FuNGI

A0A1E4SYN3

Protein Details

Accession

A0A1E4SYN3

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
92-117	DYKERWLKDSKRQDTKIKQRALRSKI	Hydrophilic
164-185	IKVIKCKKTKVWGYNKAKKLRD	Hydrophilic
456-481	ELNREFRARKRDFHRGSKKRGKVTLI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
142-149	RLRKNARK
462-477	RARKRDFHRGSKKRGK

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MSKKQTHAVPTRIHVGSISAELASNINELETRFAKYGQIITPFTIHQKDNVDYHYGYVTILLTPESFKKLSKTFNGVNYKGSKLRINQAKPDYKERWLKDSKRQDTKIKQRALRSKIAQVRDERIANKDANPFELDKIIPGRLRKNARKDTRKLTLRVHYKDTIKVIKCKKTKVWGYNKAKKLRDMTYRFVNNLWMDGNDHIIDRLATNTLIFTEKGIQIEKQDPALLTQEVEDNEEVAVEKDMNNKLLESFLTKFNFEKPVELQTREEADADSDYEFEGKLREINSEDEDEDDDQVIDIHYKVPEKDCIKPSNESIIEANEDEAKTSVEQEEEEEEEEFIPTFGKTNSTQSASTNETEALRSLLNPTTSTSFKLVNDEDEDIDQTKTLEVESAPSLTVNSTAAIIPVLKERDLGLFFPHFESPFLNTQTQLNKLQTFKIQDKLQYDEWFFSNRGELNREFRARKRDFHRGSKKRGKVTLI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.34
3	0.28
4	0.24
5	0.21
6	0.13
7	0.12
8	0.13
9	0.13
10	0.12
11	0.1
12	0.08
13	0.08
14	0.09
15	0.09
16	0.14
17	0.14
18	0.17
19	0.18
20	0.19
21	0.2
22	0.22
23	0.27
24	0.26
25	0.31
26	0.29
27	0.29
28	0.31
29	0.3
30	0.33
31	0.33
32	0.29
33	0.27
34	0.31
35	0.33
36	0.34
37	0.35
38	0.34
39	0.3
40	0.31
41	0.27
42	0.22
43	0.19
44	0.16
45	0.14
46	0.09
47	0.1
48	0.09
49	0.08
50	0.1
51	0.13
52	0.16
53	0.16
54	0.17
55	0.23
56	0.27
57	0.34
58	0.38
59	0.44
60	0.45
61	0.53
62	0.61
63	0.56
64	0.57
65	0.54
66	0.52
67	0.48
68	0.46
69	0.42
70	0.37
71	0.46
72	0.49
73	0.5
74	0.55
75	0.61
76	0.67
77	0.65
78	0.7
79	0.65
80	0.63
81	0.68
82	0.62
83	0.62
84	0.63
85	0.65
86	0.66
87	0.73
88	0.75
89	0.76
90	0.79
91	0.8
92	0.81
93	0.85
94	0.84
95	0.82
96	0.77
97	0.77
98	0.8
99	0.76
100	0.75
101	0.68
102	0.67
103	0.66
104	0.66
105	0.61
106	0.56
107	0.55
108	0.51
109	0.51
110	0.43
111	0.4
112	0.38
113	0.35
114	0.34
115	0.36
116	0.31
117	0.29
118	0.3
119	0.27
120	0.24
121	0.25
122	0.21
123	0.16
124	0.18
125	0.18
126	0.19
127	0.21
128	0.25
129	0.31
130	0.41
131	0.47
132	0.55
133	0.63
134	0.7
135	0.77
136	0.79
137	0.79
138	0.79
139	0.79
140	0.73
141	0.7
142	0.69
143	0.68
144	0.66
145	0.63
146	0.58
147	0.54
148	0.53
149	0.51
150	0.5
151	0.44
152	0.49
153	0.51
154	0.54
155	0.56
156	0.58
157	0.58
158	0.6
159	0.65
160	0.67
161	0.7
162	0.71
163	0.77
164	0.81
165	0.84
166	0.82
167	0.76
168	0.71
169	0.66
170	0.62
171	0.61
172	0.57
173	0.54
174	0.54
175	0.54
176	0.49
177	0.44
178	0.41
179	0.31
180	0.27
181	0.22
182	0.14
183	0.13
184	0.12
185	0.13
186	0.09
187	0.09
188	0.08
189	0.08
190	0.07
