Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GH85

Protein Details
Accession C1GH85    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
63-86VNGANNRQQTRPRKEPQKPGDSATHydrophilic
404-423DPLHRSKPPSPKTRRRTVAEBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 9.5, cyto_nucl 9.333, cyto_mito 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
KEGG pbn:PADG_06621  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
CDD cd22265  UDM1_RNF168  
Amino Acid Sequences MATAVSTKPPLHKIKRPAPSYIQTGINGMRTSQPSPSPLGSATNRFSGTKQPGAVTPTNAAVVNGANNRQQTRPRKEPQKPGDSATRLHPPPTKPPGMDVPVADCRQLKKFPEPYVKTTSYILKKYSKSPPSLTIHLHPTHFRFDQQDGSFPYNSEMKVIIEHIKAGTVPHDMIEELVKGGVRFYENCLIVRVVDHKSVSSQPNPASNSSSGEKTSPFSLHNYNQHVTPSPFVPYPQQNQSSVNATTNGTSTNSQRADEQSSTEANNGLSESNANTTDSGTSKQKAPKPRVFTTVLHPTPQSLLAELTLLSMTPDPRAVNRRQSQAYSTLRTGSIPQPPTPLSALPSSPVTDRAPPAKRQKMMVEPSELLEAEAKLIHATAPPLYLEPVDGLAASANLLKFLEDPLHRSKPPSPKTRRRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLGPTTSGNGGGAKAPNVDDESGAAPFEPRFSRFKTLEKIRLEHEEKAKLEHEKKLQQDHAKRLQQEAEREKRRANEQRLAEEQSREDNRRQQAAAAAAAAAAAAQHAQVQAQVAAAAAQNRRPQSRGNPAMSTPHKPQPQQMIPASQGQQSSPVVRHSTPHSSSPLAGTLMGAQMNQGMPIAMTSSAQGAGSPLQVTSGVQHSHPAVMGHPMTASRSQQGPSRHGTPQMPHGTPAMSHATPTMRNATPTQRMTHASPNASTMAHTPVMSHAIMANPQMNGVMMTPQQQQQAIMQRQKIMLQRSLQAGGQQLNPQQLAQLQASMHAQQNIQHAQQQQQQQQQQQQQQQQQHNIFLQQQQQQQQQQQQPPPHQPQPHQPPPHQPQPHQFPSQAAYQAHVIRSQLAQMHMSHQQAIHGQQQGSPQQLPQQQVIAQANGVPQTQVGLQPRYRALYAQRVLPQVQIEVRAKFTQQYGHMTGWPENIRQQFQEQVDKTAKQYLFEIMKREGQQQRAQMAQNQAQAQAQAHAQVQAQVQAQAQALQQQHHQQQMVGNNMAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.78
3 0.76
4 0.75
5 0.74
6 0.71
7 0.69
8 0.63
9 0.58
10 0.48
11 0.48
12 0.43
13 0.39
14 0.33
15 0.27
16 0.28
17 0.28
18 0.29
19 0.3
20 0.31
21 0.29
22 0.34
23 0.34
24 0.31
25 0.28
26 0.33
27 0.33
28 0.36
29 0.36
30 0.36
31 0.37
32 0.36
33 0.36
34 0.38
35 0.41
36 0.4
37 0.39
38 0.36
39 0.38
40 0.43
41 0.45
42 0.38
43 0.33
44 0.29
45 0.29
46 0.27
47 0.23
48 0.17
49 0.15
50 0.18
51 0.19
52 0.21
53 0.23
54 0.27
55 0.3
56 0.34
57 0.42
58 0.48
59 0.54
60 0.61
61 0.68
62 0.75
63 0.82
64 0.88
65 0.88
66 0.88
67 0.82
68 0.77
69 0.76
70 0.69
71 0.62
72 0.56
73 0.56
74 0.47
75 0.49
76 0.5
77 0.45
78 0.51
79 0.58
80 0.59
81 0.5
82 0.53
83 0.56
84 0.54
85 0.52
86 0.43
87 0.4
88 0.41
89 0.41
90 0.38
91 0.33
92 0.32
93 0.35
94 0.4
95 0.39
96 0.41
97 0.48
98 0.55
99 0.64
100 0.66
101 0.66
102 0.69
103 0.67
104 0.59
105 0.54
106 0.54
107 0.5
108 0.49
109 0.48
110 0.47
111 0.48
112 0.54
113 0.61
114 0.59
115 0.58
116 0.58
117 0.61
118 0.6
119 0.62
120 0.59
121 0.54
122 0.54
123 0.52
124 0.5
125 0.45
126 0.42
127 0.43
128 0.39
129 0.37
130 0.33
131 0.33
132 0.39
133 0.36
134 0.39
135 0.37
136 0.4
137 0.38
138 0.34
139 0.34
140 0.29
141 0.27
142 0.22
143 0.19
144 0.15
145 0.16
146 0.18
147 0.2
148 0.17
149 0.18
150 0.17
151 0.16
152 0.16
153 0.15
154 0.15
155 0.12
156 0.12
157 0.11
158 0.12
159 0.11
160 0.11
161 0.12
162 0.1
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.16
172 0.22
173 0.23
174 0.24
175 0.25
176 0.24
177 0.22
178 0.23
179 0.22
180 0.18
181 0.2
182 0.2
183 0.19
184 0.21
185 0.27
186 0.3
187 0.29
188 0.32
189 0.31
190 0.37
191 0.39
192 0.38
193 0.36
194 0.32
195 0.33
196 0.3
197 0.3
198 0.24
199 0.24
200 0.23
201 0.2
202 0.22
203 0.2
204 0.19
205 0.21
206 0.26
207 0.31
208 0.37
209 0.42
210 0.4
211 0.39
212 0.39
213 0.39
214 0.34
215 0.3
216 0.24
217 0.21
218 0.21
219 0.21
220 0.25
221 0.27
222 0.32
223 0.37
224 0.39
225 0.38
226 0.4
227 0.41
228 0.39
229 0.35
230 0.3
231 0.24
232 0.21
233 0.2
234 0.18
235 0.17
236 0.14
237 0.15
238 0.15
239 0.21
240 0.22
241 0.22
242 0.23
243 0.25
244 0.29
245 0.28
246 0.28
247 0.23
248 0.23
249 0.23
250 0.22
251 0.2
252 0.14
253 0.14
254 0.12
255 0.1
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.12
265 0.13
266 0.15
267 0.17
268 0.18
269 0.23
270 0.3
271 0.36
272 0.44
273 0.52
274 0.56
275 0.6
276 0.63
277 0.62
278 0.6
279 0.56
280 0.54
281 0.55
282 0.48
283 0.42
284 0.38
285 0.33
286 0.29
287 0.29
288 0.22
289 0.12
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.09
294 0.08
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.09
302 0.09
303 0.13
304 0.2
305 0.24
306 0.33
307 0.38
308 0.44
309 0.45
310 0.46
311 0.45
312 0.47
313 0.48
314 0.42
315 0.37
316 0.33
317 0.3
318 0.29
319 0.29
320 0.25
321 0.27
322 0.26
323 0.25
324 0.27
325 0.27
326 0.29
327 0.27
328 0.23
329 0.18
330 0.17
331 0.17
332 0.15
333 0.15
334 0.14
335 0.13
336 0.16
337 0.15
338 0.16
339 0.19
340 0.25
341 0.28
342 0.35
343 0.44
344 0.49
345 0.49
346 0.5
347 0.52
348 0.53
349 0.54
350 0.5
351 0.44
352 0.37
353 0.35
354 0.33
355 0.28
356 0.2
357 0.15
358 0.12
359 0.08
360 0.07
361 0.07
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.1
390 0.09
391 0.14
392 0.21
393 0.26
394 0.26
395 0.29
396 0.35
397 0.41
398 0.49
399 0.55
400 0.59
401 0.65
402 0.72
403 0.79
404 0.8
405 0.75
406 0.73
407 0.66
408 0.64
409 0.56
410 0.49
411 0.4
412 0.32
413 0.27
414 0.2
415 0.16
416 0.07
417 0.05
418 0.04
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.04
427 0.04
428 0.06
429 0.07
430 0.07
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.07
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.07
450 0.07
451 0.08
452 0.07
453 0.07
454 0.06
455 0.06
456 0.05
457 0.08
458 0.08
459 0.1
460 0.13
461 0.16
462 0.22
463 0.24
464 0.28
465 0.34
466 0.4
467 0.46
468 0.45
469 0.44
470 0.4
471 0.46
472 0.45
473 0.41
474 0.39
475 0.36
476 0.33
477 0.34
478 0.34
479 0.32
480 0.32
481 0.32
482 0.34
483 0.34
484 0.37
485 0.4
486 0.43
487 0.45
488 0.49
489 0.51
490 0.55
491 0.53
492 0.51
493 0.48
494 0.48
495 0.43
496 0.44
497 0.45
498 0.46
499 0.47
500 0.48
501 0.48
502 0.45
503 0.51
504 0.53
505 0.51
506 0.48
507 0.46
508 0.49
509 0.49
510 0.51
511 0.43
512 0.35
513 0.29
514 0.28
515 0.3
516 0.28
517 0.28
518 0.3
519 0.31
520 0.33
521 0.32
522 0.27
523 0.25
524 0.24
525 0.21
526 0.15
527 0.11
528 0.08
529 0.08
530 0.07
531 0.04
532 0.02
533 0.02
534 0.02
535 0.02
536 0.03
537 0.03
538 0.03
539 0.04
540 0.04
541 0.05
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.05
547 0.08
548 0.08
549 0.12
550 0.15
551 0.18
552 0.19
553 0.2
554 0.23
555 0.27
556 0.37
557 0.41
558 0.4
559 0.4
560 0.39
561 0.46
562 0.46
563 0.43
564 0.37
565 0.37
566 0.38
567 0.37
568 0.41
569 0.43
570 0.44
571 0.45
572 0.43
573 0.38
574 0.36
575 0.39
576 0.36
577 0.28
578 0.25
579 0.19
580 0.2
581 0.18
582 0.18
583 0.15
584 0.17
585 0.17
586 0.17
587 0.19
588 0.2
589 0.27
590 0.27
591 0.29
592 0.29
593 0.27
594 0.27
595 0.26
596 0.23
597 0.16
598 0.14
599 0.11
600 0.09
601 0.09
602 0.08
603 0.07
604 0.05
605 0.06
606 0.06
607 0.06
608 0.05
609 0.04
610 0.04
611 0.04
612 0.05
613 0.04
614 0.04
615 0.04
616 0.05
617 0.06
618 0.06
619 0.05
620 0.05
621 0.06
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.06
628 0.07
629 0.1
630 0.1
631 0.1
632 0.12
633 0.12
634 0.12
635 0.13
636 0.12
637 0.09
638 0.12
639 0.12
640 0.1
641 0.1
642 0.1
643 0.11
644 0.13
645 0.14
646 0.12
647 0.14
648 0.16
649 0.2
650 0.24
651 0.26
652 0.29
653 0.32
654 0.32
655 0.34
656 0.36
657 0.33
658 0.38
659 0.41
660 0.37
661 0.33
662 0.32
663 0.28
664 0.25
665 0.26
666 0.22
667 0.15
668 0.15
669 0.16
670 0.17
671 0.18
672 0.2
673 0.22
674 0.17
675 0.2
676 0.23
677 0.27
678 0.33
679 0.34
680 0.34
681 0.32
682 0.35
683 0.36
684 0.41
685 0.4
686 0.34
687 0.32
688 0.32
689 0.3
690 0.26
691 0.23
692 0.17
693 0.16
694 0.15
695 0.14
696 0.13
697 0.13
698 0.15
699 0.14
700 0.13
701 0.1
702 0.1
703 0.11
704 0.12
705 0.12
706 0.1
707 0.1
708 0.1
709 0.09
710 0.08
711 0.08
712 0.09
713 0.07
714 0.11
715 0.13
716 0.16
717 0.18
718 0.18
719 0.18
720 0.2
721 0.3
722 0.34
723 0.37
724 0.36
725 0.37
726 0.38
727 0.42
728 0.42
729 0.37
730 0.35
731 0.32
732 0.34
733 0.34
734 0.35
735 0.3
736 0.27
737 0.25
738 0.22
739 0.22
740 0.22
741 0.21
742 0.23
743 0.23
744 0.2
745 0.18
746 0.17
747 0.18
748 0.15
749 0.15
750 0.12
751 0.14
752 0.15
753 0.17
754 0.18
755 0.16
756 0.16
757 0.18
758 0.24
759 0.26
760 0.25
761 0.27
762 0.28
763 0.31
764 0.36
765 0.41
766 0.42
767 0.47
768 0.52
769 0.53
770 0.59
771 0.62
772 0.64
773 0.64
774 0.66
775 0.65
776 0.68
777 0.69
778 0.7
779 0.64
780 0.6
781 0.54
782 0.49
783 0.45
784 0.4
785 0.4
786 0.38
787 0.41
788 0.43
789 0.48
790 0.52
791 0.55
792 0.59
793 0.61
794 0.62
795 0.64
796 0.65
797 0.65
798 0.68
799 0.7
800 0.69
801 0.67
802 0.63
803 0.67
804 0.7
805 0.73
806 0.71
807 0.67
808 0.7
809 0.71
810 0.77
811 0.73
812 0.68
813 0.67
814 0.7
815 0.73
816 0.66
817 0.6
818 0.52
819 0.47
820 0.47
821 0.43
822 0.34
823 0.28
824 0.29
825 0.31
826 0.29
827 0.28
828 0.24
829 0.2
830 0.2
831 0.21
832 0.19
833 0.18
834 0.19
835 0.18
836 0.22
837 0.25
838 0.26
839 0.25
840 0.21
841 0.22
842 0.23
843 0.25
844 0.27
845 0.27
846 0.27
847 0.27
848 0.33
849 0.35
850 0.36
851 0.33
852 0.29
853 0.31
854 0.35
855 0.36
856 0.31
857 0.31
858 0.28
859 0.34
860 0.35
861 0.29
862 0.24
863 0.23
864 0.23
865 0.21
866 0.2
867 0.13
868 0.1
869 0.11
870 0.12
871 0.16
872 0.19
873 0.24
874 0.25
875 0.3
876 0.33
877 0.35
878 0.34
879 0.32
880 0.33
881 0.37
882 0.38
883 0.4
884 0.43
885 0.43
886 0.43
887 0.42
888 0.38
889 0.31
890 0.31
891 0.31
892 0.3
893 0.28
894 0.31
895 0.3
896 0.3
897 0.3
898 0.3
899 0.29
900 0.29
901 0.35
902 0.34
903 0.35
904 0.37
905 0.37
906 0.37
907 0.38
908 0.37
909 0.32
910 0.34
911 0.38
912 0.38
913 0.37
914 0.38
915 0.39
916 0.41
917 0.48
918 0.43
919 0.45
920 0.47
921 0.47
922 0.45
923 0.47
924 0.43
925 0.34
926 0.34
927 0.35
928 0.37
929 0.38
930 0.41
931 0.36
932 0.42
933 0.43
934 0.51
935 0.5
936 0.49
937 0.52
938 0.54
939 0.55
940 0.54
941 0.54
942 0.51
943 0.53
944 0.52
945 0.51
946 0.46
947 0.43
948 0.38
949 0.37
950 0.32
951 0.26
952 0.21
953 0.18
954 0.18
955 0.19
956 0.18
957 0.2
958 0.2
959 0.23
960 0.23
961 0.22
962 0.22
963 0.23
964 0.22
965 0.21
966 0.2
967 0.22
968 0.23
969 0.23
970 0.27
971 0.33
972 0.38
973 0.41
974 0.42
975 0.37
976 0.41
977 0.45
978 0.47