Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3BJS8

Protein Details
Accession A0A1E3BJS8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
603-627HDIPQKTRPKHLPPRPERLKRRDIABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
607-624QKTRPKHLPPRPERLKRR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR032549  DUF4939  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
IPR000477  RT_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF16297  DUF4939  
PF00078  RVT_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00303  retropepsin_like  
cd01647  RT_LTR  
Amino Acid Sequences MSAAPRPPFLPGSLEEFTDHAATHHSEWFQYCRLAYEYIEEAEAAIAEARGQADQTSLKLQASEMEVSRLKEELSALHLKQEKTQARNQGIIEYQKEQLQESQQKYLEALKEKDEALRLATPVVNTPARTPEPTAEIHTVAPVGTPASVDPPSTSSARLSERLPDPDRFEGDRKDLRRFISQIHEKMNVNHDRYPTPQSRMTYVTNRLRGAPYAQVLPYIKKGICQLKDYEEILKILDRAFGDPNRVNNARNELFRLRQANKEFGMFFAEFQRLALEGEMSEDVLPTLLEQAINRELRGMLMHNEPPNREYHQFANFLQDLENRRRHYENNSPPAARTYASATKPTNPVRPTELPATLQPAENNTDVMDLSSAHRHTTSRRDRGECFRCGSKNHLVRNCPLPDNRPPRTYTCVGTIPFPISRPVSKRSESGLSRDQTMNERTIRISAAATQGLTVEEESYRSNLMILPITLSRHEKELLSYAMLDTGAEGKRFIDKEWAQDQGLELLPLKKPIRLETFDGQEAESGPITHYAQMHMRINDHQERRACFLVTQLAHYPVVLGLPWLKIHDPRIGFAEHTVLFDSKYCQEHCNMPMRPAKIRALHDIPQKTRPKHLPPRPERLKRRDIAAVSMSACCAYARRSYRLFTVTVDDIEAALNPVPDEEDPMAKLPPEFQDFADVFSPKEAERLPPHRPYDHDIKLQDGKVPPFGPLYPMSREELKALKEWIEENLKKGFIRPSSSPAASPVLFVKKPGGGLRFCVDYRALNAITVKDRYPLPLTKETLNNLKGMKYFTKIDIISAFNNLRIKKGLEYLTAFPIYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.26
3 0.25
4 0.25
5 0.21
6 0.19
7 0.12
8 0.14
9 0.16
10 0.17
11 0.22
12 0.21
13 0.22
14 0.25
15 0.29
16 0.29
17 0.29
18 0.27
19 0.26
20 0.28
21 0.28
22 0.25
23 0.25
24 0.24
25 0.22
26 0.22
27 0.18
28 0.16
29 0.14
30 0.13
31 0.09
32 0.07
33 0.06
34 0.05
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.08
39 0.07
40 0.1
41 0.11
42 0.13
43 0.16
44 0.17
45 0.17
46 0.17
47 0.17
48 0.18
49 0.2
50 0.22
51 0.19
52 0.23
53 0.25
54 0.26
55 0.27
56 0.24
57 0.21
58 0.18
59 0.18
60 0.15
61 0.18
62 0.23
63 0.22
64 0.29
65 0.34
66 0.33
67 0.38
68 0.46
69 0.47
70 0.46
71 0.53
72 0.55
73 0.54
74 0.59
75 0.54
76 0.5
77 0.47
78 0.47
79 0.44
80 0.37
81 0.35
82 0.32
83 0.32
84 0.29
85 0.28
86 0.32
87 0.37
88 0.38
89 0.43
90 0.42
91 0.42
92 0.41
93 0.43
94 0.4
95 0.38
96 0.36
97 0.33
98 0.34
99 0.34
100 0.36
101 0.32
102 0.27
103 0.24
104 0.24
105 0.21
106 0.2
107 0.21
108 0.19
109 0.19
110 0.23
111 0.22
112 0.2
113 0.21
114 0.26
115 0.27
116 0.29
117 0.3
118 0.27
119 0.29
120 0.3
121 0.33
122 0.29
123 0.27
124 0.25
125 0.23
126 0.2
127 0.16
128 0.14
129 0.1
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.11
138 0.13
139 0.16
140 0.16
141 0.17
142 0.15
143 0.19
144 0.22
145 0.23
146 0.22
147 0.27
148 0.31
149 0.37
150 0.4
151 0.39
152 0.41
153 0.43
154 0.46
155 0.42
156 0.42
157 0.38
158 0.42
159 0.46
160 0.44
161 0.47
162 0.47
163 0.47
164 0.49
165 0.46
166 0.43
167 0.46
168 0.51
169 0.49
170 0.49
171 0.51
172 0.45
173 0.47
174 0.52
175 0.48
176 0.43
177 0.43
178 0.41
179 0.38
180 0.41
181 0.45
182 0.41
183 0.39
184 0.41
185 0.39
186 0.39
187 0.41
188 0.43
189 0.42
190 0.46
191 0.49
192 0.49
193 0.48
194 0.46
195 0.44
196 0.4
197 0.36
198 0.3
199 0.24
200 0.22
201 0.21
202 0.23
203 0.23
204 0.23
205 0.23
206 0.24
207 0.22
208 0.21
209 0.28
210 0.32
211 0.34
212 0.35
213 0.35
214 0.35
215 0.4
216 0.39
217 0.35
218 0.28
219 0.25
220 0.23
221 0.21
222 0.17
223 0.13
224 0.14
225 0.12
226 0.13
227 0.17
228 0.17
229 0.22
230 0.24
231 0.26
232 0.3
233 0.31
234 0.31
235 0.29
236 0.36
237 0.33
238 0.32
239 0.35
240 0.31
241 0.32
242 0.36
243 0.4
244 0.35
245 0.39
246 0.42
247 0.41
248 0.38
249 0.38
250 0.33
251 0.27
252 0.29
253 0.21
254 0.19
255 0.17
256 0.17
257 0.14
258 0.14
259 0.14
260 0.09
261 0.1
262 0.09
263 0.06
264 0.05
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.03
274 0.04
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.08
279 0.14
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.13
284 0.13
285 0.14
286 0.13
287 0.1
288 0.13
289 0.17
290 0.2
291 0.22
292 0.22
293 0.23
294 0.24
295 0.26
296 0.24
297 0.23
298 0.23
299 0.26
300 0.28
301 0.27
302 0.31
303 0.27
304 0.26
305 0.24
306 0.24
307 0.24
308 0.28
309 0.34
310 0.29
311 0.32
312 0.34
313 0.36
314 0.39
315 0.45
316 0.48
317 0.49
318 0.51
319 0.49
320 0.47
321 0.47
322 0.41
323 0.3
324 0.21
325 0.19
326 0.22
327 0.23
328 0.27
329 0.26
330 0.29
331 0.35
332 0.38
333 0.39
334 0.33
335 0.34
336 0.36
337 0.37
338 0.37
339 0.34
340 0.32
341 0.26
342 0.26
343 0.29
344 0.23
345 0.21
346 0.17
347 0.16
348 0.17
349 0.16
350 0.15
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.09
355 0.07
356 0.05
357 0.06
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.1
362 0.11
363 0.14
364 0.24
365 0.32
366 0.37
367 0.43
368 0.46
369 0.49
370 0.58
371 0.62
372 0.54
373 0.48
374 0.45
375 0.42
376 0.4
377 0.42
378 0.4
379 0.41
380 0.45
381 0.46
382 0.44
383 0.44
384 0.49
385 0.46
386 0.4
387 0.35
388 0.33
389 0.37
390 0.44
391 0.45
392 0.41
393 0.41
394 0.4
395 0.45
396 0.43
397 0.35
398 0.3
399 0.29
400 0.27
401 0.26
402 0.23
403 0.19
404 0.18
405 0.17
406 0.15
407 0.13
408 0.16
409 0.18
410 0.22
411 0.25
412 0.26
413 0.27
414 0.28
415 0.33
416 0.31
417 0.33
418 0.35
419 0.31
420 0.32
421 0.31
422 0.29
423 0.26
424 0.27
425 0.26
426 0.2
427 0.2
428 0.18
429 0.18
430 0.17
431 0.14
432 0.12
433 0.1
434 0.11
435 0.1
436 0.1
437 0.09
438 0.09
439 0.08
440 0.08
441 0.06
442 0.05
443 0.05
444 0.06
445 0.06
446 0.07
447 0.07
448 0.06
449 0.07
450 0.07
451 0.08
452 0.07
453 0.07
454 0.08
455 0.08
456 0.09
457 0.11
458 0.12
459 0.12
460 0.13
461 0.14
462 0.13
463 0.13
464 0.16
465 0.15
466 0.13
467 0.12
468 0.1
469 0.1
470 0.09
471 0.08
472 0.05
473 0.08
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.13
479 0.14
480 0.14
481 0.19
482 0.19
483 0.25
484 0.28
485 0.3
486 0.26
487 0.26
488 0.26
489 0.19
490 0.18
491 0.13
492 0.11
493 0.11
494 0.11
495 0.16
496 0.17
497 0.16
498 0.17
499 0.21
500 0.27
501 0.28
502 0.33
503 0.31
504 0.34
505 0.34
506 0.34
507 0.29
508 0.23
509 0.21
510 0.16
511 0.12
512 0.09
513 0.07
514 0.09
515 0.1
516 0.11
517 0.1
518 0.11
519 0.14
520 0.18
521 0.22
522 0.21
523 0.22
524 0.22
525 0.28
526 0.35
527 0.35
528 0.36
529 0.36
530 0.37
531 0.4
532 0.4
533 0.34
534 0.26
535 0.25
536 0.27
537 0.23
538 0.23
539 0.21
540 0.21
541 0.2
542 0.2
543 0.18
544 0.11
545 0.11
546 0.08
547 0.07
548 0.06
549 0.07
550 0.07
551 0.08
552 0.1
553 0.12
554 0.15
555 0.2
556 0.2
557 0.2
558 0.22
559 0.22
560 0.21
561 0.19
562 0.2
563 0.15
564 0.15
565 0.15
566 0.13
567 0.12
568 0.13
569 0.15
570 0.15
571 0.18
572 0.19
573 0.19
574 0.21
575 0.26
576 0.3
577 0.37
578 0.34
579 0.37
580 0.41
581 0.42
582 0.44
583 0.43
584 0.44
585 0.41
586 0.43
587 0.45
588 0.44
589 0.47
590 0.51
591 0.54
592 0.52
593 0.55
594 0.6
595 0.55
596 0.59
597 0.61
598 0.64
599 0.67
600 0.73
601 0.74
602 0.74
603 0.83
604 0.85
605 0.87
606 0.87
607 0.85
608 0.86
609 0.77
610 0.74
611 0.7
612 0.61
613 0.55
614 0.48
615 0.41
616 0.33
617 0.3
618 0.25
619 0.18
620 0.17
621 0.11
622 0.1
623 0.1
624 0.17
625 0.21
626 0.27
627 0.3
628 0.32
629 0.36
630 0.38
631 0.37
632 0.3
633 0.3
634 0.26
635 0.24
636 0.22
637 0.18
638 0.15
639 0.14
640 0.12
641 0.08
642 0.07
643 0.07
644 0.06
645 0.06
646 0.08
647 0.07
648 0.11
649 0.11
650 0.12
651 0.13
652 0.15
653 0.15
654 0.14
655 0.15
656 0.14
657 0.17
658 0.2
659 0.21
660 0.2
661 0.26
662 0.26
663 0.28
664 0.29
665 0.25
666 0.2
667 0.2
668 0.21
669 0.14
670 0.17
671 0.16
672 0.18
673 0.27
674 0.33
675 0.39
676 0.46
677 0.51
678 0.52
679 0.55
680 0.55
681 0.56
682 0.56
683 0.56
684 0.49
685 0.5
686 0.52
687 0.49
688 0.49
689 0.44
690 0.39
691 0.37
692 0.37
693 0.32
694 0.28
695 0.28
696 0.26
697 0.25
698 0.27
699 0.25
700 0.27
701 0.29
702 0.3
703 0.31
704 0.31
705 0.32
706 0.3
707 0.29
708 0.29
709 0.28
710 0.26
711 0.26
712 0.29
713 0.34
714 0.33
715 0.33
716 0.35
717 0.35
718 0.33
719 0.36
720 0.37
721 0.32
722 0.37
723 0.37
724 0.39
725 0.44
726 0.45
727 0.42
728 0.38
729 0.38
730 0.32
731 0.3
732 0.3
733 0.3
734 0.29
735 0.29
736 0.29
737 0.26
738 0.3
739 0.34
740 0.34
741 0.28
742 0.32
743 0.34
744 0.35
745 0.33
746 0.32
747 0.28
748 0.25
749 0.26
750 0.28
751 0.25
752 0.22
753 0.24
754 0.26
755 0.29
756 0.29
757 0.27
758 0.25
759 0.25
760 0.27
761 0.32
762 0.33
763 0.36
764 0.42
765 0.44
766 0.47
767 0.51
768 0.52
769 0.55
770 0.51
771 0.48
772 0.41
773 0.41
774 0.38
775 0.38
776 0.36
777 0.32
778 0.34
779 0.33
780 0.39
781 0.35
782 0.36
783 0.34
784 0.34
785 0.31
786 0.34
787 0.32
788 0.29
789 0.34
790 0.32
791 0.31
792 0.31
793 0.32
794 0.29
795 0.35
796 0.35
797 0.35
798 0.39
799 0.39
800 0.42