524	0.12
525	0.12
526	0.17
527	0.17
528	0.17
529	0.16
530	0.14
531	0.12
532	0.11
533	0.1
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.07
538	0.07
539	0.07
540	0.07
541	0.08
542	0.09
543	0.09
544	0.08
545	0.08
546	0.1
547	0.09
548	0.1
549	0.11
550	0.09
551	0.09
552	0.09
553	0.1
554	0.09
555	0.09
556	0.08
557	0.08
558	0.07
559	0.07
560	0.07
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.07
567	0.07
568	0.09
569	0.13
570	0.17
571	0.17
572	0.17
573	0.18
574	0.21
575	0.23
576	0.23
577	0.2
578	0.17
579	0.16
580	0.17
581	0.16
582	0.11
583	0.08
584	0.07
585	0.08
586	0.07
587	0.07
588	0.06
589	0.06
590	0.06
591	0.07
592	0.07
593	0.07
594	0.06
595	0.06
596	0.06
597	0.07
598	0.09
599	0.07
600	0.07
601	0.06
602	0.07
603	0.09
604	0.1
605	0.09
606	0.08
607	0.1
608	0.12
609	0.12
610	0.11
611	0.11
612	0.11
613	0.13
614	0.12
615	0.12
616	0.11
617	0.11
618	0.1
619	0.09
620	0.09
621	0.07
622	0.07
623	0.06
624	0.06
625	0.07
626	0.07
627	0.07
628	0.06
629	0.06
630	0.05
631	0.04
632	0.04
633	0.03
634	0.03
635	0.03
636	0.05
637	0.06
638	0.06
639	0.07
640	0.08
641	0.09
642	0.09
643	0.09
644	0.12
645	0.18
646	0.17
647	0.18
648	0.18
649	0.18
650	0.18
651	0.17
652	0.14
653	0.09
654	0.1
655	0.08
656	0.09
657	0.09
658	0.1
659	0.1
660	0.1
661	0.1
662	0.11
663	0.15
664	0.14
665	0.14
666	0.18
667	0.2
668	0.2
669	0.19
670	0.18
671	0.14
672	0.14
673	0.13
674	0.08
675	0.04
676	0.04
677	0.03
678	0.03
679	0.02
680	0.02
681	0.02
682	0.02
683	0.02
684	0.02
685	0.02
686	0.02
687	0.03
688	0.03
689	0.03
690	0.06
691	0.08
692	0.09
693	0.1
694	0.1
695	0.12
696	0.14
697	0.14
698	0.14
699	0.12
700	0.13
701	0.13
702	0.13
703	0.12
704	0.11
705	0.11
706	0.1
707	0.09
708	0.11
709	0.11
710	0.11
711	0.13
712	0.16
713	0.17
714	0.18
715	0.18
716	0.18
717	0.19
718	0.19
719	0.21
720	0.18
721	0.18
722	0.18
723	0.19
724	0.16
725	0.16
726	0.17
727	0.12
728	0.13
729	0.15
730	0.14
731	0.13
732	0.14
733	0.13
734	0.12
735	0.12
736	0.11
737	0.08
738	0.1
739	0.1
740	0.1
741	0.11
742	0.1
743	0.1
744	0.1
745	0.12
746	0.1
747	0.1
748	0.09
749	0.09
750	0.1
751	0.1
752	0.11
753	0.1
754	0.1
755	0.11
756	0.1
757	0.09
758	0.09
759	0.11
760	0.09
761	0.08
762	0.08
763	0.08
764	0.08
765	0.08
766	0.08
767	0.06
768	0.07
769	0.08
770	0.1
771	0.08
772	0.1
773	0.1
774	0.11
775	0.11
776	0.1
777	0.1
778	0.07
779	0.07
780	0.06
781	0.06
782	0.05
783	0.05
784	0.05
785	0.06
786	0.06
787	0.06
788	0.06
789	0.06
790	0.06
791	0.07
792	0.08
793	0.09
794	0.12
795	0.14
796	0.15
797	0.16
798	0.19
799	0.19
800	0.17
801	0.17
802	0.14
803	0.13
804	0.13
805	0.12
806	0.11
807	0.09
808	0.09
809	0.08
810	0.08
811	0.08
812	0.07
813	0.08
814	0.07
815	0.07
816	0.07
817	0.07
818	0.07
819	0.07
820	0.07
821	0.07
822	0.08
823	0.1
824	0.1
825	0.14
826	0.15
827	0.17
828	0.21
829	0.29
830	0.35
831	0.44
832	0.5
833	0.53
834	0.53
835	0.53
836	0.53
837	0.45
838	0.37
839	0.27
840	0.23
841	0.18
842	0.16
843	0.13
844	0.11
845	0.09
846	0.09
847	0.08
848	0.05
849	0.04
850	0.05
851	0.05
852	0.04
853	0.05
854	0.05
855	0.05
856	0.06
857	0.09
858	0.1
859	0.13
860	0.14
861	0.14
862	0.14
863	0.21
864	0.21
865	0.2
866	0.21
867	0.2
868	0.19
869	0.2
870	0.2
871	0.13
