Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4T1B0

Protein Details
Accession A0A1E4T1B0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
202-229FQIGLNNRNRPNKKRRQREQTNLPPIEHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
214-216KKR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001656  PsdUridine_synth_TruD  
IPR011760  PsdUridine_synth_TruD_insert  
IPR042214  TruD_catalytic  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF01142  TruD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50984  TRUD  
CDD cd02576  PseudoU_synth_ScPUS7  
Amino Acid Sequences MTDSTDLKRSLDDTTVVDNDQETKRVKVEEPQAGITEAEEEPVGTTEPDVGITECIYKGNGRITGTLKQRYTDFMVNEIDMNGNVVHLNDLGFYKPKDLTPEEAEKFAEKPKEEIKEEIEKEEEESKPVLQDFRISDEHKSKLIEIFGESDTEKILELFKEGKNVESEKAFDDKEDRTKIHQLLREIFKNKVDAMTTTSNHFQIGLNNRNRPNKKRRQREQTNLPPIEHNLGPQKNYIHLSIYKENKETMEVAGLLSKLLSIPTKWIKYAGTKDRRGVTVQRASIENLSVERINKLNRQLRGFQIGGFEYSDSCLNLGDLQGNEFIITIKDVKPVDPSLTIEEAVVPILESLGTNGFINYYGMQRFGTFSISTHEIGKQVLNSNWKAAAELILSEQKIVIPGSIEARKIWAETKDAGLALKKMPRKCSAEYSILSRLDKCDKTSDGDYSDNSYFNAIMGIPRNLRIMYGHAYQSYVWNTVASRRIQLFGLEVVAGDLVLVDNDKDKKDVVEEVKIVKEFDVNNEDFEEDVKKDSFVRARPVTDEEARSKKFDIHDIVLPSPGFDVIYPENEVLRNAYVEVMAKDGLDPFKMSRKVKEFSLSGSYRNVVSKVKGLSYEFRNYEKATEPLVRTDLELYRMRYKAMTYLGETDPQPERILEGTPGAPNTALILKLQLGVSTYATMALRELIKGDTSRYGDVVSLRTTTKES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.26
4 0.25
5 0.22
6 0.25
7 0.25
8 0.27
9 0.25
10 0.25
11 0.28
12 0.32
13 0.33
14 0.36
15 0.43
16 0.46
17 0.47
18 0.47
19 0.45
20 0.42
21 0.4
22 0.32
23 0.26
24 0.17
25 0.14
26 0.11
27 0.1
28 0.1
29 0.11
30 0.11
31 0.08
32 0.08
33 0.09
34 0.09
35 0.1
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.11
40 0.13
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.13
45 0.15
46 0.2
47 0.23
48 0.23
49 0.27
50 0.3
51 0.37
52 0.44
53 0.49
54 0.44
55 0.43
56 0.42
57 0.42
58 0.44
59 0.43
60 0.36
61 0.31
62 0.32
63 0.31
64 0.3
65 0.26
66 0.21
67 0.15
68 0.15
69 0.11
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.08
76 0.07
77 0.08
78 0.1
79 0.13
80 0.14
81 0.17
82 0.18
83 0.2
84 0.25
85 0.27
86 0.31
87 0.34
88 0.43
89 0.41
90 0.41
91 0.4
92 0.35
93 0.34
94 0.35
95 0.34
96 0.26
97 0.28
98 0.34
99 0.4
100 0.41
101 0.43
102 0.43
103 0.47
104 0.47
105 0.46
106 0.41
107 0.33
108 0.34
109 0.36
110 0.31
111 0.23
112 0.23
113 0.21
114 0.21
115 0.22
116 0.21
117 0.16
118 0.2
119 0.19
120 0.24
121 0.28
122 0.28
123 0.32
124 0.36
125 0.38
126 0.36
127 0.35
128 0.31
129 0.29
130 0.29
131 0.24
132 0.19
133 0.2
134 0.18
135 0.18
136 0.17
137 0.14
138 0.13
139 0.12
140 0.11
141 0.08
142 0.09
143 0.07
144 0.09
145 0.14
146 0.14
147 0.2
148 0.2
149 0.22
150 0.24
151 0.26
152 0.26
153 0.23
154 0.24
155 0.2
156 0.24
157 0.22
158 0.19
159 0.2
160 0.22
161 0.28
162 0.32
163 0.31
164 0.32
165 0.4
166 0.44
167 0.47
168 0.47
169 0.44
170 0.47
171 0.52
172 0.54
173 0.5
174 0.47
175 0.43
176 0.41
177 0.37
178 0.31
179 0.25
180 0.19
181 0.22
182 0.25
183 0.23
184 0.24
185 0.26
186 0.24
187 0.23
188 0.23
189 0.18
190 0.18
191 0.26
192 0.33
193 0.37
194 0.43
195 0.5
196 0.59
197 0.65
198 0.68
199 0.71
200 0.73
201 0.77
202 0.81
203 0.86
204 0.87
205 0.91
206 0.92
207 0.92
208 0.92
209 0.92
210 0.83
211 0.74
212 0.64
213 0.55
214 0.48
215 0.37
216 0.29
217 0.26
218 0.26
219 0.26
220 0.26
221 0.26
222 0.25
223 0.27
224 0.25
225 0.2
226 0.21
227 0.26
228 0.31
229 0.36
230 0.35
231 0.35
232 0.35
233 0.32
234 0.3
235 0.26
236 0.19
237 0.14
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.11
250 0.17
251 0.19
252 0.19
253 0.21
254 0.21
255 0.27
256 0.35
257 0.4
258 0.43
259 0.45
260 0.49
261 0.51
262 0.51
263 0.48
264 0.44
265 0.42
266 0.4
267 0.37
268 0.35
