Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GM33

Protein Details
Accession C1GM33    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
299-330TLARLGKGHKHKPKWQTKNKNKHNNSKNVEQDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
254-263RKAREAAEKR
304-320GKGHKHKPKWQTKNKNK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
IPR003169  GYF  
IPR035445  GYF-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
KEGG pbn:PADG_08424  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02213  GYF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50829  GYF  
Amino Acid Sequences MATSIPGRSKRAGEDFARTHHIEADSDSVGPSSLKKPRFDLRNPSALAADALEEDAVLDADEIGHRGQRVRRNAVNIEGYDSDSENEGFDARAESRARAEKRNSAGNPDDMFAELEDDFASYKGDDATTTGTKKQVRFLRDDEIEGQVDNSHAGGTVSIDLDTVGKGKEAERDEDGESESEVDEQERAAIAPDMDKELGAGGKKTHVPLLDAFNMRAEQEEGRFDEAGNFVRKAVDPDDIYDTWLEGVSKKDMRKAREAAEKREEERRKVQLEQDNLLTADILGTLIKKMERGETILETLARLGKGHKHKPKWQTKNKNKHNNSKNVEQDERMGEDPAEAARKRAIEDITGAADVLLSRGQTEIYDAERELLMRLYKRETGEDWVDPNPTVESKWESTVGEMDTPPLWEYRWSDSRDGGEPHGPYEASMMQSWNAAGYFGEGVEFRKVGSVDSWTSVADFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.51
3 0.52
4 0.55
5 0.49
6 0.43
7 0.4
8 0.38
9 0.3
10 0.28
11 0.28
12 0.22
13 0.21
14 0.2
15 0.15
16 0.14
17 0.14
18 0.15
19 0.18
20 0.25
21 0.3
22 0.33
23 0.39
24 0.47
25 0.56
26 0.61
27 0.65
28 0.64
29 0.68
30 0.66
31 0.61
32 0.53
33 0.44
34 0.37
35 0.26
36 0.19
37 0.11
38 0.09
39 0.08
40 0.07
41 0.06
42 0.06
43 0.05
44 0.04
45 0.04
46 0.04
47 0.04
48 0.05
49 0.06
50 0.06
51 0.08
52 0.09
53 0.14
54 0.21
55 0.29
56 0.37
57 0.44
58 0.49
59 0.54
60 0.56
61 0.57
62 0.56
63 0.49
64 0.44
65 0.37
66 0.34
67 0.28
68 0.25
69 0.2
70 0.15
71 0.15
72 0.11
73 0.1
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.1
78 0.09
79 0.15
80 0.15
81 0.16
82 0.21
83 0.3
84 0.33
85 0.39
86 0.43
87 0.46
88 0.49
89 0.57
90 0.53
91 0.51
92 0.51
93 0.48
94 0.44
95 0.37
96 0.33
97 0.25
98 0.24
99 0.17
100 0.15
101 0.09
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.12
115 0.14
116 0.16
117 0.18
118 0.23
119 0.27
120 0.29
121 0.35
122 0.37
123 0.37
124 0.41
125 0.43
126 0.45
127 0.42
128 0.43
129 0.37
130 0.34
131 0.3
132 0.25
133 0.21
134 0.13
135 0.12
136 0.1
137 0.08
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.07
155 0.13
156 0.15
157 0.17
158 0.18
159 0.21
160 0.21
161 0.22
162 0.22
163 0.16
164 0.14
165 0.12
166 0.1
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.06
189 0.09
190 0.1
191 0.11
192 0.13
193 0.12
194 0.13
195 0.14
196 0.18
197 0.21
198 0.21
199 0.2
200 0.19
201 0.19
202 0.17
203 0.15
204 0.12
205 0.08
206 0.08
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.13
215 0.14
216 0.13
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.12
224 0.13
225 0.18
226 0.17
227 0.17
228 0.15
229 0.13
230 0.11
231 0.11
232 0.09
233 0.06
234 0.07
235 0.1
236 0.14
237 0.15
238 0.21
239 0.26
240 0.29
241 0.35
242 0.37
243 0.4
244 0.46
245 0.5
246 0.5
247 0.54
248 0.53
249 0.48
250 0.55
251 0.52
252 0.46
253 0.5
254 0.49
255 0.44
256 0.44
257 0.49
258 0.45
259 0.46
260 0.43
261 0.37
262 0.31
263 0.28
264 0.25
265 0.18
266 0.11
267 0.07
268 0.05
269 0.04
270 0.03
271 0.03
272 0.04
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.07
277 0.1
278 0.11
279 0.13
280 0.15
281 0.15
282 0.16
283 0.16
284 0.15
285 0.13
286 0.12
287 0.12
288 0.1
289 0.09
290 0.09
291 0.16
292 0.25
293 0.35
294 0.44
295 0.5
296 0.58
297 0.69
298 0.78
299 0.82
300 0.84
301 0.86
302 0.87
303 0.91
304 0.94
305 0.94
306 0.92
307 0.91
308 0.9
309 0.89
310 0.84
311 0.81
312 0.78
313 0.74
314 0.68
315 0.58
316 0.52
317 0.43
318 0.41
319 0.33
320 0.25
321 0.18
322 0.16
323 0.15
324 0.13
325 0.16
326 0.14
327 0.14
328 0.16
329 0.17
330 0.18
331 0.21
332 0.21
333 0.16
334 0.18
335 0.19
336 0.18
337 0.17
338 0.15
339 0.11
340 0.1
341 0.09
342 0.07
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.06
349 0.08
350 0.09
351 0.1
352 0.12
353 0.12
354 0.13
355 0.13
356 0.14
357 0.13
358 0.14
359 0.15
360 0.16
361 0.18
362 0.21
363 0.25
364 0.27
365 0.29
366 0.29
367 0.31
368 0.33
369 0.33
370 0.32
371 0.3
372 0.3
373 0.27
374 0.26
375 0.21
376 0.17
377 0.15
378 0.16
379 0.19
380 0.2
381 0.22
382 0.23
383 0.21
384 0.22
385 0.24
386 0.23
387 0.2
388 0.18
389 0.17
390 0.16
391 0.17
392 0.16
393 0.14
394 0.13
395 0.14
396 0.18
397 0.24
398 0.31
399 0.34
400 0.36
401 0.39
402 0.42
403 0.43
404 0.43
405 0.39
406 0.37
407 0.33
408 0.32
409 0.31
410 0.27
411 0.22
412 0.22
413 0.21
414 0.17
415 0.18
416 0.18
417 0.16
418 0.17
419 0.17
420 0.14
421 0.12
422 0.1
423 0.08
424 0.09
425 0.09
426 0.08
427 0.09
428 0.09
429 0.11
430 0.14
431 0.14
432 0.12
433 0.16
434 0.16
435 0.16
436 0.18
437 0.21
438 0.2
439 0.23
440 0.24
441 0.2