Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GCK0

Protein Details
Accession C1GCK0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-30MPKATRGKREISKQERRVRRGLKRVAARLAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-38TRGKREISKQERRVRRGLKRVAARLAALREAKRH
507-519KRTGKRKGKGRGS
Subcellular Location(s) mito 12, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
KEGG pbn:PADG_04722  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MPKATRGKREISKQERRVRRGLKRVAARLAALREAKRHPVPSGANSNGSSPSLSRVSEGVKAKPGRGAMGVVLGKRERDGDDEEEKYREEMKETEDNGSSAHRAKRARVDTNPGVIGRNLSQEHGADVNRLLHNRETAEIGSSATLVTTNGSSKGLHSTPVKNGLLAGPTEYATDDDASPSSHRKAPRSPYGLTPGISPYLDFPFPTPEQCEEANTLLSTVHGEVKMPAAIPAPSLTISGCGEVPSVLDALIRTLLSGATSSNNAALALQGLVSRFGVLHDGVGEGSVDWDKVRQATLEEVYDAMKAGGLGRVKSRYIKRILDMVHEEGVARRNAMGMGGDVYQEGDGNGHEHILSLNHLHTLSKDEAMLEFTKYPGIGVKTAACVILFCLRQPCFAVDTHVVRLCKWLGWLPEEKHGANEEEKAEKGNGLGGQNKMRKPRDVVRVNEITAFRHLDAKVPDHLKYSLHQLFVMHGKSCARCRANTGIGGREDVGPGEEGCVIEHLVKRTGKRKGKGRGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.89
3 0.87
4 0.87
5 0.86
6 0.86
7 0.85
8 0.85
9 0.84
10 0.83
11 0.83
12 0.8
13 0.72
14 0.64
15 0.59
16 0.53
17 0.5
18 0.46
19 0.41
20 0.4
21 0.42
22 0.47
23 0.48
24 0.48
25 0.43
26 0.46
27 0.49
28 0.5
29 0.55
30 0.5
31 0.49
32 0.46
33 0.46
34 0.39
35 0.35
36 0.28
37 0.2
38 0.21
39 0.2
40 0.19
41 0.18
42 0.19
43 0.21
44 0.27
45 0.3
46 0.29
47 0.34
48 0.36
49 0.36
50 0.38
51 0.36
52 0.31
53 0.29
54 0.27
55 0.18
56 0.23
57 0.24
58 0.21
59 0.24
60 0.23
61 0.22
62 0.21
63 0.23
64 0.17
65 0.19
66 0.23
67 0.25
68 0.31
69 0.34
70 0.35
71 0.34
72 0.34
73 0.31
74 0.3
75 0.25
76 0.22
77 0.2
78 0.24
79 0.3
80 0.31
81 0.33
82 0.3
83 0.3
84 0.27
85 0.27
86 0.24
87 0.22
88 0.24
89 0.26
90 0.28
91 0.32
92 0.41
93 0.47
94 0.53
95 0.52
96 0.57
97 0.56
98 0.58
99 0.56
100 0.47
101 0.4
102 0.33
103 0.3
104 0.22
105 0.23
106 0.19
107 0.17
108 0.18
109 0.17
110 0.18
111 0.19
112 0.18
113 0.14
114 0.14
115 0.19
116 0.2
117 0.21
118 0.21
119 0.2
120 0.22
121 0.22
122 0.21
123 0.18
124 0.16
125 0.17
126 0.15
127 0.14
128 0.11
129 0.1
130 0.09
131 0.07
132 0.07
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.07
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.15
142 0.15
143 0.18
144 0.21
145 0.24
146 0.27
147 0.35
148 0.34
149 0.29
150 0.29
151 0.26
152 0.23
153 0.19
154 0.17
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.09
160 0.08
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.1
167 0.13
168 0.15
169 0.18
170 0.21
171 0.25
172 0.33
173 0.39
174 0.47
175 0.49
176 0.48
177 0.48
178 0.52
179 0.49
180 0.42
181 0.35
182 0.27
183 0.23
184 0.21
185 0.17
186 0.12
187 0.13
188 0.13
189 0.12
190 0.11
191 0.15
192 0.16
193 0.17
194 0.18
195 0.17
196 0.19
197 0.2
198 0.2
199 0.17
200 0.17
201 0.16
202 0.14
203 0.12
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.07
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.05
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.03
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.09
284 0.11
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.07
296 0.08
297 0.09
298 0.11
299 0.13
300 0.14
301 0.21
302 0.25
303 0.29
304 0.34
305 0.36
306 0.35
307 0.39
308 0.39
309 0.37
310 0.37
311 0.32
312 0.27
313 0.24
314 0.22
315 0.18
316 0.2
317 0.15
318 0.12
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.05
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.13
350 0.14
351 0.13
352 0.13
353 0.12
354 0.13
355 0.16
356 0.16
357 0.13
358 0.12
359 0.11
360 0.12
361 0.11
362 0.11
363 0.12
364 0.13
365 0.12
366 0.13
367 0.14
368 0.15
369 0.16
370 0.16
371 0.12
372 0.1
373 0.11
374 0.15
375 0.14
376 0.14
377 0.2
378 0.2
379 0.21
380 0.23
381 0.23
382 0.2
383 0.2
384 0.24
385 0.22
386 0.25
387 0.28
388 0.31
389 0.29
390 0.27
391 0.3
392 0.26
393 0.22
394 0.21
395 0.21
396 0.2
397 0.24
398 0.32
399 0.3
400 0.37
401 0.4
402 0.38
403 0.35
404 0.35
405 0.33
406 0.27
407 0.29
408 0.24
409 0.23
410 0.23
411 0.23
412 0.22
413 0.19
414 0.17
415 0.17
416 0.17
417 0.17
418 0.22
419 0.23
420 0.31
421 0.38
422 0.42
423 0.48
424 0.49
425 0.51
426 0.54
427 0.59
428 0.61
429 0.63
430 0.64
431 0.63
432 0.64
433 0.6
434 0.58
435 0.5
436 0.42
437 0.37
438 0.35
439 0.27
440 0.27
441 0.26
442 0.27
443 0.29
444 0.3
445 0.35
446 0.35
447 0.35
448 0.33
449 0.35
450 0.31
451 0.29
452 0.35
453 0.32
454 0.3
455 0.29
456 0.26
457 0.28
458 0.33
459 0.34
460 0.25
461 0.23
462 0.27
463 0.31
464 0.36
465 0.42
466 0.4
467 0.38
468 0.44
469 0.5
470 0.51
471 0.52
472 0.51
473 0.48
474 0.45
475 0.46
476 0.41
477 0.33
478 0.28
479 0.22
480 0.19
481 0.14
482 0.13
483 0.12
484 0.12
485 0.11
486 0.11
487 0.12
488 0.11
489 0.14
490 0.18
491 0.19
492 0.25
493 0.29
494 0.36
495 0.43
496 0.53
497 0.59
498 0.64
499 0.71