269 0.33
270 0.33
271 0.3
272 0.26
273 0.18
274 0.11
275 0.12
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.15
281 0.18
282 0.26
283 0.3
284 0.33
285 0.36
286 0.38
287 0.38
288 0.41
289 0.37
290 0.3
291 0.26
292 0.22
293 0.19
294 0.16
295 0.14
296 0.08
297 0.09
298 0.09
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.07
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.14
321 0.14
322 0.15
323 0.14
324 0.15
325 0.14
326 0.14
327 0.14
328 0.11
329 0.11
330 0.09
331 0.08
332 0.07
333 0.04
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.02
338 0.03
339 0.03
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.09
354 0.1
355 0.08
356 0.08
357 0.11
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.14
362 0.12
363 0.13
364 0.13
365 0.12
366 0.12
367 0.14
368 0.17
369 0.17
370 0.18
371 0.18
372 0.17
373 0.16
374 0.13
375 0.12
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.07
384 0.08
385 0.08
386 0.06
387 0.05
388 0.06
389 0.1
390 0.12
391 0.12
392 0.11
393 0.13
394 0.13
395 0.13
396 0.15
397 0.12
398 0.13
399 0.14
400 0.15
401 0.14
402 0.14
403 0.14
404 0.13
405 0.12
406 0.13
407 0.17
408 0.21
409 0.23
410 0.28
411 0.33
412 0.38
413 0.39
414 0.44
415 0.44
416 0.45
417 0.43
418 0.43
419 0.43
420 0.4
421 0.37
422 0.3
423 0.28
424 0.29
425 0.29
426 0.26
427 0.25
428 0.24
429 0.27
430 0.29
431 0.29
432 0.25
433 0.25
434 0.24
435 0.24
436 0.24
437 0.2
438 0.18
439 0.16
440 0.13
441 0.11
442 0.11
443 0.06
444 0.07
445 0.09
446 0.11
447 0.11
448 0.13
449 0.14
450 0.13
451 0.14
452 0.13
453 0.14
454 0.15
455 0.17
456 0.18
457 0.17
458 0.18
459 0.17
460 0.2
461 0.19
462 0.16
463 0.13
464 0.13
465 0.13
466 0.17
467 0.22
468 0.19
469 0.21
470 0.2
471 0.22
472 0.21
473 0.21
474 0.18
475 0.14
476 0.13
477 0.1
478 0.08
479 0.07
480 0.06
481 0.06
482 0.04
483 0.03
484 0.02
485 0.03
486 0.03
487 0.03
488 0.07
489 0.09
490 0.1
491 0.11
492 0.11
493 0.12
494 0.14
495 0.21
496 0.21
497 0.24
498 0.25
499 0.27
500 0.3
501 0.3
502 0.28
503 0.21
504 0.21
505 0.17
506 0.19
507 0.23
508 0.21
509 0.21
510 0.22
511 0.22
512 0.18
513 0.19
514 0.17
515 0.11
516 0.13
517 0.12
518 0.12
519 0.13
520 0.18
521 0.23
522 0.24
523 0.32
524 0.33
525 0.34
526 0.37
527 0.4
528 0.4
529 0.39
530 0.4
531 0.38
532 0.43
533 0.43
534 0.42
535 0.39
536 0.38
537 0.36
538 0.37
539 0.36
540 0.32
541 0.35
542 0.36
543 0.36
544 0.34
545 0.32
546 0.25
547 0.2
548 0.16
549 0.12
550 0.08
551 0.12
552 0.11
553 0.13
554 0.15
555 0.15
556 0.16
557 0.16
558 0.17
559 0.14
560 0.13
561 0.12
562 0.1
563 0.1
564 0.1
565 0.11
566 0.11
567 0.11
568 0.1
569 0.09
570 0.1
571 0.12
572 0.12
573 0.11
574 0.13
575 0.13
576 0.22
577 0.3
578 0.32
579 0.37
580 0.43
581 0.45
582 0.47
583 0.52
584 0.44
585 0.41
586 0.48
587 0.41
588 0.37
589 0.37
590 0.34
591 0.3
592 0.31
593 0.29
594 0.22
595 0.23
596 0.26
597 0.26
598 0.27
599 0.28
600 0.29
601 0.34
602 0.36
603 0.42
604 0.4
605 0.41
606 0.42
607 0.4
608 0.4
609 0.38
610 0.34
611 0.31
612 0.34
613 0.33
614 0.33
615 0.34
616 0.31
617 0.28
618 0.3
619 0.27
620 0.26
621 0.29
622 0.3
623 0.36
624 0.36
625 0.36
626 0.33
627 0.32
628 0.32
629 0.33
630 0.31
631 0.26
632 0.31
633 0.32
634 0.34
635 0.33
636 0.32
637 0.3
638 0.28
639 0.27
640 0.21
641 0.22
642 0.19
643 0.21
644 0.18
645 0.17
646 0.18
647 0.19
648 0.2
649 0.19
650 0.17
651 0.15
652 0.16
653 0.15
654 0.13
655 0.11
656 0.13
657 0.12
658 0.15
659 0.15
660 0.13
661 0.13
662 0.14
663 0.15
664 0.14
665 0.13
666 0.13
667 0.13
668 0.13
669 0.12
670 0.14
671 0.13
672 0.13
673 0.14
674 0.13
675 0.16
676 0.17
677 0.19
678 0.23
679 0.25
680 0.26
681 0.26
682 0.25
683 0.24
684 0.26
685 0.26
686 0.22
687 0.21
688 0.2