Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GE38

Protein Details
Accession C1GE38    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
63-92VAEATVAKKKTKKRTKKSRGKSKGTGFEEYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-85KKKTKKRTKKSRGKSK
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 12.5, nucl 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018606  Arb1  
Gene Ontology GO:0033167  C:ARC complex  
GO:0031047  P:RNA-mediated gene silencing  
KEGG pbn:PADG_05524  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09692  Arb1  
Amino Acid Sequences MSLPFRGKKLQRGSDGEPGEHAHDQTDGQKASSLDATNDRNTDTDEAASGGNIPEQPDGPEDVAEATVAKKKTKKRTKKSRGKSKGTGFEEYITDGPISVAEYEGNKTRYALRLETAIQRFQAKRKISSDRRNIFTKFLSYGGVDVGPKMFEGNDPHDLMDKDAEDILTATAQSSVPANRVDWDVDFEAVAKGFLSSVLPQYIGLETEQLVDMATSTIRNFLNFILLHDVCPEYTENILAARVICDTAKVELWKAQRASCWAPGNFNMACSTLFGGSYYGFYTGDQEWSKEVGAAGMPDDVARKVVKFAVAGAGTYEQAVRFRDLVNEQKLRVTCVNENGFEVIAIILPGSAVRDFYKQYAPDLQPVGKLRAKPWRDPGLPEEDLPPGQVAEENPSQPIEYEFFVEESVLKFCFVGMKVDTSIWELNCGLHYFDTAIAVYCSFHTVLLNESMIGWKKPRDLRSDVVVWANSGRECEDGNRGAEDPEDVVDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.68
3 0.59
4 0.51
5 0.44
6 0.4
7 0.35
8 0.29
9 0.21
10 0.19
11 0.19
12 0.21
13 0.26
14 0.22
15 0.21
16 0.24
17 0.24
18 0.25
19 0.28
20 0.25
21 0.21
22 0.27
23 0.31
24 0.31
25 0.32
26 0.3
27 0.27
28 0.29
29 0.28
30 0.23
31 0.19
32 0.16
33 0.16
34 0.15
35 0.14
36 0.12
37 0.1
38 0.11
39 0.11
40 0.12
41 0.12
42 0.12
43 0.14
44 0.15
45 0.17
46 0.16
47 0.15
48 0.14
49 0.13
50 0.13
51 0.11
52 0.1
53 0.09
54 0.14
55 0.16
56 0.21
57 0.27
58 0.36
59 0.47
60 0.58
61 0.68
62 0.73
63 0.83
64 0.89
65 0.94
66 0.96
67 0.96
68 0.96
69 0.94
70 0.92
71 0.9
72 0.89
73 0.83
74 0.76
75 0.66
76 0.58
77 0.49
78 0.42
79 0.33
80 0.23
81 0.18
82 0.13
83 0.11
84 0.09
85 0.09
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.1
91 0.16
92 0.17
93 0.16
94 0.17
95 0.2
96 0.25
97 0.27
98 0.27
99 0.23
100 0.25
101 0.27
102 0.35
103 0.35
104 0.31
105 0.28
106 0.33
107 0.34
108 0.37
109 0.43
110 0.38
111 0.42
112 0.46
113 0.56
114 0.59
115 0.67
116 0.72
117 0.71
118 0.72
119 0.71
120 0.67
121 0.6
122 0.52
123 0.45
124 0.35
125 0.29
126 0.25
127 0.19
128 0.18
129 0.15
130 0.14
131 0.11
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.08
139 0.12
140 0.16
141 0.19
142 0.2
143 0.2
144 0.23
145 0.23
146 0.21
147 0.19
148 0.15
149 0.12
150 0.12
151 0.11
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.11
170 0.14
171 0.13
172 0.12
173 0.12
174 0.11
175 0.1
176 0.09
177 0.09
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.08
209 0.13
210 0.12
211 0.13
212 0.16
213 0.16
214 0.16
215 0.16
216 0.16
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.12
239 0.14
240 0.18
241 0.19
242 0.19
243 0.19
244 0.23
245 0.25
246 0.26
247 0.3
248 0.26
249 0.27
250 0.27
251 0.3
252 0.25
253 0.23
254 0.18
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.11
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.09
270 0.09
271 0.13
272 0.13
273 0.13
274 0.13
275 0.14
276 0.14
277 0.12
278 0.11
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.05
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.09
293 0.1
294 0.09
295 0.1
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.11
300 0.11
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.06
305 0.08
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.11
310 0.14
311 0.18
312 0.25
313 0.31
314 0.32
315 0.31
316 0.35
317 0.34
318 0.35
319 0.34
320 0.3
321 0.26
322 0.31
323 0.33
324 0.29
325 0.3
326 0.26
327 0.24
328 0.19
329 0.17
330 0.09
331 0.06
332 0.05
333 0.04
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.07
341 0.09
342 0.11
343 0.14
344 0.19
345 0.19
346 0.22
347 0.29
348 0.29
349 0.32
350 0.34
351 0.32
352 0.32
353 0.34
354 0.37
355 0.32
356 0.32
357 0.32
358 0.39
359 0.42
360 0.44
361 0.5
362 0.54
363 0.53
364 0.55
365 0.55
366 0.53
367 0.5
368 0.44
369 0.38
370 0.3
371 0.28
372 0.24
373 0.2
374 0.12
375 0.11
376 0.12
377 0.1
378 0.13
379 0.16
380 0.16
381 0.17
382 0.18
383 0.17
384 0.16
385 0.18
386 0.14
387 0.12
388 0.13
389 0.13
390 0.13
391 0.13
392 0.13
393 0.12
394 0.11
395 0.12
396 0.1
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.13
401 0.13
402 0.16
403 0.16
404 0.18
405 0.19
406 0.2
407 0.21
408 0.2
409 0.23
410 0.19
411 0.2
412 0.17
413 0.17
414 0.18
415 0.19
416 0.16
417 0.13
418 0.13
419 0.12
420 0.12
421 0.12
422 0.11
423 0.11
424 0.1
425 0.1
426 0.1
427 0.09
428 0.11
429 0.1
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.13
434 0.15
435 0.15
436 0.13
437 0.13
438 0.18
439 0.19
440 0.21
441 0.22
442 0.23
443 0.31
444 0.38
445 0.44
446 0.47
447 0.51
448 0.53
449 0.57
450 0.57
451 0.52
452 0.5
453 0.44
454 0.37
455 0.32
456 0.3
457 0.23
458 0.21
459 0.19
460 0.15
461 0.17
462 0.19
463 0.24
464 0.25
465 0.26
466 0.27
467 0.27
468 0.26
469 0.25
470 0.23
471 0.17