872	0.13
873	0.11
874	0.1
875	0.1
876	0.11
877	0.1
878	0.1
879	0.1
880	0.1
881	0.1
882	0.1
883	0.09
884	0.09
885	0.09
886	0.09
887	0.09
888	0.09
889	0.09
890	0.08
891	0.07
892	0.06
893	0.06
894	0.06
895	0.06
896	0.06
897	0.06
898	0.05
899	0.05
900	0.07
901	0.1
902	0.11
903	0.14
904	0.15
905	0.17
906	0.22
907	0.27
908	0.35
909	0.38
910	0.42
911	0.45
912	0.51
913	0.55
914	0.54
915	0.52
916	0.46
917	0.45
918	0.42
919	0.36
920	0.3
921	0.24
922	0.2
923	0.17
924	0.14
925	0.1
926	0.08
927	0.07
928	0.06
929	0.06
930	0.07
931	0.08
932	0.08
933	0.08
934	0.09
935	0.1
936	0.12
937	0.12
938	0.12
939	0.14
940	0.15
941	0.15
942	0.14
943	0.12
944	0.11
945	0.11
946	0.11
947	0.09
948	0.1
949	0.1
950	0.1
951	0.11
952	0.13
953	0.12
954	0.19
955	0.23
956	0.27
957	0.34
958	0.37
959	0.38
960	0.38
961	0.42
962	0.38
963	0.41
964	0.4
965	0.4
966	0.43
967	0.45
968	0.45
969	0.43
970	0.41
971	0.35
972	0.31
973	0.24
974	0.18
975	0.16
976	0.14
977	0.15
978	0.15
979	0.14
980	0.13
981	0.15
982	0.19
983	0.22
984	0.23
985	0.21
986	0.21
987	0.2
988	0.21
989	0.19
990	0.15
991	0.11
992	0.1
993	0.13
994	0.12
995	0.12
996	0.14
997	0.19
998	0.25
999	0.29
1000	0.35
1001	0.34
1002	0.36
1003	0.42
1004	0.44
1005	0.46
1006	0.45
1007	0.44
1008	0.39
1009	0.38
1010	0.35
1011	0.3
1012	0.24
1013	0.17
1014	0.14
1015	0.1
1016	0.08
1017	0.07
1018	0.09
1019	0.12
1020	0.12
1021	0.14
1022	0.14
1023	0.14
1024	0.14
1025	0.14
1026	0.14
1027	0.1
1028	0.1
1029	0.08
1030	0.08
1031	0.1
1032	0.1
1033	0.1
1034	0.08
1035	0.1
1036	0.12
1037	0.16
1038	0.24
1039	0.25
1040	0.26
1041	0.28
1042	0.32
1043	0.32
1044	0.33
1045	0.31
1046	0.25
1047	0.22
1048	0.24
1049	0.22
1050	0.19
1051	0.17
1052	0.15
1053	0.13
1054	0.11
1055	0.12
1056	0.12
1057	0.14
1058	0.16
1059	0.17
1060	0.27
1061	0.36
1062	0.42
1063	0.44
1064	0.47
1065	0.48
1066	0.47
1067	0.49
1068	0.47
1069	0.46
1070	0.45
1071	0.44
1072	0.4
1073	0.35
1074	0.34
1075	0.33
1076	0.26
1077	0.17
1078	0.12
1079	0.1
1080	0.09
1081	0.09
1082	0.09
1083	0.06
1084	0.05
1085	0.05
1086	0.04
1087	0.04
1088	0.05
1089	0.05
1090	0.05
1091	0.06
1092	0.06
1093	0.06
1094	0.06
1095	0.06
1096	0.06
1097	0.07
1098	0.07
1099	0.07
1100	0.07
1101	0.08
1102	0.08
1103	0.08
1104	0.09
1105	0.09
1106	0.09
1107	0.1
1108	0.15
1109	0.19
1110	0.2
1111	0.26
1112	0.25
1113	0.25
1114	0.26
1115	0.25
1116	0.23
1117	0.22
1118	0.22
1119	0.17
1120	0.16
1121	0.16
1122	0.15
1123	0.15
1124	0.11
1125	0.09
1126	0.08
1127	0.08
1128	0.08
1129	0.09
1130	0.12
1131	0.13
1132	0.17
1133	0.18
1134	0.19
1135	0.19
1136	0.2
1137	0.23
1138	0.24
1139	0.23
1140	0.22
1141	0.23
1142	0.23
1143	0.23
1144	0.22
1145	0.2
1146	0.15
1147	0.14
1148	0.12
1149	0.09
1150	0.08
1151	0.08
1152	0.09
1153	0.07
1154	0.09
1155	0.1
1156	0.13
1157	0.13
1158	0.13
1159	0.14
1160	0.17
1161	0.19
1162	0.23
1163	0.27
1164	0.33
1165	0.33
1166	0.32
1167	0.34
1168	0.34
1169	0.33
1170	0.29
1171	0.31
1172	0.27
1173	0.33
1174	0.4
1175	0.45
1176	0.52
1177	0.61
1178	0.7
1179	0.73
1180	0.75
1181	0.79
1182	0.81
1183	0.8
1184	0.79
1185	0.75
1186	0.73
1187	0.73
1188	0.74
1189	0.69
1190	0.68
1191	0.64
1192	0.61

C1GIU8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer