Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3BEM7

Protein Details
Accession A0A1E3BEM7    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
218-240IKGKEDKSSKGPKQRKEKNYLDVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-47KPAPRLGKRDAPKE
222-234EDKSSKGPKQRKE
249-282RSSGERGGPRGRGGRGGRGSGRGGRGNGPRAGGE
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MAEIRSKNVYELLGNDPELDPNRAPEPPTKALDKPAPRLGKRDAPKEAPSQPRENTGRRGQRFQGNEAAYRDRNAGRRNNVDRPVDEANNPDRRGFNARDNRGGRSRNDRQNRSGVTDSRKQINQGWGGQSGDKEFDDEKAGQKIAQTDENEPQTPAAEEPEEPADKAKSFADYLAEKAAAGDLSAKPVRAANEGTKPDGKWAQAKEFKRGEDEEEYIKGKEDKSSKGPKQRKEKNYLDVDLRFVEPPRSSGERGGPRGRGGRGGRGSGRGGRGNGPRAGGERAGAAPVTVDEKNFPSLGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.22
4 0.25
5 0.26
6 0.27
7 0.22
8 0.22
9 0.25
10 0.25
11 0.28
12 0.3
13 0.35
14 0.36
15 0.4
16 0.41
17 0.41
18 0.46
19 0.53
20 0.53
21 0.52
22 0.55
23 0.61
24 0.57
25 0.61
26 0.6
27 0.61
28 0.61
29 0.63
30 0.61
31 0.58
32 0.61
33 0.62
34 0.64
35 0.64
36 0.63
37 0.62
38 0.56
39 0.59
40 0.6
41 0.58
42 0.57
43 0.57
44 0.62
45 0.6
46 0.64
47 0.6
48 0.62
49 0.6
50 0.57
51 0.56
52 0.48
53 0.47
54 0.44
55 0.45
56 0.38
57 0.35
58 0.35
59 0.3
60 0.34
61 0.37
62 0.41
63 0.42
64 0.51
65 0.57
66 0.61
67 0.64
68 0.61
69 0.55
70 0.53
71 0.51
72 0.43
73 0.37
74 0.34
75 0.34
76 0.38
77 0.38
78 0.34
79 0.3
80 0.31
81 0.36
82 0.35
83 0.38
84 0.4
85 0.43
86 0.5
87 0.51
88 0.53
89 0.53
90 0.53
91 0.47
92 0.47
93 0.53
94 0.54
95 0.62
96 0.62
97 0.6
98 0.64
99 0.62
100 0.58
101 0.53
102 0.48
103 0.44
104 0.46
105 0.45
106 0.42
107 0.41
108 0.37
109 0.37
110 0.38
111 0.36
112 0.31
113 0.31
114 0.27
115 0.27
116 0.26
117 0.21
118 0.16
119 0.14
120 0.11
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.11
125 0.12
126 0.13
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.13
131 0.15
132 0.14
133 0.17
134 0.17
135 0.17
136 0.21
137 0.23
138 0.22
139 0.2
140 0.18
141 0.15
142 0.13
143 0.11
144 0.08
145 0.07
146 0.06
147 0.08
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.12
155 0.11
156 0.09
157 0.1
158 0.1
159 0.12
160 0.11
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.06
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.13
176 0.15
177 0.15
178 0.17
179 0.17
180 0.24
181 0.26
182 0.29
183 0.29
184 0.28
185 0.3
186 0.3
187 0.27
188 0.26
189 0.27
190 0.34
191 0.39
192 0.41
193 0.46
194 0.47
195 0.46
196 0.44
197 0.42
198 0.38
199 0.34
200 0.34
201 0.28
202 0.27
203 0.28
204 0.24
205 0.24
206 0.22
207 0.18
208 0.22
209 0.23
210 0.26
211 0.33
212 0.43
213 0.49
214 0.58
215 0.66
216 0.69
217 0.76
218 0.82
219 0.82
220 0.81
221 0.81
222 0.8
223 0.79
224 0.74
225 0.69
226 0.6
227 0.53
228 0.45
229 0.39
230 0.31
231 0.25
232 0.25
233 0.2
234 0.2
235 0.24
236 0.26
237 0.26
238 0.29
239 0.37
240 0.41
241 0.47
242 0.51
243 0.48
244 0.47
245 0.51
246 0.49
247 0.48
248 0.43
249 0.45
250 0.44
251 0.47
252 0.45
253 0.43
254 0.45
255 0.42
256 0.44
257 0.39
258 0.37
259 0.39
260 0.43
261 0.45
262 0.43
263 0.4
264 0.37
265 0.35
266 0.37
267 0.3
268 0.24
269 0.21
270 0.19
271 0.19
272 0.17
273 0.13
274 0.1
275 0.11
276 0.14
277 0.12
278 0.13
279 0.14
280 0.17
281 0.2