Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4T5U3

Protein Details
Accession A0A1E4T5U3    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
227-246DSDSKKDSKKRKSTESSSKDHydrophilic
333-355QVRGKDFTKGKNKMKRGSYRGGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
235-237KKR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0031326  P:regulation of cellular biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MSSSKDTLIPLIADYLKRNGFEKAEKALLKSIKDDIVIPESLDSQLEDLVSLPTIESKEESSSSSESDSSSDDSSSSDSDDSDSDSKDEEMKDADSSDSDSSDSDSDSDSDSSDSSDSDDEEEEKKEVIVNIVEETKEGSDSDSDSSDSDSDSSSDSDSNSSDSSDSDDEEEEKKEVIVNIVEETKAGSSSDSDSSDSDSDSSDSDSSDSDSDSSDSDSDNSDSDSDSDSKKDSKKRKSTESSSKDEPSSKKSKQETQPQEAESASSNTASNATSRNNSPIPAAVEELKPGQRNHFSRIEREKISFENQALMDNTYKGAAGTWGEQANSKLMQVRGKDFTKGKNKMKRGSYRGGSITMSSGSYKFQD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.26
3 0.27
4 0.28
5 0.29
6 0.29
7 0.31
8 0.35
9 0.37
10 0.37
11 0.42
12 0.42
13 0.43
14 0.46
15 0.45
16 0.41
17 0.39
18 0.37
19 0.31
20 0.31
21 0.3
22 0.26
23 0.26
24 0.24
25 0.22
26 0.19
27 0.18
28 0.17
29 0.16
30 0.12
31 0.09
32 0.09
33 0.08
34 0.08
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.06
40 0.08
41 0.09
42 0.1
43 0.1
44 0.11
45 0.14
46 0.15
47 0.16
48 0.18
49 0.18
50 0.19
51 0.19
52 0.18
53 0.16
54 0.16
55 0.16
56 0.15
57 0.15
58 0.14
59 0.12
60 0.12
61 0.13
62 0.13
63 0.12
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.11
68 0.14
69 0.14
70 0.14
71 0.13
72 0.14
73 0.15
74 0.17
75 0.17
76 0.14
77 0.14
78 0.14
79 0.14
80 0.14
81 0.13
82 0.11
83 0.13
84 0.12
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.1
108 0.11
109 0.13
110 0.12
111 0.12
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.1
117 0.09
118 0.1
119 0.11
120 0.11
121 0.09
122 0.1
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.06
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.1
152 0.09
153 0.1
154 0.09
155 0.1
156 0.11
157 0.13
158 0.14
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.09
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.04
176 0.05
177 0.07
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.1
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.1
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.11
216 0.13
217 0.18
218 0.24
219 0.32
220 0.39
221 0.48
222 0.58
223 0.64
224 0.72
225 0.76
226 0.79
227 0.82
228 0.79
229 0.75
230 0.7
231 0.66
232 0.59
233 0.56
234 0.49
235 0.46
236 0.48
237 0.45
238 0.48
239 0.5
240 0.57
241 0.6
242 0.68
243 0.69
244 0.68
245 0.7
246 0.63
247 0.59
248 0.5
249 0.42
250 0.33
251 0.26
252 0.18
253 0.13
254 0.12
255 0.11
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.12
260 0.14
261 0.16
262 0.18
263 0.23
264 0.23
265 0.24
266 0.23
267 0.24
268 0.24
269 0.22
270 0.22
271 0.19
272 0.19
273 0.2
274 0.22
275 0.22
276 0.23
277 0.23
278 0.28
279 0.34
280 0.37
281 0.42
282 0.48
283 0.46
284 0.52
285 0.59
286 0.6
287 0.54
288 0.54
289 0.51
290 0.46
291 0.48
292 0.43
293 0.35
294 0.33
295 0.3
296 0.31
297 0.28
298 0.27
299 0.23
300 0.19
301 0.19
302 0.14
303 0.14
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.11
309 0.14
310 0.15
311 0.16
312 0.18
313 0.18
314 0.2
315 0.19
316 0.18
317 0.2
318 0.22
319 0.27
320 0.29
321 0.33
322 0.37
323 0.39
324 0.45
325 0.45
326 0.51
327 0.57
328 0.63
329 0.67
330 0.7
331 0.77
332 0.79
333 0.84
334 0.85
335 0.82
336 0.83
337 0.78
338 0.75
339 0.7
340 0.64
341 0.55
342 0.46
343 0.4
344 0.3
345 0.26
346 0.21
347 0.18