Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GAW9

Protein Details
Accession C1GAW9    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
305-325ETPQRLKSPSRKQKRSSSPESHydrophilic
445-465VSDVTKPKRKPKQAESPIDSEHydrophilic
476-498EESTSPPSKRKRLDHKEPTGSPPHydrophilic
628-652EETPEERANRKRQELRKQLEARNNAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
312-329SPSRKQKRSSSPESPKSK
413-433KPKAKGPVGMIGGKKTPKKPR
636-667NRKRQELRKQLEARNNAGGAGGPAKKKKKRRF
Subcellular Location(s) nucl 18, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 10.833, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG pbn:PADG_04405  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSKWSILPLPNGNNTPHLLYKYVTSKSGCEIYLTDLAYIWSQSLSRREILNDASKYNTSIDPSEDEEQYFVLLEKIADALRGSGGSSISLTRGPGSEDLKLITSTNLPPPLDPLEWTFSLLQLPPVTLTKHILLPILKGEANHEARVLSLIDHIKQKDWTLSKLFDKIESSGMDLSTVFPGMGNVRLYRKESIYSQASKHIKGAAPFDEDSWKLEFQAKDADYNLGVHIAKELSGPLVELPADDFILENWWDKLGEGAVNRPKIATKGKAQENLTARKSPSLEELKDEEEEATQSDDADEFQTMETPQRLKSPSRKQKRSSSPESPKSKSKTIRMGTTGFHTKHEKESSALSSVETATSEDGDPRPPQQRGPKAKGLGTIGGKQPTKRKQSPVESSEFTESEDSESVAKEVSKPKAKGPVGMIGGKKTPKKPRQEAPSESTASDVSDVTKPKRKPKQAESPIDSEGVPTASEHETEESTSPPSKRKRLDHKEPTGSPPALKQQLRSGNVGGIGQIGGKQRKKQPEMIDVGKKSDKNDDTEEVTSPVPRQTSAKPQRPGGKLGIIGGRSRPAPKSPPASDDVNRAPGGELSESPVPSTSGKPTIATGATKQPPLIPEEKEKEAEQEKIEETPEERANRKRQELRKQLEARNNAGGAGGPAKKKKKRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.41
3 0.37
4 0.33
5 0.28
6 0.26
7 0.3
8 0.34
9 0.35
10 0.35
11 0.33
12 0.33
13 0.36
14 0.39
15 0.33
16 0.28
17 0.26
18 0.26
19 0.29
20 0.28
21 0.23
22 0.19
23 0.2
24 0.19
25 0.18
26 0.13
27 0.09
28 0.09
29 0.14
30 0.19
31 0.22
32 0.24
33 0.26
34 0.27
35 0.31
36 0.36
37 0.4
38 0.38
39 0.36
40 0.37
41 0.36
42 0.35
43 0.34
44 0.3
45 0.24
46 0.23
47 0.24
48 0.23
49 0.27
50 0.29
51 0.27
52 0.26
53 0.23
54 0.21
55 0.19
56 0.16
57 0.11
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.07
62 0.09
63 0.08
64 0.09
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.13
81 0.17
82 0.19
83 0.19
84 0.2
85 0.2
86 0.21
87 0.21
88 0.19
89 0.16
90 0.16
91 0.17
92 0.22
93 0.26
94 0.25
95 0.24
96 0.27
97 0.3
98 0.28
99 0.26
100 0.24
101 0.24
102 0.24
103 0.26
104 0.22
105 0.18
106 0.2
107 0.19
108 0.18
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.15
113 0.16
114 0.15
115 0.18
116 0.17
117 0.19
118 0.19
119 0.21
120 0.19
121 0.2
122 0.2
123 0.2
124 0.19
125 0.17
126 0.19
127 0.24
128 0.26
129 0.25
130 0.23
131 0.2
132 0.2
133 0.21
134 0.18
135 0.1
136 0.12
137 0.14
138 0.16
139 0.22
140 0.23
141 0.23
142 0.25
143 0.26
144 0.28
145 0.29
146 0.31
147 0.3
148 0.34
149 0.35
150 0.39
151 0.38
152 0.33
153 0.32
154 0.29
155 0.28
156 0.24
157 0.23
158 0.18
159 0.17
160 0.15
161 0.13
162 0.13
163 0.1
164 0.1
165 0.07
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.15
173 0.18
174 0.21
175 0.23
176 0.24
177 0.24
178 0.24
179 0.28
180 0.31
181 0.32
182 0.31
183 0.38
184 0.39
185 0.37
186 0.37
187 0.35
188 0.31
189 0.29
190 0.32
191 0.26
192 0.27
193 0.26
194 0.26
195 0.24
196 0.23
197 0.22
198 0.21
199 0.18
200 0.15
201 0.2
202 0.19
203 0.17
204 0.25
205 0.23
206 0.22
207 0.23
208 0.23
209 0.18
210 0.18
211 0.17
212 0.12
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.14
245 0.19
246 0.2
247 0.2
248 0.2
249 0.2
250 0.22
251 0.26
252 0.24
253 0.26
254 0.33
255 0.39
256 0.45
257 0.45
258 0.48
259 0.49
260 0.51
261 0.47
262 0.42
263 0.37
264 0.34
265 0.33
266 0.28
267 0.29
