Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4T8A3

Protein Details
Accession A0A1E4T8A3    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-58TDRVLVPIKKHDKKTKERLETKDDLQHydrophilic
296-323LKDTDMKSKSSKKKEKRKKGALTDTSSYHydrophilic
404-429ADSVSKSKLALKRKKESQKKSAFAGLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
303-315SKSSKKKEKRKKG
388-394RKVVKKD
406-423SVSKSKLALKRKKESQKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MSSKKIFNKKTAQTFQLVHRSHDDPLYFNGDSTDRVLVPIKKHDKKTKERLETKDDLQKELDAQIQHGDIRKNEGEAAIFGITYDDSQYDYMQHLRSIGDDTQGIFIANEANAPKDKKNQVMFKEDIVLPDELLPSKEKASYDYQRQQNIPDAISGFKPDLAPDLREALEALEDEAYIDGDYDIDDIDVFDQLLSGNKQKEISLNDYDGEDYADDDDDEWDMDNYEDEYEEYDSGNEGHSNARAEANSAGNFDWEKDFGKFKKAQSRGKIANDWDSDDEFGSEDEQEDALGDLPDLKDTDMKSKSSKKKEKRKKGALTDTSSYSMSSSALCRTEQMTIIDDKFDVMKDKYLEEEEDDYQPFDFKNERADFADMIDNFLDNYKLEKGGRKVVKKDPESERIQRAADSVSKSKLALKRKKESQKKSAFAGLTKDMGKMNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.67
3 0.67
4 0.59
5 0.51
6 0.49
7 0.47
8 0.43
9 0.44
10 0.37
11 0.29
12 0.31
13 0.35
14 0.29
15 0.27
16 0.27
17 0.23
18 0.23
19 0.23
20 0.22
21 0.15
22 0.17
23 0.23
24 0.25
25 0.29
26 0.38
27 0.46
28 0.52
29 0.61
30 0.69
31 0.74
32 0.8
33 0.87
34 0.87
35 0.87
36 0.88
37 0.86
38 0.85
39 0.81
40 0.77
41 0.74
42 0.65
43 0.57
44 0.49
45 0.43
46 0.35
47 0.32
48 0.3
49 0.21
50 0.2
51 0.2
52 0.19
53 0.2
54 0.23
55 0.24
56 0.2
57 0.27
58 0.27
59 0.26
60 0.25
61 0.24
62 0.2
63 0.17
64 0.19
65 0.12
66 0.11
67 0.1
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.06
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.11
78 0.15
79 0.15
80 0.15
81 0.15
82 0.15
83 0.15
84 0.18
85 0.17
86 0.15
87 0.14
88 0.15
89 0.15
90 0.15
91 0.14
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.09
97 0.08
98 0.1
99 0.13
100 0.16
101 0.19
102 0.26
103 0.31
104 0.36
105 0.44
106 0.5
107 0.51
108 0.56
109 0.55
110 0.47
111 0.48
112 0.41
113 0.34
114 0.29
115 0.24
116 0.17
117 0.17
118 0.16
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.11
123 0.12
124 0.14
125 0.13
126 0.16
127 0.24
128 0.29
129 0.36
130 0.44
131 0.48
132 0.51
133 0.52
134 0.5
135 0.49
136 0.45
137 0.37
138 0.29
139 0.24
140 0.21
141 0.2
142 0.19
143 0.12
144 0.11
145 0.11
146 0.09
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.13
151 0.16
152 0.15
153 0.15
154 0.15
155 0.11
156 0.1
157 0.08
158 0.08
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.05
181 0.07
182 0.1
183 0.11
184 0.12
185 0.13
186 0.13
187 0.16
188 0.18
189 0.22
190 0.21
191 0.21
192 0.2
193 0.2
194 0.19
195 0.16
196 0.13
197 0.08
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.1
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.13
234 0.12
235 0.12
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.15
245 0.15
246 0.22
247 0.26
248 0.3
249 0.39
250 0.46
251 0.52
252 0.54
253 0.62
254 0.62
255 0.62
256 0.61
257 0.53
258 0.53
259 0.46
260 0.42
261 0.35
262 0.29
263 0.25
264 0.2
265 0.18
266 0.11
267 0.1
268 0.08
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.09
285 0.1
286 0.18
287 0.19
288 0.21
289 0.27
290 0.37
291 0.46
292 0.54
293 0.64
294 0.67
295 0.76
296 0.86
297 0.91
298 0.92
299 0.93
300 0.92
301 0.92
302 0.93
303 0.9
304 0.85
305 0.77
306 0.68
307 0.59
308 0.49
309 0.38
310 0.28
311 0.2
312 0.14
313 0.12
314 0.11
315 0.12
316 0.13
317 0.13
318 0.14
319 0.15
320 0.17
321 0.18
322 0.18
323 0.18
324 0.19
325 0.2
326 0.19
327 0.18
328 0.16
329 0.15
330 0.14
331 0.15
332 0.13
333 0.17
334 0.18
335 0.19
336 0.2
337 0.22
338 0.22
339 0.21
340 0.23
341 0.21
342 0.23
343 0.23
344 0.21
345 0.19
346 0.19
347 0.16
348 0.15
349 0.16
350 0.13
351 0.23
352 0.24
353 0.27
354 0.29
355 0.31
356 0.29
357 0.28
358 0.34
359 0.24
360 0.24
361 0.21
362 0.18
363 0.16
364 0.16
365 0.15
366 0.09
367 0.12
368 0.12
369 0.15
370 0.17
371 0.24
372 0.28
373 0.37
374 0.46
375 0.51
376 0.56
377 0.62
378 0.7
379 0.67
380 0.72
381 0.7
382 0.7
383 0.7
384 0.71
385 0.69
386 0.63
387 0.59
388 0.51
389 0.45
390 0.4
391 0.38
392 0.36
393 0.33
394 0.32
395 0.32
396 0.32
397 0.39
398 0.41
399 0.46
400 0.5
401 0.56
402 0.63
403 0.72
404 0.82
405 0.85
406 0.89
407 0.89
408 0.9
409 0.85
410 0.8
411 0.78
412 0.71
413 0.63
414 0.59
415 0.52
416 0.46
417 0.42
418 0.38