Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3BBJ0

Protein Details
Accession A0A1E3BBJ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-36HDIPQKTRPKHLPPRPERLKRRDIABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-33KTRPKHLPPRPERLKRR
Subcellular Location(s) nucl 10mito 10mito_nucl 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR000477  RT_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF00078  RVT_1  
CDD cd01647  RT_LTR  
Amino Acid Sequences MPMRPAKIRALHDIPQKTRPKHLPPRPERLKRRDIAAVSMSACCAYARRSYRLFTVTVDDIEAALNPVPDEEDPMAKLPPEFQDFADVFSPKEAERLPPHRPYDHDIKLQDGKVPPFGPLYPMSREELKALKEWIEENLKKGFIRPSSSPAASPVLFVKKPGGGLRFCVDYRALNAITVKDRYPLPLTKETLNNLKGMKYFTKIDIISAFNNLRIKKGLEYLTAFPIYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.63
3 0.68
4 0.63
5 0.66
6 0.68
7 0.7
8 0.72
9 0.78
10 0.79
11 0.78
12 0.86
13 0.88
14 0.89
15 0.89
16 0.87
17 0.87
18 0.79
19 0.76
20 0.73
21 0.64
22 0.59
23 0.51
24 0.44
25 0.36
26 0.33
27 0.27
28 0.19
29 0.18
30 0.12
31 0.1
32 0.1
33 0.17
34 0.22
35 0.27
36 0.3
37 0.31
38 0.36
39 0.37
40 0.35
41 0.29
42 0.29
43 0.25
44 0.22
45 0.21
46 0.16
47 0.14
48 0.13
49 0.11
50 0.07
51 0.06
52 0.06
53 0.05
54 0.05
55 0.06
56 0.06
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.12
63 0.11
64 0.11
65 0.1
66 0.13
67 0.15
68 0.15
69 0.14
70 0.2
71 0.2
72 0.22
73 0.22
74 0.19
75 0.16
76 0.15
77 0.16
78 0.1
79 0.12
80 0.1
81 0.12
82 0.18
83 0.24
84 0.29
85 0.35
86 0.38
87 0.38
88 0.4
89 0.4
90 0.43
91 0.41
92 0.41
93 0.34
94 0.35
95 0.36
96 0.34
97 0.33
98 0.27
99 0.23
100 0.21
101 0.21
102 0.18
103 0.15
104 0.15
105 0.14
106 0.14
107 0.16
108 0.16
109 0.17
110 0.18
111 0.18
112 0.19
113 0.18
114 0.19
115 0.18
116 0.17
117 0.16
118 0.15
119 0.15
120 0.15
121 0.16
122 0.22
123 0.21
124 0.22
125 0.23
126 0.24
127 0.23
128 0.24
129 0.26
130 0.2
131 0.25
132 0.24
133 0.27
134 0.31
135 0.32
136 0.3
137 0.27
138 0.28
139 0.23
140 0.22
141 0.2
142 0.21
143 0.2
144 0.2
145 0.2
146 0.18
147 0.2
148 0.23
149 0.23
150 0.19
151 0.21
152 0.23
153 0.25
154 0.24
155 0.23
156 0.2
157 0.17
158 0.19
159 0.21
160 0.19
161 0.16
162 0.18
163 0.18
164 0.21
165 0.22
166 0.2
167 0.18
168 0.18
169 0.2
170 0.24
171 0.26
172 0.3
173 0.35
174 0.38
175 0.4
176 0.44
177 0.44
178 0.47
179 0.44
180 0.4
181 0.34
182 0.34
183 0.31
184 0.32
185 0.3
186 0.27
187 0.28
188 0.27
189 0.33
190 0.3
191 0.31
192 0.3
193 0.29
194 0.27
195 0.29
196 0.28
197 0.26
198 0.31
199 0.29
200 0.28
201 0.28
202 0.3
203 0.27
204 0.33
205 0.32
206 0.32
207 0.36
208 0.36
209 0.39