268 0.28
269 0.26
270 0.26
271 0.28
272 0.26
273 0.26
274 0.25
275 0.18
276 0.13
277 0.12
278 0.09
279 0.08
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.08
292 0.09
293 0.1
294 0.11
295 0.15
296 0.17
297 0.21
298 0.3
299 0.4
300 0.49
301 0.59
302 0.66
303 0.68
304 0.76
305 0.82
306 0.81
307 0.78
308 0.79
309 0.78
310 0.78
311 0.79
312 0.73
313 0.69
314 0.65
315 0.64
316 0.59
317 0.55
318 0.55
319 0.51
320 0.51
321 0.47
322 0.45
323 0.38
324 0.37
325 0.37
326 0.28
327 0.28
328 0.27
329 0.25
330 0.29
331 0.3
332 0.27
333 0.21
334 0.23
335 0.22
336 0.21
337 0.2
338 0.14
339 0.13
340 0.12
341 0.11
342 0.09
343 0.08
344 0.05
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.1
350 0.1
351 0.14
352 0.19
353 0.19
354 0.24
355 0.31
356 0.41
357 0.47
358 0.53
359 0.56
360 0.53
361 0.54
362 0.52
363 0.44
364 0.39
365 0.32
366 0.29
367 0.25
368 0.28
369 0.27
370 0.27
371 0.33
372 0.37
373 0.44
374 0.46
375 0.51
376 0.55
377 0.63
378 0.69
379 0.66
380 0.63
381 0.55
382 0.52
383 0.47
384 0.39
385 0.3
386 0.22
387 0.17
388 0.14
389 0.12
390 0.11
391 0.09
392 0.09
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.1
397 0.15
398 0.21
399 0.29
400 0.3
401 0.33
402 0.42
403 0.42
404 0.43
405 0.4
406 0.4
407 0.35
408 0.38
409 0.36
410 0.28
411 0.31
412 0.31
413 0.33
414 0.34
415 0.42
416 0.45
417 0.55
418 0.61
419 0.66
420 0.72
421 0.76
422 0.75
423 0.7
424 0.69
425 0.6
426 0.52
427 0.44
428 0.35
429 0.26
430 0.2
431 0.15
432 0.1
433 0.12
434 0.16
435 0.19
436 0.27
437 0.31
438 0.4
439 0.5
440 0.58
441 0.63
442 0.7
443 0.77
444 0.79
445 0.85
446 0.8
447 0.74
448 0.66
449 0.58
450 0.48
451 0.37
452 0.27
453 0.17
454 0.12
455 0.08
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.1
460 0.11
461 0.11
462 0.12
463 0.13
464 0.11
465 0.13
466 0.17
467 0.19
468 0.25
469 0.32
470 0.39
471 0.46
472 0.55
473 0.63
474 0.7
475 0.79
476 0.82
477 0.84
478 0.85
479 0.81
480 0.77
481 0.72
482 0.63
483 0.52
484 0.45
485 0.43
486 0.42
487 0.4
488 0.36
489 0.38
490 0.45
491 0.47
492 0.46
493 0.39
494 0.33
495 0.33
496 0.3
497 0.22
498 0.14
499 0.11
500 0.08
501 0.1
502 0.15
503 0.21
504 0.25
505 0.32
506 0.39
507 0.49
508 0.53
509 0.58
510 0.6
511 0.62
512 0.65
513 0.67
514 0.68
515 0.59
516 0.6
517 0.57
518 0.51
519 0.44
520 0.46
521 0.41
522 0.37
523 0.41
524 0.39
525 0.38
526 0.39
527 0.38
528 0.31
529 0.29
530 0.25
531 0.21
532 0.2
533 0.17
534 0.16
535 0.19
536 0.22
537 0.32
538 0.42
539 0.5
540 0.52
541 0.58
542 0.66
543 0.66
544 0.66
545 0.59
546 0.53
547 0.45
548 0.43
549 0.41
550 0.33
551 0.31
552 0.28
553 0.26
554 0.24
555 0.26
556 0.26
557 0.27
558 0.32
559 0.37
560 0.45
561 0.45
562 0.48
563 0.48
564 0.52
565 0.48
566 0.5
567 0.47
568 0.43
569 0.4
570 0.35
571 0.32
572 0.27
573 0.27
574 0.22
575 0.18
576 0.17
577 0.21
578 0.2
579 0.2
580 0.19
581 0.18
582 0.18
583 0.21
584 0.21
585 0.22
586 0.24
587 0.24
588 0.24
589 0.27
590 0.28
591 0.27
592 0.26
593 0.3
594 0.33
595 0.34
596 0.33
597 0.32
598 0.31
599 0.35
600 0.36
601 0.31
602 0.37
603 0.41
604 0.45
605 0.45
606 0.44
607 0.45
608 0.44
609 0.44
610 0.37
611 0.36
612 0.33
613 0.32
614 0.33
615 0.28
616 0.25
617 0.27
618 0.32
619 0.33
620 0.37
621 0.44
622 0.52
623 0.59
624 0.67
625 0.71
626 0.74
627 0.8
628 0.85
629 0.83
630 0.84
631 0.85
632 0.83
633 0.83
634 0.79
635 0.73
636 0.68
637 0.61
638 0.5
639 0.41
640 0.33
641 0.25
642 0.25
643 0.26
644 0.25
645 0.34
646 0.44
647 0.53