191	0.06
192	0.07
193	0.06
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.06
198	0.07
199	0.07
200	0.07
201	0.09
202	0.1
203	0.11
204	0.12
205	0.12
206	0.13
207	0.16
208	0.16
209	0.14
210	0.14
211	0.13
212	0.13
213	0.14
214	0.12
215	0.09
216	0.09
217	0.1
218	0.09
219	0.11
220	0.09
221	0.08
222	0.07
223	0.07
224	0.07
225	0.05
226	0.05
227	0.04
228	0.05
229	0.09
230	0.1
231	0.12
232	0.12
233	0.11
234	0.11
235	0.12
236	0.11
237	0.1
238	0.11
239	0.14
240	0.15
241	0.16
242	0.16
243	0.18
244	0.24
245	0.21
246	0.22
247	0.19
248	0.26
249	0.28
250	0.29
251	0.28
252	0.24
253	0.26
254	0.24
255	0.23
256	0.15
257	0.13
258	0.12
259	0.11
260	0.09
261	0.07
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.07
269	0.07
270	0.09
271	0.1
272	0.12
273	0.14
274	0.15
275	0.15
276	0.14
277	0.15
278	0.14
279	0.13
280	0.11
281	0.09
282	0.07
283	0.07
284	0.06
285	0.05
286	0.05
287	0.06
288	0.07
289	0.09
290	0.1
291	0.12
292	0.19
293	0.22
294	0.29
295	0.33
296	0.37
297	0.39
298	0.4
299	0.4
300	0.42
301	0.39
302	0.34
303	0.28
304	0.25
305	0.23
306	0.2
307	0.19
308	0.13
309	0.12
310	0.11
311	0.11
312	0.1
313	0.09
314	0.1
315	0.1
316	0.08
317	0.08
318	0.09
319	0.11
320	0.11
321	0.11
322	0.11
323	0.1
324	0.1
325	0.1
326	0.09
327	0.07
328	0.07
329	0.06
330	0.07
331	0.07
332	0.1
333	0.11
334	0.16
335	0.19
336	0.22
337	0.23
338	0.23
339	0.27
340	0.27
341	0.26
342	0.23
343	0.2
344	0.18
345	0.18
346	0.17
347	0.14
348	0.11
349	0.1
350	0.12
351	0.14
352	0.14
353	0.14
354	0.16
355	0.18
356	0.19
357	0.21
358	0.21
359	0.21
360	0.2
361	0.25
362	0.24
363	0.23
364	0.25
365	0.24
366	0.23
367	0.21
368	0.22
369	0.18
370	0.17
371	0.14
372	0.12
373	0.1
374	0.09
375	0.08
376	0.08
377	0.07
378	0.1
379	0.11
380	0.11
381	0.11
382	0.11
383	0.11
384	0.1
385	0.11
386	0.08
387	0.07
388	0.08
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.08
394	0.13
395	0.15
396	0.14
397	0.14
398	0.15
399	0.19
400	0.2
401	0.2
402	0.19
403	0.19
404	0.2
405	0.22
406	0.24
407	0.2
408	0.19
409	0.21
410	0.21
411	0.25
412	0.28
413	0.26
414	0.25
415	0.29
416	0.33
417	0.36
418	0.38
419	0.36
420	0.37
421	0.38
422	0.41
423	0.42
424	0.44
425	0.44
426	0.46
427	0.46
428	0.47
429	0.49
430	0.51
431	0.5
432	0.49
433	0.47
434	0.42
435	0.39
436	0.37
437	0.34
438	0.29
439	0.28
440	0.26
441	0.27
442	0.3
443	0.32
444	0.35
445	0.43
446	0.5
447	0.51
448	0.54
449	0.61
450	0.61
451	0.66
452	0.68
453	0.71
454	0.72
455	0.78
456	0.82
457	0.81
458	0.87
459	0.89
460	0.89
461	0.87

A0A1E4SYN3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer