Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GDN0

Protein Details
Accession C1GDN0    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
115-143HIRGCLKAKQEKARKKKEARDAANRAKEKBasic
197-225DIDDDKDKEPKKKKKKDEPKPKAAKPKGPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-151KAKQEKARKKKEARDAANRAKEKALGKDKGK
176-224KSAKKSAGGDDGTKKGKKRKADIDDDKDKEPKKKKKKDEPKPKAAKPKG
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 15, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013243  SCA7_dom  
IPR037804  SGF73  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
KEGG pbn:PADG_05366  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08313  SCA7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51505  SCA7  
Amino Acid Sequences MVTTASSVASSSGPSFVDASGYKFSDKDNRLGKLKVTKKTAAKNAKTAAAAAGRKESEKMDGDPDSRASTSPILPEMDDKIVAVFPNGKPRETQLETVICKHCKRPVLRQTAAEHIRGCLKAKQEKARKKKEARDAANRAKEKALGKDKGKDGDEKGDDRSGIGGMDDDDAVKGQKSAKKSAGGDDGTKKGKKRKADIDDDKDKEPKKKKKKDEPKPKAAKPKGPVDVEKQCGVPLPNGGQCARSLTCKSHSMGAKRAVPGRSLPYDMLLQAYQKKNQARQQKAAIDANAPIHDDLDGNGPIDSDEERDAVMAGLARSNHQPLVTHPLIPTRRKYHLVRMKEMLSQVLGGARGGIFSQPRDVTNQGQGGRAMLTSDSTNIAASPTSAVDPSAQSAETSKKPSISQQAAQNRVSQVTAAAAAKKPATITTTTATTATATTTTTAAAAAAATAATSTATGSGSATATAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.12
4 0.16
5 0.15
6 0.18
7 0.21
8 0.22
9 0.22
10 0.21
11 0.25
12 0.31
13 0.33
14 0.38
15 0.41
16 0.46
17 0.5
18 0.52
19 0.55
20 0.55
21 0.6
22 0.6
23 0.6
24 0.61
25 0.65
26 0.72
27 0.76
28 0.76
29 0.73
30 0.73
31 0.7
32 0.67
33 0.59
34 0.51
35 0.45
36 0.41
37 0.37
38 0.31
39 0.32
40 0.29
41 0.29
42 0.3
43 0.27
44 0.25
45 0.26
46 0.27
47 0.26
48 0.29
49 0.3
50 0.3
51 0.31
52 0.28
53 0.25
54 0.24
55 0.21
56 0.2
57 0.2
58 0.2
59 0.21
60 0.19
61 0.19
62 0.2
63 0.21
64 0.2
65 0.18
66 0.15
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.13
71 0.15
72 0.15
73 0.25
74 0.27
75 0.27
76 0.26
77 0.3
78 0.38
79 0.37
80 0.37
81 0.33
82 0.39
83 0.41
84 0.46
85 0.49
86 0.45
87 0.43
88 0.45
89 0.44
90 0.45
91 0.48
92 0.53
93 0.57
94 0.62
95 0.64
96 0.66
97 0.64
98 0.66
99 0.63
100 0.55
101 0.45
102 0.36
103 0.37
104 0.32
105 0.31
106 0.25
107 0.29
108 0.33
109 0.4
110 0.49
111 0.55
112 0.64
113 0.72
114 0.8
115 0.83
116 0.85
117 0.87
118 0.88
119 0.88
120 0.86
121 0.86
122 0.85
123 0.84
124 0.84
125 0.76
126 0.67
127 0.58
128 0.54
129 0.46
130 0.45
131 0.44
132 0.42
133 0.44
134 0.49
135 0.51
136 0.52
137 0.51
138 0.46
139 0.4
140 0.41
141 0.41
142 0.35
143 0.35
144 0.31
145 0.29
146 0.25
147 0.23
148 0.15
149 0.11
150 0.09
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.1
162 0.13
163 0.17
164 0.22
165 0.25
166 0.3
167 0.31
168 0.34
169 0.36
170 0.34
171 0.35
172 0.33
173 0.34
174 0.34
175 0.36
176 0.36
177 0.38
178 0.41
179 0.44
180 0.49
181 0.54
182 0.57
183 0.65
184 0.71
185 0.72
186 0.76
187 0.72
188 0.66
189 0.61
190 0.56
191 0.54
192 0.55
193 0.56
194 0.59
195 0.66
196 0.74
197 0.8
198 0.89
199 0.91
200 0.93
201 0.92
202 0.92
203 0.92
204 0.88
205 0.88
206 0.82
207 0.78
208 0.71
209 0.69
210 0.64
211 0.57
212 0.53
213 0.48
214 0.49
215 0.44
216 0.4
217 0.32
218 0.26
219 0.24
220 0.23
221 0.17
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.14
226 0.14
227 0.13
228 0.12
229 0.15
230 0.14
231 0.15
232 0.15
233 0.16
234 0.19
235 0.21
236 0.22
237 0.25
238 0.28
239 0.28
240 0.33
241 0.36
242 0.36
243 0.35
244 0.39
245 0.34
246 0.31
247 0.3
248 0.28
249 0.25
250 0.23
251 0.21
252 0.17
253 0.17
254 0.16
255 0.15
256 0.12
257 0.11
258 0.16
259 0.19
260 0.2
261 0.25
262 0.29
263 0.34
264 0.4
265 0.49
266 0.49
267 0.52
268 0.57
269 0.55
270 0.56
271 0.52
272 0.46
273 0.37
274 0.32
275 0.28
276 0.21
277 0.18
278 0.13
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.09
304 0.1
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.12
309 0.13
310 0.22
311 0.21
312 0.21
313 0.2
314 0.28
315 0.34
316 0.37
317 0.42
318 0.39
319 0.43
320 0.48
321 0.52
322 0.54
323 0.58
324 0.6
325 0.59
326 0.58
327 0.55
328 0.51
329 0.48
330 0.38
331 0.29
332 0.23
333 0.17
334 0.14
335 0.12
336 0.08
337 0.08
338 0.07
339 0.06
340 0.06
341 0.08
342 0.08
343 0.09
344 0.14
345 0.15
346 0.16
347 0.2
348 0.23
349 0.24
350 0.28
351 0.32
352 0.29
353 0.29
354 0.29
355 0.25
356 0.23
357 0.2
358 0.15
359 0.1
360 0.1
361 0.08
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.09
367 0.09
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.09
375 0.1
376 0.1
377 0.12
378 0.12
379 0.12
380 0.11
381 0.14
382 0.19
383 0.22
384 0.26
385 0.26
386 0.28
387 0.29
388 0.36
389 0.43
390 0.44
391 0.45
392 0.5
393 0.57
394 0.61
395 0.61
396 0.58
397 0.5
398 0.45
399 0.39
400 0.3
401 0.21
402 0.16
403 0.18
404 0.15
405 0.17
406 0.17
407 0.19
408 0.19
409 0.19
410 0.19
411 0.18
412 0.19
413 0.18
414 0.21
415 0.21
416 0.23
417 0.24
418 0.23
419 0.21
420 0.19
421 0.17
422 0.15
423 0.12
424 0.1
425 0.1
426 0.1
427 0.1
428 0.09
429 0.09
430 0.08
431 0.07
432 0.06
433 0.05
434 0.05
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.05
443 0.06
444 0.06
445 0.07
446 0.09
447 0.09