Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GN78

Protein Details
Accession C1GN78    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
126-153IRMSQRPKKEVPEKKPRGAKARKAAEESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
128-149MSQRPKKEVPEKKPRGAKARKA
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029004  L28e/Mak16  
IPR002672  Ribosomal_L28e  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG pbn:PADG_08715  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01778  Ribosomal_L28e  
Amino Acid Sequences MSYVGKSNVSDDLVWEITRSQNSFLVKCAGAQFSRDPLNLVNKHSRKYAGFVNCKAIGIQPTEEGTIAVTTKKPATIHKPASSTTTNTYSSTATNRKIYKGIANTAAKSGYRADLRAEAVGRASAIRMSQRPKKEVPEKKPRGAKARKAAEESS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.16
4 0.17
5 0.21
6 0.21
7 0.19
8 0.21
9 0.25
10 0.25
11 0.26
12 0.26
13 0.23
14 0.23
15 0.24
16 0.23
17 0.2
18 0.22
19 0.21
20 0.21
21 0.25
22 0.23
23 0.21
24 0.21
25 0.3
26 0.3
27 0.33
28 0.39
29 0.39
30 0.41
31 0.42
32 0.43
33 0.34
34 0.35
35 0.38
36 0.37
37 0.4
38 0.4
39 0.43
40 0.41
41 0.4
42 0.37
43 0.3
44 0.23
45 0.18
46 0.17
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.1
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.07
59 0.09
60 0.1
61 0.13
62 0.2
63 0.28
64 0.33
65 0.35
66 0.37
67 0.36
68 0.39
69 0.37
70 0.32
71 0.27
72 0.25
73 0.23
74 0.22
75 0.23
76 0.19
77 0.18
78 0.22
79 0.23
80 0.23
81 0.27
82 0.28
83 0.29
84 0.3
85 0.3
86 0.31
87 0.3
88 0.3
89 0.32
90 0.33
91 0.32
92 0.31
93 0.31
94 0.25
95 0.22
96 0.2
97 0.16
98 0.16
99 0.16
100 0.17
101 0.18
102 0.2
103 0.21
104 0.2
105 0.16
106 0.15
107 0.15
108 0.13
109 0.1
110 0.09
111 0.08
112 0.09
113 0.13
114 0.18
115 0.25
116 0.33
117 0.4
118 0.45
119 0.49
120 0.57
121 0.63
122 0.69
123 0.72
124 0.75
125 0.77
126 0.81
127 0.85
128 0.83
129 0.83
130 0.83
131 0.83
132 0.82
133 0.83
134 0.8